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질문 VEGF의 promoter에서 VEGF를 induction시킬 수 있는 transcription factor는 어떤게 있을까요?
SYC  | 2007.06.08 19:59
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
아주 초보입니다.
우연히 VEGF가 induction되는 조건을 잡아서 어떤 mechanism을 타고 가는지 알고 싶은데 VEGF에 관련된 transcription factor 조차도 모릅니다.
HIF가 많이 알려진 듯한데 더 아시는 것이 있는지 고수님들의 조언부탁드립니다.
#VEGF
 
# transcription facotr
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
이충구  |  2007.06.08    
TFBS prediction을 해보시는건 어떻세요? ^^
reference를 통해 이미 알려진 것들에 대해서도 찾아보시구요.
VEGF에 대한 것은 promoter 스터디가 잘되어 있지 않나요?

transcription factor binding site prediction은 여러 web-based tool 이 많습니다.
쉽게 검색을 통해 찾으실 수 있구요.
제가 자주 사용하는건 rVISTA 입니다.
한번 시도해 보세요.

하지만 말그대로 prediction 이므로 예측이 너무 많은 false positive를 가지지 않게 그리고 DNA binding 경우 manual 한 방법으로 consensus seq의 존재 유무를 확인해 주시는것도 FP를 줄이는데 도움이 되구요. 마지막은 꼭 실험으로 확인하셔야 된다는거. ^^
좋은 결과 기원합니다.
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