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질문 원심분리를 이용한 cell 농축
답답시려  | 2010.10.02 12:43
환경샘플(물) -R2A 배지에 접종시 약 10^5 ~ 10^6 정도 CFU/ml 인 환경샘플

이 샘플 약 6 ml 을 원심분리 10,000 x g, 2 min 를 해서 pellet 을 모아서 DNA를 추출하려고하는데..

PCR 결과가 좋지 않아서요 증폭이 잘되는것도 있고 안되는것도있고(주형 농도를 다양하게 해보았습니다. PCR 조건도 다 바꾸어보고...)
궁금한 것은

1. 10,000 x g 2min 원심분리시 bacteria cell 들이 pellet 을 형성하지 못한는것인가?
    (kit protocol 상에는 배양된 세포 기준으로 10,000 x g 30sec 로 되어있습니다)
2. 원심분리후 상층액을 따는과정에서 pellet 이 많이 딸려나가서?

3. Mo bio社 Microbial DNA Isolation kit를 사용하고 있는데.. DNA 추출 효율이 좋지 못해서?

참고
kit에 제공된 2ml tube에 샘플을 2ml씩 넣고 원심분리 후 상층액 제거 후 다시 샘플 을 넣고 원심분리 이런식으로 3회를 하여 pellet을 모으고있습니다.
 
#원심분리
 
#농축
 
#세균
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