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답을 드리려는 것은 아니고.... 죄송
Sequencing이 않되는 DNA도 있습니까?
둘중의 하나로 보여지는데 DNA가 깨끗하지 못하거나 또는 primer에 문제가 있는 경우,
Sequecing에 문제가 있거나.
두업체에서 동일 결과가 나왔다면 첫번째일 가능성이 농후하다고 봅니다만.
제 경우엔 4번을 반복해도 sequecing못해 (물론 자신들의 잘못은 끝까지 인정치 않고 DNA탓만하고 말았는데) 다른 업체로 옮겨 한번에 끝낸 적도 있었습니다.
프라이머는 회사에서 제공하는(universal primer) 걸 사용하셨나요?
제 생각에도 우선 primer 가 가장 큰 문제 인것 같습니다. 님이 직접 제작하신 primer라면 위치를 좀 바꿔서 다시 한번 제작해보시구요.
그게 아니라 universal primer였다면 sequencing회사랑 직접 상의를 해보심이 좋을듯 합니다.
오래된 글이지만 몇글자 적습니다.저같은 경우는 pcr product를 plasmid에 넣고 plasmid 뒷부분에서 pcr product를 sequencing 하였습니다. enzyme cut을 하였을때 size를 확인하고 sequencing을 의뢰하였었는데 결과가 좋지 못했습니다. 여기서 결과가 좋지 못하다는 말은 sequencing에서 spectrum부분에서 sharp한 peck를 찾지 못하고 broad한 band를 확인 할 수 있었습니다. 추축하기론 plasmid가 map에서보면 원형처럼 생겼으나 실제로 그렇지 않고 꼬여있거나 plasmid 마다 특정부분이 복잡한 구조(?)로 되어 있어 primer가 잘 결합하지 못해서 그런거로 추측하였습니다. 그리하여 한 50bp 뒷부분의 plasmid sequence로 primer를 주문하여 sequencing을 의뢰하였더니 sharp한 peck를 얻고 결과또한 좋게 얻었습니다. 조금 뒷부분 or 앞부분의 primer을 주문하여 다시 sequencing 해보시는것을 추천해드립니다.<br type="_moz"><br type="_moz">