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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
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질문 DNA sequending 결과에서 homology때문에 multipeak?(결과사진첨부)
알포포  | 2014.10.22 13:59
시퀀싱 결과가 multi-peak이라 왜 그런가 물어봤더니, 업체쪽에서 DNA homology 때문이라고 하는데요(결과 아래 그림과 같아요...) 이게 primer가 multi binding 했다는 말인지, DNA 자체에 어떤 문제가 있다라는 말인지 모르겠습니다. 혹시 peak만 보고 어떤 문제가 있는지 알 수 있는건가요?? 답변 부탁드릴께요 
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모두 원하시는 실험결과 나오시길 바랄께요 ~ !! ㅠ 그리고 저도.. 하아.. ㅠ

#sequecing
 
#dna
 
#mutipeak
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
뒷다리ㅇㅇ  |  2014.10.22   
프라이머가 해당 종의 게놈 내에서 호몰로지가 높은 유전자에 멀티 바인딩하거나 다른 종의 호몰로지가 높은 유전자에 바인딩하는 경우가 있을 것 같네요.
후자는 오염인 경우가 있을 것이고 전자는 intra-genomic variation 또는 whole genome duplication 등이 있을 것 같네요.
......  |  2014.10.22    
peak 만 보고서는 정확히 알기 애매하군요..

혹시 dna의 농도를 더 낮게해서 진행해보셨나요?

그리고, 만약 dna가 mitochondria의 경우라면 heteroplasmy 인듯합니다..

좀 많긴 하다만... 

저의 경우는 주로 mitochondria sequencing을 많이 했었는데...

가끔 한,두 peak가 저렇게 heteroplasmy가 나옵니다.

그런경우, dna의 농도를 낮춰서 진행하면 잘 해결이 되더군요.

도움이 되셨으면 좋겠네요.
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