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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
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질문 전체 염기서열을 비교해볼수있는 프로그램은 뭐가 있나요???처음 실험하는 학생입니다ㅠㅠ도와주세요ㅠㅠㅠ
3333  |  2015.01.31 09:36
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
안녕하세요. 이제 실험을 처음 시작하는 학생입니다.ㅜㅜ
저희 연구분야가 이쪽이 아닌데 제가 처음 실험을 시작하는거라..
여쭤볼곳이 없는데 너무 답답해서 글을 올립니다.ㅜㅜ


여러 균들의 전체 염기서열을 쭉두고
공통적인 부분을 빼버리고 각 균주 혼자만 가지고 있는 염기서열을 찾으려고 합니다.


찾아보니 clustal , bioedit 등을 통해 alignment해서 비교할수있는것 같긴한데...

특정 균만 가지고있는 염기서열부분은 무수히 많겠지만
특정 사이즈 이상 부분만을 찾아내면 됩니다.

그냥 생각해보면 염기서열 쭉 병렬로 띄워두고 공통된부분과 다른부분이 
표시되는 그런 프러그램도 있을것같은데..
가능한 프로그램이있을까요???
도와주시면 감사하겠습니다ㅜㅜㅜㅜ

많이 부족해서 읽을만한 참고자료도 괜찮구요ㅠㅜ
저렇게하늠 프로그램이 없다면

좀 돌아서라도 가는 방법이 있을까요?ㅜㅜ







#염기서열
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
저도 전공은 아닙니다.
지극히 사견을 적어 봅니다.
NGS와 같은 full 시퀀싱을 대행하셔서 진행하셨거나 랩에 장비가 있어 진행하셨다면...
대행업체와 시퀀스 기계 업체에 연락해 학술 지원을 받아 보면 어떨까요?
특히 대업업체를 통해 얻은 결과라면 사용하기 편한 프로그램을 추천이 가능할것 같습니다.
대왕개구리안재진  |  2015.02.02   
https://www.genoscope.cns.fr/agc/website/spip.php?article754

위 사이트에 있는 내용을 한 번 읽어 보세요.
원하는 것이 specific sequence 인지 specific gene 을 의미하는지 잘 모르겠으나
특정 gene 을 찾고자 하는 것이라면 위의 내용이 도움이 될 것 같습니다.

읽어 보시면 어떤 keyword 로 software 를 검색해야 할지 감을 잡을 수 있을 것 같습니다.
굳럭


꽃개구리Kozmoj  |  2015.02.02   
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