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질문 high frequency SNP
알nansabi  |  2014.11.14 00:34

SNP detection에 관심이 많은 학생입니다.
현재 여러 가지의 SNP genotyping 기법을 비교해보고 장단점을 알아보고 있는중인데
직접 특정 방법을 이용해 Genotyping을 해볼 예정입니다.
문제는 적절한 target gene을 찾아야되는데
가능하면 한국인에게서 흔히 볼수 있는, 즉 빈도수가 높으면서도, 진단적 의미가 있는
SNP였으면 좋겠습니다.
이런저런 곳을 찾아보다가 1000genome까지 들어가봤는데
(사이트 어찌 쓰는건지를 몰라서 ㅠㅠ)
전 특히나 A>T , T>A , G>C , C>G  이 네종류의 SNP gene을 찾고 있는데
(예를 들면 sickle cell anemia같은...이건 근데 울나라에선 빈도수가....ㅠ)
가능하면 missense 였으면 좋겠구요..nonsense도 괜찮습니다.

이런 SNP 한국인에게 빈도수 높은 gene 아시는분..
혹은 어디서 찾아봐야 될지 아시는분..

답변좀 달아주셔요..
감사합니다.

#SNP
 
#genotyping
 
#high frequency
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