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CAP (contig assembly program)이 적당할 듯 합니다.
시퀀싱 데이터와 사용하는 경우라면 역시 오픈소스인 BioEdit에 내장된 것을 사용하세요.
님의 경우라면,
1. 새파일 생성
2. import -> import sequence alignment files (*.abi 파일을 불러오면 chromatogram을 보면서 문제를 보정할 수 있는 장점이 있습니다.)
3. 양방향 read를 선택한 후, accessory applications->CAP
4. 실행창에서 "Show"가 나오면 "엔터"
5. merge가 된 부분을 슬라이딩해서 오류를 수작업으로 보정합니다.
6. 보정된 서열은 새로운 이름을 붙여서 저장합니다. (Ctrl+F8 copy, +F9 paste).