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코로나19 확진자 멀티오믹스 데이터 생산 및 자원화
공지마감일   2020.09.17
주최/주관   질병관리본부
URL   http://www.g2b.go.kr:8081/ep/invitation/publish/bidInfoDtl.do?bidno=20...
문의    043-719-8856 / pkoiu87(at).korea.kr
첨부파일 1   제안요청서(코로나19 확진자 멀티오믹스 데이터 생산 및 자원화).hwp (130 KB)
첨부파일 2   20200822484-00_1598427379164_긴급공고서(멀티오믹스 데이터 생산 및 자원화).hwp (41 KB)
분야   생물학관련 모든 분야

1. 용 역 명 : 코로나19 확진자 멀티오믹스 데이터 생산 및 자원화

기 간 : 계약일로부터 240일 이내

예 산 : 6,670백만원(부가세 포함)

계약방법 : 일반경쟁입찰(총액), 협상에 의한 계약

평가기준 : 기술능력평가(90%) + 입찰가격평가(10%)

 

2. 용역 목적

코로나19 확진자 중증도 예측 및 치료법 개발을 위한 연구자료 확보를 목표로, 최소 300명 이상 코로나19 확진자 대상 시점별 멀티오믹스 데이터 생산

 

3. 추진 배경

코로나19 관련 진료과정 중 생성된 임상정보 등을 통한 근거기반 방역대책 수립의 필요 및 연구 활성화를 위한 정보 공개 요구가 지속되고 있으며 코로나19 환자의 지속적 발생에 따라 유전체 분석을 통한 감염병 대응체계 및 데이터 자원화의 필요성 대두

특히, 단일세포의 경우 면역 세포의 발현 측정이 가능하고 여러 환경 속에서 면역반응이 어떻게 변화하는지 관측이 가능하여 정상인과 경증, 중증 등의 면역시스템 차이를 유전체 및 단일세포 유전체 분석으로 규명할 수 있음

확진자의 중증 및 경증간 예측 모형을 이용한 마커 개발을 통해 고위험군 또는 재발 가능 모형 개발

이에 국내 코로나19 멀티오믹스 자원화를 통해 환자의 임상적 중증도 별 면역반응에 대한 특징을 규명하여 치료에 대한 근거자료를 확보하는 것이 요구됨

 

  • 범위

추진내용 : 코로나19 확진자 멀티오믹스 데이터 생산 및 자원화

수행기간 : 계약일로부터 240일 이내

 

2. 주요 용역내용

코로나19 확진자* 대상 임상정보 및 인체유래물 수집

* 선정기준에 적합한 대상자 기준 최소 300명 이상, 3회 이상 추적

코로나19 확진자에 대한 멀티오믹스* 데이터 생산

* 전장유전체분석(Whole Genome Sequencing, WGS), 단일세포 전사체분석(single-cell RNAseq + single-cell immune profiling(B-cell receptor, T-cell receptor), BCR/TCR-seq, HLA typing, 면역·항체 분석(Cytokine profiling), 주요생화학검사 등

멀티오믹스 원시데이터 가공, 정도관리 및 기초분석

 

3. 용역 수행방법

질병관리본부 국립보건연구원 유전체센터와 긴밀한 협의를 거쳐 용역 수행

최종 산출물보고서 제출 및 중간 추진상황 보고

본 용역 연구책임자가 확인할 수 있도록 조사 결과 산출물에 대한 객관적이고 충분한 정보제공

제안 요청내역 외에 본 과제 추진에 포함이 필요한 추가적인 제안사항을 제시

기타 제공 가능한 기술적 지원 사항을 제시

샘플 및 데이터 보안에 유의하여 용역 수행

용역을 통해 생산된 유전체 데이터 중 품질기준 미달한 건에 대하여 무상으로 재생산을 요청할 수 있음

4. 생산 데이터 및 결과 보고서

생산 데이터 및 결과보고서 등 제출

참여자 모집, 임상정보·검체 수집, 자원 제작, 멀티오믹스 데이터 생산 등에 대한 전반적인 상황을 정기적(매주)으로 보고한다.

사업 완료 시 최종결과보고서, 멀티오믹스 원시정보 및 기초 분석결과, 정도관리 결과물 등 용역사업으로부터 생산된 결과물 일체를 제출한다.

제출물

제출형태 및 수량

용역 결과보고서

제본(20), 전자파일(PDF, HWP)

임상정보, 인체자원 관련 데이터 일체

전자파일(XLS, JPG, PDF )

멀티오믹스 원시자료

FASTQ, BAM

멀티오믹스 정도관리 데이터 일체

전자파일(XLS, JPG, PDF )

멀티오믹스 기초분석자료

VCF, read count

전자파일은 CD(2)로 제출

멀티오믹스 관련 자료는 외장하드(USB 3.0)으로 전달

결과보고서 등 제출물 초안은 사업 종료 2주전에 발주부서에 제출하고 발주부서의 검토를 거쳐 수정 보완한 후, 사업종료일까지 최종결과물 제출

 

생산 데이터(기본 분석 결과) 및 검체자원

코로나19 확진자 멀티오믹스 생산 데이터와 기본 분석 결과 및 임상정보는 국가 DB로 활용 예정

로나19 확진자 검체 자원은 국립중앙인체자원은행에 기탁됨.

 

 

□ 상세내용은 첨부파일 또는 링크 확인

  
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