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[우당탕탕 석사 적응기] 석사 1학기 - 새로운 환경, 그리고 후회
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Mol. Biol.-DNA Mol. Biol.-RNA Mol. Biol.-Protein Immunology
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Q. 세포 에너지학 전공서
세포 에너지학을 상대적으로 자세하게 다루는 분자생물학, 또는 세포 생물학 전공서를 알 수 있을까요? 목차만 비교해서는 다룬다는 사실만 알 수 있지 그것을 얼마나 심도 있게 다루는지 알기 어려워 질문 남깁니다.
회원작성글 sa06003666  |  09.18
Q. RT PCR Rna추출 과정에서 pellet이 보이지 않습니다..
안녕하세요. 현재 6well에 Raw cell을 seeding해 RT PCR을 진행하고 있는 학생입니다.  밑에 첨부한 사진과 같은 프로토콜로 진행하고 있는데, 세포가 많은 상태에서 진행함에도 불구하고 Rna isolation 과정에서 pellet이 거의 보이지 않으며, nano drop 260/280결과, Nucleic acid 농도도 굉장히 낮아 cDNA 합성을 진행할 수가 없는 상태입니다 ㅜㅜ.  (나노드롭 결과를 따로 정리한 파일입니다. )  rna 추출을 8번 이상 진행했는데도, 제대로 결과가 나온적은 한 번밖에 없습니다. ㅠㅠ 제가 RNA 추출 과정에서 세포를 죽이는 것 같은데, 아무리 생각해도 뭐가 문젠지 모르겠어 질문을 올리게 되었습니다.  모든 실험은 클린벤치에서 진행하고 있고, 지금까지 에탄올을 첨가할 때 조심스럽게 넣지 않았는데 그것이 문제인건지..? 아니면 트라이졸 피펫팅 과정에서 20번을 넘게 하기 때문에 세포가 죽어버리는건지 ..? 모르겠습니다 ㅠㅠ  미리 답변 감사드립니다!   
회원작성글 규규궁  |  09.18
Q. protein induction이란게 뭔지 잘 이해가 안됩니다..
cell에 IL-1b or LPS 처리 후 con에 비해 변화한 western blot band를 두고 선배들이 induction이 잘 된 것 같다고 설명하더라구요. induction과 expression의 차이가 있나요? cell에 IL-1b나 LPS를 처리하면 염증성 사이토카인등이 분비될 것이고.. 그럼 염증 마커들을 확인했을때 마커 두께가 두꺼워 질 것이고..그렇다면 발현이 증가한 것 아닌가요..? induction이라는게 정확히 이러한 실험에서 어떤 상황을 이야기하는 것일까요...?  
회원작성글 gamja  |  09.18
Q. DPPH ASSAY 흡광도 값이 과도하게 작게 나오면
안녕하세요! 고등학생입니다.  항산화 실험을 하는 과정에서 녹차를 사용했는데요, 미숙해서 그런지 시료가 색이 진하게 나와버렸습니다. 잘 모른 상태로 흡광도를 구하였는데 너무 작게 나와버렸습니다. 시료의 색이 실험에 영향을 줄 수 있다고 하네요. 이유가 궁금해서 찾아봤는데, 시료 색이 진하면 파장이 길어져 그렇게 나오는 것이 맞나요?? 혹시 아니라면 이유가 무엇인가요??
회원작성글 Scherzer  |  09.18
Q. OD가 낮다는 것을 어떻게 해석해야될까요
세포를 키우면서 중간중간 OD로 growth curve를 확인하는데요 curve는 당연히 exponential에서 급격히 올라가고 stationary 에서는 평평한 모습으로 다 비슷하게 나오지만 그 정도가 다 다르게 나오게 되는데요 (약물 처리를 다르게 했기 때문) 예를 들어서 같은 시기에 OD를 측정해보면 A 약물을 처리했을 경우 B 약물을 처리했을 경우보다 A의 OD가 B보다 높게 나옵니다. 이럴 경우에는 B의 growth가 억제된다고 생각하면 되는건가요?? 저걸 측정했을 시기는 stationary phase의 시점이고요  OD가 같은 측정시기에 다른거에 비해서 낮게 나온다는 것을 어떻게 해석하는것이 정확한지가 궁금합니다. 단지, 세포의 생장이 느린것으로 봐야되는 것일지 아니면  그만큼 많은 세포가 죽어있다고 봐야될지
회원작성글 브르르르릭  |  09.18
Q. phosphomimetic mutant에 관해서 질문이 있습니다.
안녕하세요, 논문을 읽으면서 공부하고있는 대학생입니다. 다름이 아니라 논문을 읽으며 phosphomimetic mutant, phosphoinhibitory mutant 같은 용어가 많이 쓰이는것을보게 되었습니다. 그런데 논문을 읽으며 보니phosphomimetic 돌연변이가 있으면 인산화가 잘일어나지 않는다고 하는 것을 보게 되었는데요, 실험에서는 이 돌연변이가 이미 인산화되어있는 상태처럼?기능을 하는 것 같아서요ㅠㅠ 대체 이 두가지 돌연변이가 정확히 무엇인지 알 수 있을까요?
회원작성글 lkdjf  |  09.18
Q. Skim-milk 배지에서 미생물 protease 실험하는데 결과가 이상해요
skim-milk 배지에서 키웠는데 오른쪽에 한 녀석이 하얀색 원을 형성하더라구요 자세히 보니까 균이 퍼진 것도 아니고 원래 퍼지면서 자라는 친구도 아니거든요... 모든 plate에서 같은 형상이 나오니까 무슨 작용이 있는 것 같은데 아무리 구글링해도 투명환만 나오고 하얀색원에대한 부분은 없더라구요 skim-milk배지에서 white zone이 나오면 어떻게 해석할 수 있는건가요?
회원작성글 Seoki  |  09.18
Q. Spotting이 무엇인가요?
일반생물학실험 레포트를 쓰는 중인데 spreading, spotting 가 주제입니다. Spotting이 spreading, streaking과 다른 것인가요? 신입생이라서 아직 잘 모르겠습니다.
회원작성글 에용  |  09.18
Q. 농도계산
함량이 30mg인 약물을 100mM으로 stock시키려면 약물 3g넣고 용매에 녹이면 될까요..??
회원작성글 엄청난초짜  |  09.18
Q. 톨루엔 취급 관련
톨루엔 뚜껑을 열어보니까 하얀 실링에 담겨있어서 니들로 빼야할 것 같은데 주사침과 주사기를 이용해서 빼내는 것이 맞나요? 맞다면 주사침은 어느정도 게이지를 사용하면 될까요? 제가 재료 실험실에 있다보니 아무래도 무기물질만 다뤘어서 유기에 대한 지식이 전무합니다. 톨루엔을 안전하게 빼낼 수 있는 자세한 방법으로 도와주십시오 ㅠㅠ
회원작성글 헬로키티  |  09.18
Q. 모든 돌연변이가 형질로 드러나지 않는 이유는 무엇인가요?
모든 돌연변이가 형질로 드러나지 않는 이유는 무엇인가요?
회원작성글 수2대  |  09.18
Q. 리그닌 추출법
고등학생이 학교 실험실에서 리그닌을 추출해서 확인할 실험 방법이 있을까요?있다면 자세히 알려주세요ㅠㅠㅠ가수분해,열분해를 이용하는 방법은 실험기구가 제한적인 환경이라 어려워서 약물분해를 이용한 실험방법이면 좋을 것 같습니다
회원작성글 환경화학에너지  |  09.18
Q. 클로닝 과정 중 insert DNA가 뒤집혀 들어가는 이유와 제한효소의 역할
클로닝 과정 중 insert DNA가 뒤집혀 들어가는 이유는 무엇이고, 이때 제한효소를 사용하면, insert DNA의 방향을 구분할 수 있다는데 그 방법이 무엇인가요?
회원작성글 그그그그  |  09.17
Q. 같은 cell수, 다른 O.D 차이 (MTT 실험)
RAW 264.7 cells로 MTT 실험 중에 있습니다. 24well 에 seeding 을 할 때,  40 generation의  cell로 1*10^6으로  셀을 깔았을 때, O.D 값이 1.5 정도 나왔다면, 15 generation의 cell로 같은 농도로 깔았는데 O.D 값이 0.8 정도 나옵니다.  같은 농도인데도 달라지는 이유가 뭘까요?   참고로 15 generation은 계대배양을 2번 정도 만 진행한 상태 입니다. 아직 안정화가 되지 않아 그런 걸까요?
회원작성글 nowthinkin..  |  09.17
Q. polysome profiling에서 x축이 궁금합니다.
안녕하세요, 논문을 보던 중 질문이 있어 글을 올리게 되었습니다. rna 번역에 대한 polysome profiling관련 아래와 같은 그래프를 보게 되었습니다. 제가 그동안 보았던 그래프들은 모두 x축이 sucrose gradient였고, 이는 원심분리와 관련된 것이라고 알고 있는데요.. 아래와 같이 fraction number라고 적힌 부분은 어떤 의미인가요? 너무 기초적인 질문이지만 답변해주시면 감사하겠습니다.  
회원작성글 lkdjf  |  09.17
Q. 카탈레이스 과산화수소 분해 실험
카탈레이스 과산화수소 분해 실험에서 과산화수소에 감자즙을 거름종이에 뭍혀서 실험하는 것보다 감자를 직접 썰어 넣어서 실험할 때가 떠오르는데 시간이 더 많이 걸리는 이유가 뭔가요? 감자를 직접 썰어서 실험을 하면 생기는 문제점이 감자 두께가 일정하게 썰리지 않아 변인 통제가 제대로 되지 않는다는 점 말고도 또 있나요?
회원작성글 수2대  |  09.17
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