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[우당탕탕 석사 적응기] 석사 1학기 - 새로운 환경, 그리고 후회
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 카테고리: 전체 > Omics
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Q. EST 방향으로 실험할때..
실험을 설계하려는 박사과정준비중입니다 아직 데이타베이스를 가지고 있지않는 작물들로 부터 cold나 drought 관련 유전자를 찿아보고 대량 탐색하는 EST 쪽으로 실험을 하고자합니다 suppression subtractive hybridization (SSH)나 DEG(씨젠) 아님 프로테오믹스등 어떤 툴을 이용하여 접급하는게 좋을까요 그리고 프로테오믹스로 접근해도 문제는 없을까요? 물론 나중에 결국 유용유전자는 클로닝 해 나갈 생각입니다! 선배님들의 조언 부탁드립니다! 국내에서는 suppression subtractive hybridization (SSH) 실험을 대행해주는 곳은 없나요?
궁금이  |  2007.12.25
Q. metabolomics 란 저널의 impact factor가 얼마에요?
metabolomics 란 저널의 impact factor가 얼마에요? 인터넷을 아무리 검색해 봐도 알 수가 없네요 sci grade가 아니라서 그런건가요? 혹시 아시는 분 계시면 답변 좀 부탁드리께요
회원작성글 proteomics  |  2007.09.10
Q. 혹시 metabolomics 분석을 의뢰하면 해주는 곳을 아시는 분 있나요????
혹시 metabolomics 분석을 의뢰하면 해주는 곳을 아시는 분 있나요???? yeast를 TCA extraction 하여 그안에 있는 물질을 분석,동정하고 싶은데, 방법을 알수가 없네요 이런 일을 하는 곳을 아시는 분있으면, 도움 부탁드립니다. 참 막막하네요~
회원작성글 초보~~  |  2007.09.09
Q. 영문교정 잘하는 곳 추천부탁드립니다.
Proteomics 저널에 제논문을 submission하였는데, minor revision하라고 메일이왔습니다. 메일내용을 보니 데이타상으로는 문제없는 것으로 보이고, 단지 영문교정을 해야할듯 싶습니다. 그런데 제가 보낸 논문도 하리스코에서 영문교정 한것을 보낸건데... Proteomics 에디터분께서 문법등을 수정하라네요....ㅋㅋㅋㅋㅋㅋㅋㅋ ㅡ.ㅡㅋ 워메 워쩌라는건지...ㅡ.ㅡ 하리스코를 제외한 다른 영문교정 사이트 추천해주시면 감사드리겠습니다. 단백체관련 논문 수정을 잘하는 곳으로 부탁드려요....ㅜ.ㅜ
달려랏베베~  |  2007.06.15
Q. protein phosphrylation
2D gel을 걸어서 제 target protein의 PI가 바뀌는것을 확인했습니다.. 제 단백은 basic인데 acid쪽으로 shitf가 일어났습니다.. 제가 이해하기로는 phosphorylation의 경우 acidic하게 변한다고 생각을 해서 그래서 phospho specific antibody를 가지고 phosphorylation유무를 확인하니.. de-phosphorylation이 일어나고 있네요... 그래서 2D나 proteomics를 전공하시는 분들의 의견을 듣고 싶은데요... 이렇게 de-phosphorylation이 일어나서 PI가 acidic으로 변화가 일어날수가 있는지요? 아니면 다른 post translational modification으로 변화가 생기는 것을 확인해야 하는지요... 감사합니다..
2D  |  2007.05.30
Q. proteomics의 질문
proteomics 2-DE를 하시는 분들 봐 주십시요. 제가 maldi-tof로 mass 값을 얻어서 ID 할 때 NCBI와 SWISSPORT database를 이용하는데 같은 mass로 두 군데 database를 이용하면 다른 결과과 나옵니다. 예를 들어서 ncbi에서는 A라는 결과가 나오면 swissport에서는 B라는 결과가 나옵니다. 이런 이유가 무엇 때문 일까요~? 궁금합니다.
proteomics  |  2007.04.04
Q. 프로테오믹스 coomassie stain solution 만들때
17% Ammonium sulfate 510g 3% Phosphoric acid 108ml 0.1% Coomassie G250 3g 34% Methanol 1020ml coomassie 를 Methanol에 먼저 o/n 으로 녹인후 Ammonium sulfate 와 Phosphoric acid 를 녹인걸 섞었는데 Ammonium sulfate가 녹지 않더라구요. 충분히 strring을 했다고 보는데 왜 그럴까요.양을 조절해야할지..... Ammonium sulfate를 꼭 넣어야하는건가요.... 무슨 역할을 하는건지 알려주세요.
궁금합니다.  |  2007.02.28
Q. top-down proteomics
top-down프로테오믹스의 반대가 bottom up인가요? 이 두가지의 차이점이 무엇인가요? 감사합니다.
학상  |  2006.10.29
Q. 2D부터 MALDI-TOF까지 분석을 의뢰하고 싶습니다.
Primary cell을 가지고 Proteomic analysis를 하려고 합니다. 2D부터 MALDI-TOF까지 하려고 하는데 어느곳으로 의뢰를 하는 것이 좋을지... 연대나 서울대내 벤처, 포항공대등 여러 곳에서 분석을 해주는 것으로 알고는 있지만... 분석을 잘하는 곳에 의뢰를 하고 싶습니다. cell을 쉽게 모을 수 없는 것이라... 실수없이 잘하는 곳이어야 합니다. 괜찮은 회사가 있으면 알려주세요. 그리고 2D-gel이 17cm이고 siver staining을 할려고 하면 cell의 wet weight가 어느정도 있어야 할까요? 빠른 정보 부탁드립니다.
회원작성글 한지만  |  2006.09.15
Q. pRetroES vector 구합니다. 첨부파일
안녕하세요 저는 genomics에 관련된 일고 있습니다 pRetroES vector를 이용해 retrofitting BACs에 관련된 실험을 하려고 합니다. 예전에는 pRetroES vector를 atcc에서 판매 했었는데 현재는 중단된걸로 알고 있습니다. pRetroES vector를 가지고 계신 분은 연락 주시면 감사하겠습니다.
회원작성글 김수연  |  2006.08.23
Q. PathwayStudio 프로그램 관련
안녕하세요? 제가 속한 연구실에서 이번에 Ariadne Genomics사에서 개발한 PathwayStudio라는 프로그램을 구입하였습니다. 제가 프로그램사용법을 숙지하도록 계획이 되었는데요. 회사측에서 user guide를 제공합니다만 190여 pages의 방대한 양이기 때문에 혹시나 이미 사용하고 계신분이 있다면 조금 도움을 받을 수 있으리라 생각하여 글 올려봅니다. 간략한 사용법같은 것을 말씀해주시면 좋을 듯 합니다. 연락을 기다려보겠습니다. iedenkim@gmail.com 입니다.
회원작성글 김정수  |  2006.08.09
Q. MALDI-TOF
2DE 를 실험하고 있는 대학원생입니다. 시작한지 오래되지 않다보니 spot 분석에 대해 궁금해져서요.. MALDI-TOF 와 MALDI-QTOF 의 차이점이 궁금해서요.. MALDI 에 대해 공부하는 것도 만만치 않은데- 책에서 보니 TOF 의 원리는 쓰여 있는데 QTOF 에 대해서는 자세히 나와있지 않더라구요- 혹시 참고를 할 만한 책이 있을까요? 제가 참고하고 있는 책은 "프로테오믹스" 라는 책입니다. 선배가 추천해 주시기에 보고 있는데 문득 궁금해져서 이렇게 글을 올립니다. 고수님들- 알려주세요~
알려주세요-!  |  2006.07.19
Q. cell lysis 후 total protein을 보고 싶은데 buffer추천해주세요
일반적으로 많이 쓰고 있는 버퍼등으로 total protein을 proteomics하고 싶은데 적당한 버퍼 좀...
cell lysis  |  2006.04.04
Q. proteomics 결과 분석시 pi와 MW이 일치 하지 않는 경우...
proteomics실험분석 프로그램(profound)으로 분석한 결과로 찾아진 단백질이 gel 상의 spot과 MW와 PI가 정확하게는 일치 하지 않습니다. 이런 경우 분석이 잘못되었다고 보아야 하는건요?! 또 MW은 일치하는 것으로 보이는데 PI값이 좀 차이가 나게 되는 군요!! 이런 경우 DATA를 쓸 수 없는건가요?!
Hline  |  2005.11.16
Q. proteomics가 아닌 고전적 단백질 분석법은 어디에?
현제 단백질 분석법은 ''고전적인 방법으로 단백질을 순수 정제하여 그 정체를 규명하던 기술로부터 최근 프로티오믹스를 통한 극미량의 단백질을 고효율로 동정할 수 있는 수준''에 이르고 있는데여..1)최근의 proteomics외에 고전적인 방법들은 어떤것들이 있었는지를 알고 싶고요 2)그러한 방법들의 원리 및 실험 protocol에 대한 정보나 자료는 어디서 구할 수 있는지와 알고계신 정보를 알려주셨음 감사하겠습니다.
김도희  |  2002.01.12
Q. 궁금한게 있습니다.
Genomics와 Proteomics에 대해 알고 싶은데 자료 찾기가 좀 힘드네요. 자세한 답변 부탁드려요~~~
학생  |  2001.09.04
Q. 이게 모죠???
genomics(제노믹스) protemics(프로테믹스) Bioimfomatics(바이오임포메틱스) 이것들이 가지는 뜻이 모죠..에효...이거좀 알아야 하는데...도저히 인터넷에서 서적에서 알길이 없내요... 생물에 대해 잘아시는분이 여기에는 많은것 같은데... 꼭 좀 저것들이 먼저 자세히좀 갈켜 주세요... 관련된 서적이나 인터넷 싸이트...등...저기에 관한것이라면 모든지 가르쳐주세요.. 그럼 부탁 드립니다..
박수형  |  2001.09.04
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