실험 Q&A > Bioinformatics
Copy neutral LOH
유전체학 (비회원)
요즘 유전체학을 새롭게 공부하고 있는 중입니다.
SNP array data를 통해 CNV를 찾는 것을 실습하고 있는데요,
아래 그림 중에서 문제가 되는 부분이 Copy neutral LOH 부분입니다.
Copy neutral LOH라는 것이 제가 들은 아주 간단한 설명에 의하면 Copy 수는 그대로 2 copy인데 같은 allele이 두개 라던지 (maternal allele이 2개라던가..) 하는 상황을 이야기 한다는 것인데요..
근데 아래 그림에서 genotype 조합이 왜 AA, BB가 되냐는 것입니다...;ㅠ 같은 allele이 두개 있는 거니까 AA 또는 BB만 있어야 하는 거 아닌가요? 유전체학 쪽을 전공하지 않아서 이해가 잘 안되네요..ㅠ
LOH라는 현상은 논문을 보니 대강 이해가 되는데, Copy neutral LOH라는 현상은 강사님이 설명해 주신 예(위에 maternal allele 혹은 paternal allele만 2개) 말고 다른 예가 있는지 궁금합니다. 그리고 아래 그림의 data를 해석하는 정확한 방법을 설명해 주시면 감사하겠습니다. (저 data가 어떤 방식으로 나온건지.. 라던지.. copy neutral LOH의 경우 왜 AA 또는 BB 가 아니라 AA 그리고 BB가 되는 건지..)
또한 유전체학에 대해서 좀 더 쉽게 공부할 수 있는 자료를 추천해 주시면 감사하겠습니다.
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