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in vitro transcription하고 RNA sequencing하면 되겠는데요
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레벨3
Structure
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13.10.17 11:13
이렇게 하면 되겠네요. (Target transcript의 sequence를 안다고 가정. )
Transcript(mRNA) --> CAGE이용 --> 실제로 Transcription start site가 어딘지 알아낼 수 있음.
그럼 20~21nt seq.알 수 있으므로, 이러한 seq.가 나타나는 부분이 TATA box와 얼마나 떨어져 있는지 알아내면 게임 끝.
자세한 방법은
http://www.nature.com/nrg/journal/v8/n6/box/nrg2026_BX3.html 참고하시면 됩니다. Nature review genetics 2007.