[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
랩박스 - 형광 이미징의 모든 것
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Etc.
조회 4712  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 MEGA5 이용방법에 대해 질문드립니다 (보편적 계통발생수 작성)
3Domains  |  2012.06.04 10:51
첨부파일 파일첨부: 3domains.jpg (8 KB)
이미지 첨부파일
안녕하세요, 생명과학과에 재학중인 대학생입니다. 

얼마전 동물계통분류학 실험에서 MEGA5라는 프로그램에 대해서 배웠습니다. 

처음 다뤄보는 프로그램이라 재미있어서, 여러가지 방법으로 이용을 해봤습니다. 

그러던 중, 문득 예전에 배웠던 3domains가 생각나더군요.

SSU rRNA서열에 기초하여 첨부한 사진과 같은 계통수가 작성되었다고 배웠는데요,,


그러면 정확하게는 아니라도, MEGA5와 NCBI에 data가 있는 생물 몇 종 (고세균역 2~3종, 세균역 2~3종, 진핵생물역 2~3종)을 이용해서 3 domains으로 나뉘는 계통수를 그릴 수 있을 까요? 

만약 가능하다면 어떠한 유전자 마커를 사용해야 하는지 알 수 있을까요?  

전공서적에 보면 'SSU rRNA에 기초하였다'라고 있으니, 16S나 18S를 이용하면 되나요?
(제가 알기로는 세균역과 고세균역은 16S이고 진핵생물역은 18S인데, 어떤식으로 이용하는게 좋을까요..)

다음과 같이 해보려고 하는데, 맞는 방법인지 모르겠네요.. 지적 부탁드립니다.
(세부 설정은 기재하지 않았습니다)

1. NCBI에서 세균역, 고세균역의 생물 2~3 종의 16S rRNA에 대한 FASTA 파일을 얻는다.
(진핵생물역의 생물은 같은 방법으로 18S rRNA에 대한 FASTA 파일을 얻는다)

2. MEGA5를 이용하여 계통수를 그린다.



아직 학부생이라 전문 지식이 없다보니.. 이렇게 질문 드립니다.

잘 아시는분 계시면,, 답변 부탁드립니다.

감사합니다,, 좋을하루 되세요!!!!
#mega5
답변하기
첫 댓글을 달아주세요.첫 답변을 달아주세요.
답변하기
할인행사 광고 검색광고
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
COVID-19 진단 및 연구! TECAN과 함께하세요!! (9.30까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
nanoString Panel Discount Promotion (~6월15일까지)!!! (6.16까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
[TECAN] Reading과 형광 Imaging을 하나의 장비로 한 번에!! [Multi-mode mic.. (6.20까지)
케이비티 케이비티
[KBT] Rotator, Thermo Mixer, Ultrasonicator, Stirrer 등 기본 실험.. (6.30까지)
셀레믹스 셀레믹스
BTSeq Contiguous Sequencing 서비스 런칭 이벤트 - 무료 분석서비스(1만 마일리지) 제.. (6.30까지)
에펜도르프코리아 에펜도르프코리아
[에펜도르프코리아] Eppendorf 2020 상반기 프로모션 안내 : 실험실 필수품 피펫,원심분리기,PCR.. (8.8까지)
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
3/6  좌우
139,000132,100
482,000433,800
79,50075,600
493,000443,700
47,20044,900
136,000129,200
924,000
92,30087,700
49,00041,700
52,60050,000
870,000
125,500119,300
339,400322,500
773,000734,400
482,000433,800
468,000421,200
66,50063,200
739,000702,100
93,20088,600
6,0005,100
370,000333,000
109,00098,100
17,00014,500
23,00019,600
최근등록   더보기 >
BamHI/HindIII 처리 시 issue...   06.06
Bacillus subtilis 접종후 발효 시키려고 합니다   06.06
FLAG   06.05
HPLC 질소가스 교체로 인한 문제   06.05
논문 오차율 계산   06.05
transformed cell 얼리는 방법   06.05
미생물은 이름이 같아도 생김새가 다르게 생기기도 하나요?;; (feat. S.mutans...   06.05
한 달 지난 액체 배지에 키웠는데 처음꺼랑 다른 결과가 나왔어요..(사진 봐주세요)   06.05
cell counting 계산 질문   06.05
darkroom 장비와 관련된 프로그램에 있어서 질문 남깁니다   06.05
라이카코리아
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크