실험 Q&A > Bioinformatics
Blast 결과해석 부탁드립니다.
산지니 (비회원)
블라스트 결과 아래와 같은 결과를 얻었습니다. 블라스트 수없이 많이 사용해봤는데 아래처럼 매치 되는 시퀀쓰가 하나도 안나온적이 없어서 약간 당황 스럽기도 하고 그러네요. 그냥 완전 새로운 미생물이라 생각해도 되는건지... 사실 한 2000개 시퀀쓰를 모으긴 했는데 그중에 한 30개 정도가 블라스트 결과 아래와 같이 나오거든요. NCBI홈페이지에 나와있는 가능성 (저런 결과가 나올 가능성)에 있는 것들에는 해당되지 않는듯 합니다. 혹시 이런 경우가 있으셨던 분들이나 어떻게 해석하면 좋을지 알려주실분들의 답변을 기다립니다. 감사합니다. Query= Length=961 No significant similarity found. For reasons why, click here. Database: All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences (but no EST, STS, GSS,environmental samples or phase 0, 1 or 2 HTGS sequences) Posted date: Oct 26, 2007 5:49 PM Number of letters in database: 552,366,894 Number of sequences in database: 6,019,919 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Matrix: blastn matrix:1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 0 Number of Sequences: 6019919 Number of Hits to DB: 1514580 Number of extensions: 0 Number of successful extensions: 0 Number of sequences better than 10: 0 Number of HSP''s better than 10 without gapping: 0 Number of HSP''s gapped: 0 Number of HSP''s successfully gapped: 0 Length of query: 961 Length of database: 22027203374 Length adjustment: 32 Effective length of query: 929 Effective length of database: 21834565966 Effective search space: 20284311782414 Effective search space used: 20284311782414 A: 0 X1: 15 (28.8 bits) X2: 32 (59.1 bits) X3: 54 (99.7 bits) S1: 15 (28.8 bits) S2: 22 (41.7 bits)
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