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Biotin labeling한 DNA를 probe로 사용하는 것 아닌가요?
Southern은 보통 complex DNA에서 probe를 이용해 target만을 잡는 방법인데, biotin labeled DNA를 target으로 잡는다는 것이 이상해서 드리는 말씀입니다.
Biotin이 붙어있건 없건간에 이를 전기영동하는 것이라면 방법상의 차이는 없습니다. agarose를 이용하거나 PAGE를 이용하거나 모두 native gel을 이용하며 필요에 따라 transfer하기전 denaturing을 해줍니다.
이분야 실험들이 대부분 그렇듯이 손에 익지 않으면 100% 세팅된 상태에서 실험을 하더라도 결과가 들쭉달쭉해지는 것은 흔한 일입니다. 어떤 날은 기분에 따라서도 결과가 다르게 나오곤 합니다.