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질문 cloning용 insert pcr primer design 질문합니다.
개구리매미매미  | 2015.07.03 18:54
primer를 다시 design하는 편이 낫나요?

Tm값은 비슷하구요 길이도 22mer로 같습니다.

다만

3' 말단이 T로 끝나는 forward와  AA로 끝나는 reverse 가 걸리는데
pcr 하는데 지장은 없나요?
#primer design
 
#primer
 
#sub cloning
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리안재진  |  2015.07.03   
죄송합니다.
제가 몇번씩 읽어 보았는데 제가 잘 이해를 못해서 조금만 자세히 질문을 해주시겠어요?
개구리매미매미  |  2015.07.04   

전임자가 주문해놓고간 primer가있는데요

foward ,reverse 각각 살펴본결과
GC 40% 정도입니다 한 가지 꺼림직한게 f는 T로 끝나는 3말단을
Reverse는 AA로 끝나는 말단이라 이거때매 pcr이 잘 안되나 해서요

질문을 너무 두서없이 해서 죄송합니다 ㅜ

개구리ExDown's  |  2015.07.04   
primer말단에 G나 C가 오면 좋다는 내용을 보고 질문하신것 같습니다.

이상적인건 말단에 G,C가 오는경우지만 A,T가 와도 무방합니다.

Tm, GC%, dimer체크가 더 중요한경우가 많고 pcr의 경우 primer가 좋아도

잘안되는 경우가 허다하기때문에 직접 해보기전까진 모릅니다,
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