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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
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질문 NGS에서 MPS의 의미
알테리어  |  2013.11.07 17:53
Next generation sequencing을 다른 말로 massively parallel sequencing이라고 하죠.

process가 massively parallel해서 그런 이름이 붙여졌다고 하는데..

정확히 어떤 부분이 massively parallel한지 느낌이 오지 않네요
parallel하다는 단어가 잘 와닿지 않습니다..

자세한 설명 부탁드립니다.

감사합니다.


#NGS
 
#MPS
 
#massively parallel
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
7452  |  2013.11.08    
In computing, "massively parallel" refers to the use of a large number of processors (or separate computers) to perform a set of coordinated computations in parallel. In one approach, (e.g., in grid computing the processing power of a large number of computers in distributed), diverse administrative domains, is opportunistically used whenever a computer is available.

An example is BOINC, a volunteer-based, opportunistic grid system. In another approach, a large number of processors are used in close proximity to each other, (e.g., in a computer cluster). In such a centralized system the speed and flexibility of the interconnect becomes very important, and modern supercomputers have used various approaches ranging from enhanced Infiniband systems to three-dimensional torus interconnects.

The term also applies to massively parallel processor arrays (MPPAs) a type of integrated circuit with an array of hundreds or thousands of CPUs and RAM memories. These processors pass work to one another through a reconfigurable interconnect of channels. By harnessing a large number of processors working in parallel, an MPPA chip can accomplish more demanding tasks than conventional chips. MPPAs are based on a software parallel programming model for developing high-performance embedded system application
뽀또  |  2013.11.08    
만약에 sanger sequencing으로 한다고 생각하면, 딱 보낸 샘플양 내에서만 과정이진행되잖아요~

NGS의 경우는 flow cell에 붙어있던 adaptor sequence에 넣어준 sample이 결합하여 또한번의 amplification과정을 거치기 때문에 무수히 많은 target sequence가 cluster를 형성하게 됩니다. 
이들이 각 시퀀싱 cycle마다 base 하나씩 붙여가면서 동시에 빛을 내기 때문에 이를 두고 parallel하다는 표현을 쓴것 같습니다. 즉 한번에 무수히 많은 target sequence가 읽히는 것을 말한다고 보면 될듯 싶습니다. 
알테리어  |  2013.11.12   
감사합니다.
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