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고주온(필명)
진행중 초심자를 위한 생물학+정보학 < 60회 >
고주온(필명)

(http://bioprofiler.tistory.com)
IBM-XT시절부터 개인용 컴퓨터를 사용하였으나, 강산이 변한 지금도 어제 코딩한 내용을 오늘 기억하지 못하는 자유인. 박사학위는 분자유전학 분야로 받았으며, 물리학과 화학에 관심만 있음.
현재 대학 교수로 재직 중.

[초심자를 위한 생물학+정보학] 생물학 연구를 위한 인공 지능/딥러닝 - 59
지난 연재를 통하여 생물학 연구에 있어서 매우 중요한 분야인 단백질 구조 예측과 관련된 도구들에 관한 내용을 소개하였다. 이 분야 역시 최근 들어서 괄목할 만한 발전을 거듭하고 있는 인공 지능, 그 중에서도 딥러닝 (deep learning)을 적용한...
댓글 댓글쓰기 2  |  10.07  |  조회 4,072
[초심자를 위한 생물학+정보학] 로제타폴드의 설치와 사용 - 58
이번에는 앞서 소개했던 알파폴드에 비견되는 로제타폴드 (RoseTTAFold)에 대해서 알아보고, 그 설치와 사용에 관하여 다루어 보고자 한다. 설치에 앞서, 로제타폴드 설치에 필요한 준비 사항을 알아보자. 로제타폴드 역시, 연산 병렬화가 용이해...
댓글 댓글쓰기  |  03.23  |  조회 5,315
[초심자를 위한 생물학+정보학] 알파폴드의 설치와 사용: 깃, 도커, 그리고 엔비디아 - 57
지난 번 연재에서 알파폴드의 설치 및 사용에 대해 언급했는데, 시간이 지나면서 알파폴드가 다량체 판 (AlphaFold-multimer version)으로 갱신되면서 전반적인 설치와 사용법도 바뀌게 되었다. 이 내용에 대해서는 bioRxiv에 논문1으...
댓글 댓글쓰기  |  2021.12.29  |  조회 9,518
[초심자를 위한 생물학+정보학] 단백질 구조 예측에서의 혁명: 알파폴드와 로제타폴드 - 56
생체 내외에서 일어나는 많은 현상에는 효소를 비롯한 단백질이 다수 관여한다. 잘 알다시피, 아미노산으로 이루어진 단백질에는 비단 효소뿐만 아니라 물질 이동과 저장, 구조적 역할, 생리적 기능, 그리고 수용체 등 신호 전달 및 조절 등 다양한 기능을 수행하는 수만 종이 존재한다. 그런데 종류가 다양한 만큼 모양새도 각각 달라서 그 구조를 알아내는 것이 상당히 어렵다.
댓글 댓글쓰기 1  |  2021.10.14  |  조회 5,941
[초심자를 위한 생물학+정보학] R의 자료 형태와 구조 3 - 55
우선, 리스트와 데이터프레임에 대하여 기본적인 사항을 짚어 보자. 앞서 알아 본 벡터와 행렬은 이들을 이루고 있는 원소들이 모두 동일한 자료형이어야 했지만, 이번에 알아 볼 리스트와 데이터프레임은 내부의 원소들이 같은 자료형이 아니어도 된다. 리스트는 각 요소마다, 데이터프레임은 각 열 (column)마다 일정한 자료형만 받을 수 있으며, 리스트는 심지어 데이터프레임과 같이 구조화된 객체도 자료로 포함할 수 있다.
댓글 댓글쓰기  |  2021.07.30  |  조회 2,338
[초심자를 위한 생물학+정보학] R의 자료 형태와 구조 2 - 54
지난 회차까지  R의 기본적인 자료 객체인 벡터  (수치형, 복소수형, 논리형, 문자형, raw형)에 관하여 알아 보았다. 이번에는 행렬 (matrix), 리스트 (list) 및 데이터프레임 (data frame)에 관한 내용을 알아 보자.
댓글 댓글쓰기 1  |  2020.06.26  |  조회 4,015
[초심자를 위한 생물학+정보학] R의 자료 형태와 구조 1 - 53
지난 번에 통계학 도구인 R의 기동과 간단한 작동의 예를 보았다. 앞으로 다양한 도표에 관한 내용을 풀어 가면서 R을 주로 사용하게 될 것이므로 이 도구에 대하여 기초적인 사항을 알아보자.
댓글 댓글쓰기  |  2020.05.22  |  조회 5,985
[초심자를 위한 생물학+정보학] R과 도표 - 52
과학의 어느 분야든 연구 활동의 결과물은 그것을 보는 사람의 이해를 돕기 위하여 도표의 형태로 표현하게 된다. 많은 경우에 있어서 수치 계산과 각 실체의 연관 관계 등 통계 분석이 동반되기도 한다.
댓글 댓글쓰기  |  2019.07.01  |  조회 8,154
[초심자를 위한 생물학+정보학] 리눅스에서 사용할 수 있는 논문 작성 도구 2 (LaTeX과 Mendeley 등)  - 51
잘 아는 바와 같이 문서나 논문의 작성을 위해 사용하는 도구로 워드 프로세서 (word processor)로 불리는 문서 작성기를 사용한다. 최근에 많은 부분이 자동화되기는 했어도, 사용자가 필요할 때마다 원하는 위치에서 글꼴이나 서식을 바꾸어 가며 작성하는 방식이 주를 이룬다.
댓글 댓글쓰기  |  2019.01.24  |  조회 7,286
[초심자를 위한 생물학+정보학] 리눅스에서 사용할 수 있는 논문 작성 도구 (LibreOffice Writer와 Zotero 등) - 50
연구하는 사람에게 연구 활동의 성과라고 할 수 있는 결과물은 결국 논문이라고 볼 수 있다. 그런데, 자료의 수집·분석과 그 결과에 대한 논문 작성을 각각 다른 컴퓨터에서 한다...
댓글 댓글쓰기  |  2018.06.26  |  조회 6,685
 
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Bio통신원 기사등록
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[나의 실험실 이야기] 서당개 3년이면 풍월은 읊어야지?
이 기사에 의견 올리기 재밌습니다. ^^
[석사 후 연구원이 대한민국에서 살아가는 법] 비영리 연구소 연구원
이 기사에 의견 올리기 @미기님 안녕하세요! 댓글 남겨 주셔서 감사합니다ㅎㅎ 비슷한 경험을 가진 분들을 만나면 반갑더라구요 재밌게 읽어주셔서 감사합니다 :)
[랩노트] 연구실이 불탔다니,
이 기사에 의견 올리기 힘내세요. 안좋은 댓글들에 너무 마음쓰지 마세요~! 저도 석사때 저희 연구실이 불이 났었어요. 저희 연구실이 2개가 있어서 저에게는 크게 피해가...
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