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 전체 > Molecular Biology-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
조회 2168  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 isoform까지 잡는 primer
primer  |  2004.07.27 00:00
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안녕하세요?
PCR을 이용해 실험하고 있는 학생입니다.
궁금한점이 있어서요...
논문을 보다 보니..
isofrom까지 잡는 primer가 있더라구요...

혹시..
어떻게 짜는지 아시는 분 계신지...
아님 그렇게 짜 주는 프로그램같은게 상용화되어 있는게
있는지...

안 그래도 그 gene의 여러가지 isoform을 잡아야 하는 관계로..
고민 중이었는데...
이런 프라이머라면..
한번에 두개내지 세개의 밴드로 각각의 isoform을
잡을 수 있잖아요....

논문엔 자세한 인폼이 나와있질 않아서 이렇게
질문드립니다..

리플 부탁드릴께요오~~~^^
#primer
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엘피스  |  2004.07.27    
Isoform은 alternative splicing에 의해 나타나는 경우가 많습니다. 정확히 하자면 isoform이 어떤 형태인지 먼저 알아야 할 것이고요.

100bp 100bp 100bp
A form -------_______--------
B form ______________

위와 같이 아래점선부분이 alternative splicing에 의해 없어져 B form이 만들어 지는 경우라면 중첩되는 부분에서 primer 를 잡으시면 됩니다.

PCR을 돌리면 A form은 300bp, B form은 200bp의 product이 동시에 나오게 됩니다.
A form만 있는 cell이라면 당연히 300bp의 PCR product만 나오겠죠?

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