실험 Q&A Mol. Biol.-DNA > Sequencing
Mass spectrometry로 SNP genotyping하는 원리 아시는 선생님계신가요?
벳유노 (비회원)
논문을 보다보니 Maldi TOF같은 Mass spectrometry로 하는 방법이 많은 거 같아서요.
그런데 기본 개념이 부족하다보니, 어떤식으로 한다는 건지 잘 모르겠습니다.
여러 SNP를 위한 프라이머를 넣고 PCR을 한다음에 PCR product를 매트릭스에 붙여서 측정을
한다는 건지..그렇게 확인 할거면 굳이 Mass spectrometry가 아니라, PCR 후 전기영동으로 확인해도 되지 않나싶기도 하구요. 제가 다른 연구소에서 가서 SNP genotyping 실습한 것은 특정 SNP 부분에 상보적인 forward primer 두가지(하나는 길게 결합. 하나는 변이 일어난 염기 바로 뒤에 결합)과 reverse primer 하나를 넣고 PCR해서 (변이있으면 짧은 pcr product, 없으면 보다 긴 PCR product) 전기영동으로 확인하는 방법이었는데..
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