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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
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질문 혹시 MUMmer 이용해서 alignment 하시는 분들 계신가요?
dooit  | 2015.02.13 16:32

두 유전자의 full sequence와 gene을 비교해보려고 합니다.
alignment의 도구로 blast랑 MUMmer를 생각하고 있는데,
blastn 을 통해서는 full시퀀스 이다보니까 너무 커서 그런지 잘 되지 않습니다 ㅠㅠ

그래서 MUMmer를 써볼까하는데... 논문도 별로 없고 해서 혹시 쓰시는 분들 있으신가요?
제 연구와 잘 맞는 프로그램인지도 걱정스럽네요 ㅠㅠ
그리고 그냥 해보니까 파란점과 빨간점이 나오는데, 이 점들이 시퀀스에서 가장 비슷한 부분이 나오는 건가요?

도와주세요 ㅠㅠ

#MUMmer
 
#full sequence
 
#blast
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