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질문 protein degradation되는데 관여하는 mechanism 중에서...
누룽지  | 2006.06.01 00:00
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
protein degradation mechanism 중에서 ubiquitin이외의 mechanism이 어떤게 있는지 알수 있을까요?~
세포에 특정 drug를 처리하여 특정 protein을 보았더니 control에서 one band였던 것이
two band혹은 농도를 높일수록 점점 아래쪽 밴드가 굵어지면서
degradation form이 강하게 나타나면서 위의 밴드는 완전히 사라지기도 합니다.
proteasome inhibitor를 처리하였지만 아무런 효과가 나타나지 않았습니다...
왜 이런 degradation form이 나타나는지 알고 싶은데요..
어떤 방법이 있을까요...
답답합니다....ㅠㅠ
자그마한 조언이나 tip부탁드립니다....
#protein degradation
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
Mad Scientist  |  2006.06.01    
"왜 이런 degradation form이 나타나는지 알고 싶은데요.." 라는 의문을 풀기 위하여 여러가지 생각을 하고, 추가로 실험을 하는 것이 바로 연구입니다. -.-;;;

가령 해당하는 Drug 에 의해서 무슨무슨 Protease 가 activation 되고 단백질을 degradation 시킴으로써 레귤레이션을 한다~ 뭐 이런 스토리가 될수도 있죠.
(물론 이전에 보고된 내용인지부터 문헌 조사를 해보도록 하십시오)

결국 가장 안전한 방법은 꼭 그 단백질이 아니더라도 비슷하게 무슨 처리를 해서 무슨 단백질이 degradation 되더라...하는 페이퍼를 찾아보고 어떻게 접근을 했는지 문헌을 잘 읽어보고 비슷한 어프로치를 취하는 것이겠죠. apoptosis와 caspase와의 관계도 있고.

참고로 protein이 degradation 되는 mechanism 중 ubiquitination 은 단지 one of them 일 뿐입니다...일단 protease 에는 어떤 것들이 있느냐부터 접근해 보시기 바랍니다.
미네르바  |  2006.06.01    
정확이 단백질이 degradation 되는건지 아님 shedding이 되는건지 님의 말로는 확신이 서질 않네요
어떤 경우...예를 들어 어떤 cell membrane receptor protein 의 경우 나타나는 현상인데...이들은 특정 drug에 의해 activation 될경우 shedding 이 일어나서 ectodomine은 media로 떨어져 나가고 trans와 endo 부분이 남아서 cell lysate에서 강하게 detection 이 되는 경우도 있습니다.
님의 경우가 정확이 어떤 상황인지 알수는 없지만..
그냥 참고하시기 바랍니다.
그럼 좋은 결과 있으시길...
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