워크샵
제 44차 프로테오믹스 실험기술 워크숍
제 44차 프로테오믹스 실험기술 워크숍
2006년 세계인간프로테옴 기구 (HUPO)의 Education & Training Center (Asia 지역 총괄)로 선정되었고, 현재는 염색체기반-인간단백질지도사업(C-HPP, Paik YK et al., Nature Biotechnol., 30, 221-3, 2012)의 세계총괄본부인 연세프로테옴연구원에서는 제 44차 프로테오믹스 실험기술 워크숍을 2019년 8월 22일(목) ~ 23일(금)까지 2일간 진행합니다.
본 워크숍의 목적은 의생명 분야 연구자들을 대상으로 2-DE 및 non 2-DE (LC-MS/MS)의 다양한 proteomics 실험기법 및 분석방법 교육뿐 만 아니라, 실제 실험과정에서 겪을 수 있는 제반 문제점의 실무적인 해결책을 제공하는 것입니다. 단백체 분석에 가장 중요한 2-DE 또는 LC-MS/MS 샘플의 전처리 과정, pH focusing 및 2D running 과정, 2-DE 이미지 분석 과정, MS 및 MS/MS 데이터를 이용하여 단백질 동정결과를 얻는 과정 등에서 발생 가능한 문제점에 대해 해결 노하우 등을 제시해 드리며, 2-DE 시스템을 새로 구축하시거나 MS분석에서 향상된 결과를 얻으실 수 있도록 최선의 도움을 드림으로써, 국내 프로테오믹스 연구의 질적 향상을 꾀하고자 합니다. 또한, Mol Cell Proteomics, J Proteome Research 및 Proteomics 등 주요 프로테오믹스 관련 논문의 게재에 필요한 실무적인 준비 요령 등을 참가연구자들께 전달해 드리고자 합니다.
지난 17년간 총 43차에 걸쳐 500여명 이상의 단백체 전문가를 배출하면서 축적된 교육 노하우를 바탕으로 한, 실험 실습 및 강의가 진행될 예정입니다. 본 강좌 및 각종 서비스를 통해 지금까지 다양한 저널로 110여편의 논문이 게재된 바 있습니다. 2-DE 응용분야인 Narrow pH range 2-DE와 형광 2-D DIGE 분석에 대한 내용을 들으시고, Sample 내 whole proteome의 biological study에 적용되고 있는 PTM (glycosylation, phosphorylation) 연구를 위한 non-2DE 기반 장비들인 LC-LTQ-MS, Q-TOF 등과 MRM, labeling-MS 분석 기법에 대한 응용 가능성을 검토하시기 바랍니다.
심도 있는 Proteome informatics 강의에는, MS, MS/MS spectrum 및 PTM 분석 결과를 이해하고, 활용하는 데에 필수적인 다양한 informatics tool에 대한 교육을 실시할 예정이니 많은 참여가 있으시길 기대합니다.
2019. 7. 10.
연세프로테옴연구원 (http://www.proteomix.org) 원장 백 융 기
워크숍 안내
1) 일시: 2019년 8월 22일(목)~23일(금)
2) 장소: 연세대학교 연세프로테옴연구원 (한국전력-산학협동관 3층 중앙세미나실)
► 후원: 보건복지부 지정 국제단백질지도사업 컨소시엄 사업단
3) 정원: 8명
4) 참가비: 50만원 (교재, 중식, 무료주차, 수료증 제공)
* 워크샵 기간 동안, 저희 YPRC 샘플로 2DE 실습을 할 예정입니다.
5) 강사와 실험 조교 (YPRC 상근 연구원)
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나근박사 (Proteomics), 이민정박사 (Proteomics), 조진영박사 (Bioinformatics, LC-MS/MS), 김주완박사 (LC-MS/MS), 김채연박사 (Bioinformatics), 김혜영연구원 (2-DE) |
6) 참가신청요령
첨부한 신청양식을 작성하셔서, 아래의 e-mail 주소로 신청서를 보내주시기 바랍니다.
o 담당자: 나 근 nak@proteomix.org (02-2123-6625)
o 참가비 결제 및 영수증 문의: 김민서 행정원 (02-2123-3279. yprc@proteomix.org)
44차 Workshop 일정
1일 |
2019년 8월 22일 : 2DE process |
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9:30 |
Coffee & Tea |
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10:00 |
[Lecture 1] Brief overview & introduction, Prof. Paik, Young-Ki |
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10:30 |
[Lecture 2] Introduction to proteomics and 2DE experiments |
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12:00 |
Lunch |
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13:00 |
[Lab 1] 2DE sample lysis, 1D pH focusing (IEF) and 2D Gel casting |
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14:30 |
[Lab 2] Image analysis of 2D gel |
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16:00 |
[Lecture 3] 2D application : fluorescence 2DE (2D-DIGE) |
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17:00 |
End |
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2일 |
2019년 8월 23일 : MS analysis and data mining |
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9:30 |
Coffee & Tea |
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10:00 |
[Lab 3] In-gel digestion for protein identification |
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11:00 |
[Lecture 4] Basic aspects of LC-MS/MS and other applications |
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12:30 |
Lunch |
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13:30 |
[Lecture 5] MS search engine and bioinformatics tool |
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14:30 |
[Demo] Practice of MS data |
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15:00 |
[Lecture 6] Utilization of 2DE data for biomedical study |
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16:30 |
End |
오시는 길 (한국전력-산학협동연구관, 교내건물번호114)
*지하철: 신촌역 3번 출구 → 마을버스 3번, 4번 → 연희성당앞
*버스: 서대문우체국앞
*자가용: 인조잔디 운동장쪽 남문 차량진입로 이용 (정문은 진입 어려움)
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