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질문 DNA gel electrophoresis에 사용하는 loading dye에 대해...
luckyceo  | 2007.07.19 20:25
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
molecular clonig에 나와있는 loading dye의 조성은


bromophenol blue, xylene cyanol FF, sucrose 로 되어있습니다.


자일렌과 브로모페놀은 보이지않는 DNA 를 염색하여 어느정도 염색이 됬는지


알아보기 위한것이고 sucrose는 다당류로써 DNA의 density를 올려주어


loading buffer에 뜨지않고 well에 잘 가라앉도록 해주는 역할을 합니다.


여기서 질문


1. 어떻게 DNA보다 작은 다당류가 DNA의 density를 올려줄 수 있는지?


2. 전기영동을 시작하면 sucrose는 어떻게 되는지?

(DNA의 size구별에는 영향을 끼치지 않는걸로 알고있는데..왜그런지..)
#loading dye
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리강형련  |  2007.07.19   
sucrose는 DNA의 density 를 높이는게 아니라 DNA solution의 비중을 TBE 보다 높게 해주는겁니다.
비중이 높은 물질의 농도가 높으면 다른 용액속에서 가라앉자나요.
반대로 sucrose 대신 EtOH을 사용해보세요.
EtOH은 물보다 비중이 낮아서 아무리 고농도로 사용해도 TBE나 물 위에 뜹니다.

전기영동은 전하를 띤 물질을 이동시키는 방법입니다.
sucrose는 전하를 띠지 않으므로 DNA 이동에는 영향을 미치지 않습니다.
그럼 어디로 가냐구요?
well에서 DNA가 빠져나가는 동안 주위로 diffusion되서 사라지지요.
개구리병리초보  |  2007.07.21   
질문내용과 상관없지만 내용중 제가 아는 것과 다른 것이 있어서~~~

BPB 와 Xylene cyanol FF는 DNA를 염색하지 않는 것으로 알고 있습니다.

단지 이것을 함께 달려줌으로써 내가 원하는 샘플이 젤 상에서 어느정도 내려왔는지 눈으로 보기 편하게 해주려고 넣는 것으로 알고 있습니다.

아닌가요?^^
꽃개구리Kozmoj  |  2007.07.24   
병리초보님의 말씀이 맞습니다.
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