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 전체 > Molecular Biology-DNA > Southern Blot Analysis
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질문 선충 genomic dna 추출 후 전기영동으로 확인 할 수 있을 까요??
알nastareya  |  2012.02.22 14:44

선충으로 부터 genomic dna를 추출한 뒤 pcr로 증폭하고 확인 했더니 밴드가 나오지 않았습니다.

genomic dna 추출 부터 잘 못 된건지 pcr에서 잘 못된 건지 확인해 보고 싶은데요.

선충의 genomic dna size를 검색했더니 나오지가 않아서 어떤 마커를 써야하는 지 전기영동으로 확인 할 수 있는 size인지 모르겠습니다.

전기영동으로 확인 할 수 있는 genomic dna의 크기제한이 있나요??
어떤 생물에서든 추출한 genomic dna는 모두 전기영동으로 확인 가능 한가요??

#genomid dna
 
#전기영동
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리플로터  |  2012.02.22   

보통 지노믹 DNA 확인은 1Kb마커의 제일 윗밴드보다 훨씬 윗쪽에 클리어하게 원밴드로
뜨면 잘 뽑혔다고 할수 있습니다...

대왕개구리강시  |  2012.02.22   
선충의 gDNA는 거대분자입니다.
하지만 분리하는 동안 잘리게 됩니다.
조심해서 분리해도 200kb를 넘기가 어렵습니다.

gDNA를 젤에서 확인할때는 gel %를 낮춰야 합니다.
0.4-0.7% 정도의 젤에서 확인하면 좋습니다.
마커는 큰 밴드가 잇는것을 사용하면 좋구요.
가령, lambda DNA, lambda/HindIII 같은거.

하지만 용도가 PCR이라면 1% agarose gel을 사용하고 일반적인 마커를 사용해도 상관 없습니다.
일반적인 마커도 10kB 이상을 볼 수 있으니 그것보다 위에 gDNA가 보이면 되는거죠.
아가로스 젤에서 gDNA가 확인될 정도의 양이면 PCR을 하기에 적은 양이 아닙니다.
그 정도의 gDNA를 사용해서 PCR이 안된건 PCR 조건의 문제이거나 프라이머의 문제입니다.
알nastareya  |  2012.02.23   

진짜진짜 !!!!!  감사합니다!!!!!^^ 다시 천천히 뽑아 봐야겠습니다!!^^

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