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BioLab 이은열 교수
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Q. 혈청검사 시 got gpt 첨부파일
안녕하세요 논문을 공부하는 학부생입니다  이 논문에서는 어떤성분이(rg-2)의 항암효과를 나타내는 논문인데  이 혈청검사를 통해 무엇을 나타내는지 모르겠어요 논문 번역을 봐서는 이 성분이 독성이 없다는 것을 나타내는 것 같은데  그거뿐인지 궁금하기도 하고요  첨부그림은 유방암세포를 누드마우스에 이식시켜서 종양으로 키운다음  그 쥐의 혈청을 조사해서 나타낸 그래프입니다   
회원작성글 쿠키크림  |  09.26
Q. CD4 t cell activation에서 왜 plate bound anti-CD3e를 사용하는건가요?
실험하다가 궁금해서 질문 드립니다! CD4 t cell가지고 실험하고 있는데 activation이나 differentiation을 할 때 보통 anti-CD3e는 plate bound를 사용하고 anti-CD28은 soluble한 것을 사용하는데 왜 그런 건가요? Soluble한 anti-CD3e를 잘 사용하지 않는 이유라도 있는건가요?
회원작성글 ㅡ,ㅡ;;  |  09.26
Q. Qiagen Rneasy mini kit로 RNA 추출
안녕하세요 실험에 대해서는 아예 모르는 초짜 대학원생입니다ㅠㅠ 졸업 논문을 위해 실험을 하게 됐는데, Cell에서 RNA를 추출해서 qRT-PCR을 돌려야 합니다. 현재 Qiagen RNeasy mini kit로 cell에서 rna 추출을 하고 있는데, 최소 6번은 했는데도 spectrophotometer로 흡광도 측정해봐도 아무것도 안 나와서 멘붕입니다.. 혹시 제가 하고 있는 과정 중 잘못됐거나 추가해야 될 점이 있으면 조언해주시면 감사하겠습니다ㅠㅠㅠ   *추출 전에 Buffer RLT 1 ml 당 B-ME 10 ul 첨가하고, Buffer RPE에 96-100% 에탄올 44ml 첨가했습니다*   *RNA 추출* 1. 6-well plate에 키우고 있어서 6 well plate 안 상층액 버리고, PBS로 wash했습니다. 2. RLT 350 ul 넣고 기울인채로 피펫 끝으로 긁어서 모이게 한 다음 튜브에 옮겨서 1분동안 vortexing했습니다. 후에 70% 에탄올 350 ul 넣고 피펫팅 10회 해서 섞었습니다. 3. 혼합한 700 ul를 spin column에 옮겨서 뚜껑 닫고 8500g에서 15초 원심 후 밑에 모인 것 버렸습니다. (그런데 이렇게 했을 때 막 위쪽에 하얗게 될 때도 있고 액체가 다 밑으로 안 내려올 때도 있습니다. Cell 양이 너무 많아서일까요ㅠ) 4. RW1 700 ul를 spin column에 넣고 뚜껑 닫고 8500g에서 15초 원심 후 밑에 모인 것 버렸습니다. 5. RPE 500 ul를 spin column에 넣고 뚜껑 닫고 8500g에서 15초 원심 후 밑에 모인 것 버렸습니다. 6. RPE 500 ul를 spin column에 넣고 뚜껑 닫고 8500g에서 2분 원심 후 밑에 모인 것 버렸습니다. 7. Spin column을 새로운 2 ml collection tube에 넣고 뚜껑닫고 10000g에서 1분 원심돌렸습니다. 8. Spin column을 새 1.5 ml 튜브에 옮기고 RNase-free water 40 ul를 spin column 막에 직접 넣었습니다. 뚜껑 닫고 8500g에서 1분 원심 돌렸습니다. 9. 8번에서 한 그대로 같은 튜브에 RNase-free water 40 ul를 spin column 막에 직접 넣고 뚜껑 닫고 8500g에서 1분 원심 돌렸습니다. 10. Spin column 제거하고 뚜껑 닫고 18 ul씩 4개로 나눠서 -80도씨에 보관합니다.   보관하기 전에 spectrophotometer로 아무리 재봐도 값이 안 나옵니다ㅠㅠ 너무 답답합니다.. 짚이는 것은 cell 양이 너무 많은지, 피펫팁으로 긁어오는게 너무 부족한지, vortexing을 너무 높은 속도에서 하는지, 알코올 넣고 피펫팅을 너무 조금 하는지 세게 하는지.. 이런 것들이 원인일까 싶기는 합니다ㅠ 추출은 실험대에서 하고 있고, 추출하기 전에 알콜로 소독하고, 피펫도 Rnazap? Rnase 제거하는 용액 뿌려서 닦고 피펫팁은 autoclave 돌린 것 사용하고 있습니다. 가운 입고 마스크 쓰고 말은 안하고 라텍스 장갑 끼고 rnazap 뿌려서 비빈 다음 진행하고 있습니다.   고칠 점 있으면 부디 알려주시기 바랍니다ㅠㅠㅠㅠ 감사합니다.
회원작성글 석나  |  09.25
Q. 3T3L1 분양 가능하신분 계실까요.. [부산 양산 김해 경남 창원]
안녕하세요 부산인근에 거주하고 있는 대학원생입니다. 이번에 3T3-L1 cell을 분화시켜야하는데 저희 랩실이 가지고있던 cell morphology를 보니까 ATCC랑 많이 다르드라구요 ㅠ 검색해보니 3T3L1 분화시 p10 넘어가면 안된다고 하던데 저희 랩실은 이미 한참 넘은 것 같아요... 교수님 퇴직도 얼마 안남으셔서 cell을 구매하지도 못하는 상황입니다.. 혹시 3T3-L1 분양 받을 수 있을까요...ㅜㅜ     https://open.kakao.com/o/sFplpGDe 커피나 밥한끼 사례하겠습니다. 혹시 가능하신분 계신다면 오픈카톡으로 꼭 연락주세요 감사합니다..
회원작성글 앨  |  09.25
Q. Autophagy는 질병에 있어서 좋은건가요 나쁜건가요?
안녕하세요 너무 기초적인 질문일수도 있기는 한데 실험을 하다가 헷갈려서 질문드립니다 ㅠ 저는 어떤 toxic한 물질을 처리하고 치료제를 주었을 때 autophagy가 증가함으로써 toxic 물질이 감소하고 치료효과를 보인다 라는 가설을 가지고 실험을 하고 있습니다 그런데 어떤 논문에서는 질병에서 autophagy가 증가하는 양상을 보이므로 치료제를 써서 autophagy를 억제시킨다 라고 이야기를 하더라구요 그래서 이autophagy를 어떻게 해석해야 하는지 궁금합니다 .. 저는 실험에서 autophagy 마커로 lc3를 보구요 치료제에 의해 Toxic 물질이 감소한 것을 western으로 확인한 후 lc3를 보았을 때 증가할 것이라는 예상결과를 가지고 실험하고 있습니다 . 다른 논문을 공부하다가 거기서는 또 lc3가 감소한게 좋은 것이라고 하길래 이해가 안가서 질문 드립니다 .... 답변 부탁드립니다
회원작성글 2밍  |  09.25
Q. e.coli의 transformation
안녕하세요.   과제로 transformation에 관한 발표 주제를 받았는데요.   37도에서 키운 e.coli와 18도에서 키운  e.coli의 transformation efficiency를 비교했을 때 18도에서 키운 e.coli의 transformation efficiency가 더 높다고 합니다.   그래서 자료조사를 해봤는데 명확한 이유를 찾기가 힘들더라구요..   혹시 아시는분 있을까요?
회원작성글 아아아아아우  |  09.25
Q. 혈중 알콜 농도 측정 관련
실험실에서 혈중 알콜 농도 측정하는 실험 중입니다. 에탄올 키트로 측정하고 다른 assay로도 측정했는데 모든 assay에서 control, 즉 술 안먹인 쥐에서도 에탄올이 측정됩니다. 혹시 in vivo 에서 에탄올이 측정될만한 원인이 있을 까요...? ㅠㅠ   여러 고수님들의 답변 부탁드리겠습니다.ㅜㅜ
회원작성글 한도비_두도비  |  09.24
Q. soil DNA extraction이 안됩니다...
DNeasy powersoil pro kit를 사용하여 soil DNA extraction을 진행하는데 일부 sample에서 dna가 아에 extraction이 되지 않습니다. 처음 뽑는 것이 아니라 여러번 100개 넘개 뽑아 봤어서 방법에도 문제가 없습니다. 물론 용액에도 문제가 없습니다. trobleshooting도 handbook에 있는건 다 해봤구요...   농도가 나노드랍으로 찍어보니 평균 1ng/ul가 나오더라구요 이정도는 여러개 뽑아서 농축할 수도 없는 농도라서 걱정이 큽니다...   조금 중요한 연구라서 착잡한 마음에 눈물도 납니다.. 혹시 의심되는 해결방안이 있을까 싶어서 문의드립니다. 아니면 혹시 pcr을 돌려서 ngs center에 전달해도 문제가 없을까요??
회원작성글 Seoki  |  09.24
Q. NGS targeted sequence분석을 하는 기업이 있을까요?
DNA target sequence를 진행하고 싶은데 해당분석을 의뢰할 곳이 마땅치 않아 혹시 NGS sequence를 의뢰할 수 있는 곳이 있을까요?? 알려주시면 감사하겠습니다.
회원작성글 조재일  |  09.24
Q. glucose 농도별 미생물 성장률
안녕하세요. 예전에 했던 실험 중에 glucose를 농도별로 했을 때 농도가 올라갈수록 흡광도가 커지다가 일정 농도 이상으로 커졌을 때는 오히려 흡광도가 감소했던 것을 본 적이 있는데 1. glucose의 농도가 커질수록 흡광도가 커지다가 일정 농도에서는 감소되는 이유가 궁금합니다! 2. 이것을 확인하는 실험이 어떤 실험인지 아시나요?
회원작성글 꿈꿈2  |  09.24
Q. cell culture에 HEPES가 꼭 필요한가요?
세포은행에서 세포를 분양받아 키우고 있습니다. 세포은행의 culture method에는 HEPES가 포함되어있던데 제가 사용하는 배지에는 HEPES가 없습니다. 찾아보니 HEPES가 있으면 CO2 incubator가 아니어도 키울 수 있는 것 같더라구요 저는 CO2 incubator에서 키우고 있습니다. 그러면 HEPES가 세포가 자라는데에 큰 문제는 없나요? 혹시 필요하다면 배지에 따로 첨가해서 사용하면 될까요?   그리고 세포은행의 Saos2 세포가 검색하면 두 가지가 나옵니다. 그런데 이름은 똑같습니다. origin의 차이가 조금 있나 싶은데 우선 culture method가 다릅니다. 혹시 이 두 세포가 어떻게 다른지 아시나요..?
회원작성글 차몬드  |  09.24
Q. Microplate Reader 관련 질문입니다.
Microplate Reader를 이번에 처음 써보는데 균이 배양되지 않은 배지를 Blank로 잡고, 균이 배양된 샘플의 흡광도를 찍었습니다. 이때 샘플의 흡광도값에서 Blank의 값을 빼고 계산해야하나요? 만약, 10배 희석을 했다고 하면 어떻게 계산하는게 좋을까요 예를들어 Blank 값이 0.05가 나오고 10배 희석한 값이 0.1이 나왔다고 하면. (0.1x10)-0.05로 계산하는 것이 맞는건가요??  
회원작성글 theo  |  09.24
Q. western blot band shape에 대해서 여쭤볼게 있습니다
안녕하세요  western blot을 진행했는데 detect 후에 band를 보니 band가 가운데가 비어 두겹처럼 나와있더라구요 ㅜㅠㅜㅠ   loading할때 intensity가 너무 높아서 빨리내리다보니 band 가운데가 비어있게 된걸까요 ? protei은 30ug, gel은 fastcast kit 사용했습니다    western 초보라 아직 data 해석에 미숙해서요 ㅠㅜ 아시는분 답변 부탁드립니다 ...    band 라인은 하나입니다 ,..!!    +)다른 gel의 band는 휘어지게 나왔는데 이 이유도 아실까요 ??  같은 gel이여도 휘어진 band랑 안휘어진 band랑 공존합니다 ㅜㅜ     >위에 첨부한 두 사진들의 결과는 모든과정을 동일하게 동시에 진행했으며, Ab만 다른아이들입니다 ㅜㅜ  
회원작성글 뚜리  |  09.24
Q. 간단 용어 관련 (technical dr~~ ??)
안녕하세요. 유기 및 bio 관련 연구하고있는 석사 과정 학생입니다. Bio 장비 측정을 위해 한 sample을 만들고 loading 및 측정했고, 똑같은 sample에서 나온 것으로 loading 하여 (첫번째 loading sample은 버리고) 한번 더 연달아 측정했다고 교수님께 설명드리니, 교수님께서 technical dr~~(이걸 정확히 듣지 못했습니다.) 으로 진행한거라고 말해주셨습니다. 나중에 찾아보려고 대충 발음을 적어놨는데, 죽어도 안나와서 여쭤봅니다 ㅋㅋ  ㅠ 혹시.. 어떤 건지 알고 계시는 분 있을까요?    만약, 나중에도 용어 찾아볼 것이 있으면 주로 어디서 찾는게 좋을까요? 교수님께서 모르는 용어를 쓰시면 인터넷에 찾아보곤 하는데, 가끔가다 정말 안나오는 경우가 있더라구요. 감사합니다 ㅠㅠ
회원작성글 감자랑나랑  |  09.23
Q. 동물에 투여하는 천연물을 받았는데 DMSO에 녹이라고 합니다. DMSO 용매용이 따로있나요?
  안녕하세요, 이번에 마우스에서 천연물에 대한 효과를 확인하기 위해서 천연물을 받았는데 DMSO에 녹여야 한다고 들었습니다.    저희가 가지고 있는 DMSO가 Cell culture 용(>99.7%)인데 약물 녹일때 보통 어떤 DMSO를 사용하시나요??    굳이 나누어서 사용안하시는지 궁금합니다. 
회원작성글 다필요없어  |  09.23
Q. Mega X 를 활용한 계통수 그리기 outgroup 설정방법을 모르겠습니다... 도와주세요ㅠ_ㅠ
 안녕하세요, Mega X를 사용해서 계통수를 그리고자 하고 있습니다. outgroup을 설정해서 다른 clade 에서 삐져나온 sample을 in group으로 묶어서 표현하고 싶은데요...   제가 outgroup을 설정하는 법을 모르겠습니다... youtube나 이런 것들에서 좀 찾아봤는데 못찾겠더라구요.. 혹시 설정하는 방법을 아시는 분 계시다면 알려주시면 감사하겠습니다...   읽어주셔서 감사합니다. 늘 좋은하루 되세요 
회원작성글 Anchovy  |  09.23
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