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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 1374  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 forward and backward sequence merging 프로그램
알COX  | 2015.05.26 14:47
정방향, 반대방향 생거로 시퀀싱한거 트리밍한후 한쪽방향을 Reverse and Complement해서 서로 합치는 중인데 손으로 할려니 너무 많습니다.

무료이고 바로 받을 수 있는 프로그램 없을까요?

간단하게 프로그램 코드 짤까 하다가도 어디엔가 어느 천사같은 분이 분명히 만드셨을거 같은데 ㅎㅎ
#Sequencing
 
#무료
 
#프로그램
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
꽃개구리느림보  |  2015.05.26   
CAP (contig assembly program)이 적당할 듯 합니다.
시퀀싱 데이터와 사용하는 경우라면 역시 오픈소스인 BioEdit에 내장된 것을 사용하세요.

님의 경우라면,

1. 새파일 생성
2. import -> import sequence alignment files (*.abi 파일을 불러오면 chromatogram을 보면서 문제를 보정할 수 있는 장점이 있습니다.)
3. 양방향 read를 선택한 후, accessory applications->CAP
4. 실행창에서 "Show"가 나오면 "엔터"
5. merge가 된 부분을 슬라이딩해서 오류를 수작업으로 보정합니다.
6. 보정된 서열은 새로운 이름을 붙여서 저장합니다. (Ctrl+F8 copy, +F9 paste).
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