워크샵
제 44차 프로테오믹스 실험기술 워크숍
제 44차 프로테오믹스 실험기술 워크숍
(44th YPRC Proteomics Workshop)
2006년
세계인간프로테옴 기구 (HUPO)의 Education &
Training Center (Asia 지역 총괄)로 선정되었고, 현재는 염색체기반-인간단백질지도사업(C-HPP, Paik YK et al., Nature Biotechnol., 30, 221-3, 2012)의
세계총괄본부인 연세프로테옴연구원에서는 제 44차 프로테오믹스 실험기술 워크숍을 2019년 2월 21일(목) ~ 22일(금)까지 2일간 진행합니다.
본
워크숍의 목적은 의생명 분야 연구자들을 대상으로 2-DE 및 non
2-DE (LC-MS/MS)의 다양한 proteomics 실험기법 및 분석방법 교육뿐 만
아니라, 실제 실험과정에서 겪을 수 있는 제반 문제점의 실무적인 해결책을 제공하는 것입니다. 단백체 분석에 가장 중요한 2-DE 또는 LC-MS/MS 샘플의 전처리 과정, pH focusing 및 2D running 과정, 2-DE 이미지 분석 과정, MS 및 MS/MS 데이터를 이용하여 단백질 동정결과를 얻는 과정
등에서 발생 가능한 문제점에 대해 연세프로테옴연구원의 해결 노하우 등을
제시해 드리며, 2-DE 시스템을 새로 구축하시거나 MS분석에서
향상된 결과를 얻으실 수 있도록 최선의 도움을 드림으로써, 국내 프로테오믹스 연구의 질적 향상을 꾀하고자
합니다. 또한, Mol Cell Proteomics, J Proteome
Research 및 Proteomics 등 주요 프로테오믹스 관련 논문의 게재에 필요한 실무적인 준비 요령 등을 참가연구자들께 전달해 드리고자 합니다.
지난
16년간 총 43차에 걸쳐 500여명 이상의 단백체 전문가를
배출하면서 축적된 교육 노하우를 바탕으로, 각 5 단계의
실험과정 및 6개의 강의가 진행될 예정입니다. 본 강좌 및
각종 서비스를 통해 지금까지 다양한 저널로 110여편의 논문이 게재된 바 있습니다. 2-DE 응용분야인 Narrow pH range 2-DE와 형광 2-D DIGE 분석에 대한 내용을 들으시고, Sample 내 whole proteome의 biological study에 적용되고
있는 PTM (glycosylation, phosphorylation) 연구를 위한 non-2DE 기반 장비들인 LC-LTQ-MS, Q-TOF 등과 MRM, labeling-MS 분석 기법에 대한 응용 가능성을 검토하시기 바랍니다. 본 교육을 이수한 분에 대하여, 분기별로 프로테오믹스 실무자들을
위해 갖는 MS 데이터 분석 요령 생물정보워크숍에 무료로 초대됩니다.
심도 있는 Proteome informatics 강의에는, MS, MS/MS spectrum 및 PTM 분석 결과를 이해하고, 활용하는 데에 필수적인 다양한 informatics tool에 대한 교육을 실시할 예정이니 많은 참여가 있으시길 기대합니다.
2019. 1. 4.
연세프로테옴연구원 (http://www.proteomix.org) 원장
백 융 기
워크숍
안내
1)
일시: 2019년 2월
21일(목)~22일(금), 2 일간 필수적인 내용의 강의와 데모실험 위주 진행.
2)
장소: 연세대학교 한국전력-산학협동관
3층 세미나실, 4층 416호 (건물번호114 약도 참고)
► 후원:
보건복지부 지정 국제단백질지도사업 컨소시엄 사업단
3)
정원: 8명 내외 (선착순)
4)
참가비: KHUPO 회원/기존 2DE 서비스 의뢰인/연세대
대학원생 (50만원), 일반 (60만원) (연구비 정산용 영수증 제공)
5)
참가자에게 제공되는 혜택
① 강의교재 (강의 내용, 실험절차 모음 및 강의용 유인물 자료 등)
② 본인 샘플 2개에 대한 2DE gel 제공 (control
vs. disease)
③ 워크숍 기간 중, 참가자의 2DE gel에서 증가/감소하는 spot 1개 선택, LC-MS/MS 동정 결과 제공 (24만원 상당)
④ 워크숍 기간 중
중식, 무료 주차, 공식 영문 수료증
6)
강사와 실험 조교 (YPRC 상근
연구원)
|
나근 박사 (Proteomics), 정슬기 박사 (Bioinformatics), 이민정
박사 (Proteomics), 조진영 박사 (Bioinformatics, MRM-MS), 김주완 박사 (MALDI-TOF-MS
& LC-MS/MS), |
7)
참가신청요령
첨부한 신청양식을 작성하셔서, 아래의 e-mail 주소로 신청서를 보내주시기 바랍니다.
o 담당자: 나 근 nak@proteomix.org
(02-2123-6625)
o 참가비 결제 및 영수증 문의: 김민서
행정원 (02-2123-3279. yprc@proteomix.org)
44차 Workshop 일정
1일 |
2019년 2월 21일 (목요일) |
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9:00 |
Coffee & Tea |
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9:30 |
[Lecture 1] Brief overview
& introduction, Prof. Paik, Young-Ki |
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10:00 |
[Lecture 2] Introduction to
proteomics and 2DE experiments |
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11:00 |
[Lab 1] 2DE sample lysis, 1D pH focusing (IEF) and 2D
Gel casting |
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12:30 |
Lunch |
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13:30 |
[Lab 2] 2D image capture and spot selection |
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14:30 |
[Lab 3] In-gel
digestion and protein identification |
|
16:30 |
[Lecture 3] Basic aspects of
LC-MS for proteomics and other applications |
|
18:00 |
End |
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2일 |
2019년 2월 22일 (금요일) |
|
10:30 |
[Lecture 4] Application of fluorescence quantitative
2DE (2D-DIGE) |
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11:30 |
[Lab 4] 2D Image analysis |
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12:30 |
Lunch |
|
13:30 |
[Lecture 5] Database search tips on PMF and proteome informatics |
|
14:30 |
[Lab 5] Practice of MS data and DB search |
|
15:30 |
[Lecture 6]
Utilization of 2DE data for biomedical study |
|
17:00 |
End |