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질문 RNA degradation
3T  | 2005.12.23 00:00
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extraction한 RNA를 loading 한 결과, 맨 위에 있는 band가 그 밑에 있는 band보다

약하게 떴습니다. 어떻게 해석해야 하나요?? RNA의 degradation 이라고 보아야 하는지

아니면 integrity가 떨어졌다고 봐야 하는지요..

RNA가 degradation 되면 band가 어떻게 뜨는지도 궁금합니다..

그럼 많은 지도와 정보 부탁드리겠습니다...
#RNA degradation
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
SFK  |  2005.12.23    
아마 total RNA를 extraction 하신거겠죠?
그렇다면 보고 있는 커다란 2개는 28S/18S rRNA를 보고 있는 겁니다. 실제로mRNA 는 total RNA를 뽑았을 때 아주 작은 양이라서 보이지가 않씁니다. 이 rRNA가 degradation이 일어나면 아주 sharp 한 동그라미 (혹은 네모) 모양이 아니라 붓으로 길게 lane을 그어놓은 듯이 smearing 현상이 나옵니다.
그런 것이 보이지 않고 2개의 밴드가 아주 선명하고 sharp하다면 RNA integrity 에는 별로 이상이 없다고 보셔도 괜찮습니다. 그리고 모든 샘플이 윗 밴드가 일정하게 작다면 일단은 너무 걱정하지 마시고 쓰세요 (단 band가 intact하다는 가정하에..)


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