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식물에서 gDNA를 추출하면 대략 20-200kb 크기로 조각납니다.
험하게 다르면 gDNA의 크기는 줄어들고 부드럽게 하면 큰 조각을 얻을 수 있습니다.
gDNA를 agarose gel에서 보려면 gel을 0.5% 정도로 하면 좋지만 gel % 가 줄어들면 약하기 때문에 취급에 주의해야합니다.
20-200kb 크기 gDNA는 일반적인 agarose gel에서 이상적으로 분리되지 않고 그냥 덩어리져서 보이므로 크기를 정확히 보는것은 불가는하며 의미가 없습니다.
마커는 lambda DNA/HindIII cut을 사용하면 젤 큰 bamd가 23kb 정도 됩니다.
이걸 사용하면 될것 같네요.
45kb lambda DNA concatemer(45, 90, 135kb, ...) 마커도 사용할 수 있지만 일반적인 agarose gel에서는 사용의 의미가 없습니다. 분리가 안되나까요.
세균의 플라스미드는 대장균의 것을 사용하면 됩니다.
주위에 대학실험실이나 연구소에 가실 수 있으면 E. coli 에 pUC19나 그 밖에 알려진 plasmid가 들어있는 것을 좀 달라고 하면 됩니다.
pUC19는 크기는 작으나 cell 내의 copy 수가 많아서 정제가 편합니다.
전체적인 실험 내용은 주위의 대학실험실에가셔서 함 상의를 하는것이 좋겠습니다.
실험은 간단하나 준비해야할것이 많습니다.