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질문 phylogenetic tree 그리기
ㅎㅎㅎ  | 2014.09.18 16:10
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
안녕하세요. 답변주시는 분들께 먼저 감사의 인사를 드립니다.
현재 실험실에서 바이러스 특정 유전자의 sequence를 서로 비교해 phylogenetic tree를 그린 후 서로 변이차를 보고자 하는 간단한 실험 중입니다.
실험과정은 간단하나 문제는 프로그램 사용이 익숙치 않아 중간에 멈춰있는 상태입니다.
현재 실험실에서는 MEGA 5를 사용하고 있습니다.
제가 궁금한점은
1. MEGA 프로그램 사용법을 단 하루라도 교육받고 싶은데 어디서 가능할까요?
2. 혹시 잘 알려진 다른 프로그램이 있을까요? 상세한 프로토콜이 있다면 부탁 좀 드리겠습니다.

도움주신다면 매우 감사하겠습니다.
#PCR
 
#phylogenetic tree
 
#sequencing
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
뒷다리  |  2014.09.18   
1. 그런 교육을 하는 곳이 있을지 모르겠습니다. 유튜브를 찾아보시면 혹시 동영상이라도 있을 듯 싶네요. 현재 6버젼도 나와있습니다. 에러가 좀 있다는 소문이 있지만.
2. 방에서 유료 프로그램 구입해서 쓰시는 게 없다면, bioedit라는 무료 프로그램도 있습니다. 선호하는 프로그램 사용하시면 되요.

계통수 분석에 mega는 잘 인용이 안됩니다. NJ정도 인용되죠. 
계통수에도 알고리즘이 많으니(Maximum likelihood, Bayesian inference, maximum parsimony) 얼마나 신빙성있는 결과를 도출하고 싶냐에 따라 프로그램이 바뀌겠네요.
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