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질문 Bacillus subtilis와 polyfermenticus,velezensis의 차이점 질문드려요
동그라미  | 2010.02.18 14:11
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)

안녕하세요
2가지 균주의 16s rRNA sequencing 결과를 가지고
ncbi에서 blast를 해본 결과
5가지의 bacillus속과 99%의 상동성이 나와 type strain과 align해보니
크게 Bacillus subtilis와 polyfermenticus ,velezensis가 99%의 상동성이 나왔습니다

1번균주는
Bacillus velezensis 의 경우 94%의 query coverage에 99%의 상동성이 나왔고
Bacillus polyfermenticus의 경우 99%의 query coverage에 99%의 상동성이 나왔습니다

그리고 2번균주는
Bacillus velezensis 의 경우 94%의 query coverage에 99%의 상동성이 나왔고
Bacillus subtilis의 경우 99%의 query coverage에 99%의 상동성이 나왔고
Bacillus polyfermenticus의 경우 99%의 query coverage에 99%의 상동성이 나왔습니다


이럴경우 생화학적인 특성을 봐야하는건가요?
어떻게 해야하는지 조언을 해주세요
감사합니다.

#bacillus subtilis
 
#bacillus polyfermenticus
 
#동정
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
계획쟁이  |  2010.04.20    
Bacillus의 경우 16s rRNA 결과를 믿기 힘듭니다.
recA gene sequencing이 그나마 믿을 수 있겠더라구요,
아마 NCBI 를 통해서 이와 동정법에 대한 논문을 검색 가능할것입니다.
참고하세요~~^^
알강박  |  07.04 21:57  
Full genome으로 가능한데요ㆍ간단하게는 gyrase type A로 구분이 가능합니다 polyfermenticus는 일본에서 처음분리되었고 ㆍ현재의 분류로는 velezensis 입니다
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