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 전체 > Molecular Biology-Protein > Pull-down Assays
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질문 ip할때 단백질간의 결합때문에 항체가 못붙을수 있나요?
헤헤  |  2013.05.08 10:42
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
Affinity capture,ms 로 상호작용한다는걸 알았고 ip로 확인하려는데 잘 안잡히네요
안티바디는 잘 워킹하는것 같은데요...
#ip
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리doubleu  |  2013.05.08   

일단 질문에 대한 답만 드리자면 그럴 가능성이 없는 것은 아닙니다. 하지만 binding이 아주 tight하게 그 epitope만 binding할 가능성도 높진 않지요.
 실제로 같은 경우는 아니지만 맥락상 비슷한 사례도 있습니다. Immunofluorescence시에 서로 다른 motif에 binding하는 HDAC ab중에서 특정 안티바디는 cofactor와 binding시에 ab가 그 부분에 binding을 못하는 경우가 있다고 하네요.
 
일단 그 부위에 binding할 가능성을 염두해 두면서, O/E이면 Tag Ab를 이용하거나, 다른 Ab를 이용할 필요성이 있어보입니다. 만약 서로 다른 epitope을 인지하는 ab인데도 불구하고 binding이 안보인다면, IP 조건을 바꿔야 할 수도 있을 거 같습니다.

p.s Affinity capture면 어떤 것을 말씀하시는 것인지...그것도 혹시 Ab를 이용해서 한 거 아닌가요? 같은 Ab로 해서 결과가 나왓으면 IP도 그렇게 되어야 하는거 아닌가 싶어서.. 혹시 Endo-Endo 결과를 보시는 것이면 모르지만, Affinity capture 조건으로 그대로 IP 상에서 확인하시고 싶으신 것이라면, Ab 문제는 아닐꺼 같네요.

알지녕  |  2013.05.08   
특정항원에 대한 항체라 해도
epitope가 linear한게 있고(주로 IB용)
3D conformational한게 있습니다(IP용)
항체의 어플리케이션에 IP도 되는건지 확인해보면 도움이 될것 같네요
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