[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
연재지정자유공모모집
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 2232  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 Gene cloning후 sequencing분석에서 질문 드립니다.
알Carolinie  | 2014.12.02 18:25

현재 분자생물학 실험을 수강하고 있는 3학년 학부생입니다.
시퀀스를 모르는 미생물에서 유전자를 Hind3으로 digestion하여 얻은 2개의 fragment를 pUC18 vector에 넣어 transformation하였습니다. 이후 두 fragment에 대해 sequence를 받았는데요, blast결과 해석이 안되는 점이 생겨서 질문 남깁니다. (편의상 fragment를 각각 C1, C2라고 부르겠습니다.)

C1을 forward, reverse로 읽은 것 모두 Sphingomonas Wittichii라는 종이 나왔고, C2를 reverse로 읽은 것 또한 같은 종이 매칭되었습니다. 물론 E-value도 상당히 작은 편이었고요. 그런데 C2 forward의 경우, 전혀 다른 종인 Rhodococcus opacus라는 종이 매핑되었고, 매핑된 다른 30여개 종은 E-value가 5 이상으로 매우 커서 신뢰도가 떨어지는 결과를 얻었습니다.

한 유전자에서 나온 fragment인데 이런 상황이 발생하기도 하나요? 이러한 경우 결과 해석을 어떻게 해야하는지요.. 답변 부탁드립니다 :)

#sequencing
 
#blast
 
#analysis
답변하기
첫 댓글을 달아주세요.첫 답변을 달아주세요.
답변하기
할인행사 광고 검색광고
다온비에스 다온비에스
[DNAGenotek] Oragene Collection kit 무료샘플 사용해보세요!! (7.31까지)
다온비에스 다온비에스
[DNAGenotek] Omnigene·GUT Collection Kit 무료샘플 사용해보세요!! (7.31까지)
브래디 브래디
초저온라벨 등 실험실용 풀칼라프린터 (COVID-19 안전사인 지원) (8.30까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
[체험단 모집] 소모품이 필요 없는 Cell counter Celldrop! 체험단 모집합니다. (7.24까지)
마크로텍 마크로텍
마크로텍 Ezscope현미경 마이크로톰 특가판매 및 현미경대여 (9.30까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
[TECAN] Reading과 형광 Imaging을 하나의 장비로 한 번에!! [Multi-mode micr.. (8.31까지)
케이비티 케이비티
Mixer, Dry Bath, Heating Block, Thermo Shaker, Shaking Incub.. (7.10까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
COVID-19 진단 및 연구! TECAN과 함께하세요!! (9.30까지)
에펜도르프코리아 에펜도르프코리아
[에펜도르프코리아] Eppendorf 2020 상반기 프로모션 안내 : 실험실 필수품 피펫,원심분리기,PCR.. (8.8까지)
프리미엄 등록안내
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
3/6  좌우
66,50063,200
493,000
23,000
52,60050,000
739,000702,100
92,30087,700
773,000734,400
482,000
924,000
93,20088,600
6,000
370,000
109,000
139,000132,100
47,20044,900
468,000
17,000
79,50075,600
339,400322,500
136,000129,200
49,000
870,000
125,500119,300
482,000
최근등록   더보기 >
hplc 용출율 질문입니다.   07.04
고등학교 화학 실험 추천부탁드립니다   07.03
마늘에서 알리신만 추출하는 방법 알려주세요   07.03
HPLC기구에 관하여   07.03
감과 녹차에서 추출되는 탄닌   07.03
비타민c의 항산화 실험에서 요오드를 사용하는 이유   07.03
염기서열 비교 분석   07.03
cell count 고수님들 도와주세요...   07.03
NO radical griess assay   07.03
Ovalbumin 어떤걸 사야할까요!?!?!? 실험실 초보 문의드립니다 ㅠㅠㅠ   07.03
라이브셀인스트루먼트
제품평가
[비아이코퍼레이션]
e브릭몰(연구용 제품 온라인 구매 사이트)
비아이코퍼레이션
모집인원: 50명
모집기간: ~7/15까지
신청조건: BRIC 회원
평가자 혜택

- 참가자 전원 3만원 상품권 제공

제품평가자 모집중
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크