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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
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질문 nucleotide blast 결과
초보초  |  2014.10.20 15:57
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
nucleotide blast 결과 range가 여러개 뜨면 어떤 상태인 건가요?
첫번째 길게 읽은 것에는 원하는 부분이 없고 (보고자 하는 부분은 뒤에 있음),
다음 range에 뜨는데 이 range는 짧습니다. 2~3개씩 range가 나오는데, 이렇게 되면 cloning이 어떤식으로 된건지 궁금합니다.

또한, 이상태로 다음단계를 진행해도 되는지 궁금합니다.
#blast
 
#nucleotide
 
#cloning
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
뒷다리oo  |  2014.10.21   
blast 원리가 local alignment 방식이기 때문에 여러 조각의 결과가 나타날 수 있습니다.
하지만 본인이 생각하시기에 query 염기서열과 유사한 유전자가 (동일 길이 이거나 혹은 더 긴) 이미 있음에도 불구하고 이러한 결과가 나온다면 실험이 제대로 된 것인지 검토해봐야겠죠.
드물게 chimera 염기서열이 발생할 수도 있습니다. 질문자분의 정보가 부족하여 어떤 상황인지 잘 감이 안오네요.
초보초  |  2014.10.24    
제가 cloning 유전자를 WT 유전자와 비교하기 위해 Blast 했을 때의 결과인데 여러개의 range가 뜨는게 예를 들면


range 1 : 원하는 유전자 서열 거의 끝까지 (가장김)
range 2 : range 1의 서열 끝 50개 nucleotide포함해서 원하는 유전자 끝까지 (짧음)
range 3 : 원하는 유전자 서열 끝부분 random 짧게


이런식으로 나옵니다. 보통 range 2에 enzyme site가 있어서 다음단계를 진행하기가 애매합니다....ㅠㅠ 어떻게 된걸까요
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