안녕하세요 5'-6-FAM(fluorescein amidite)가 결합된 antisense oligonucleotides를 mouse injection하고 target organ을 whole mount dissection으로 slide 제작하고 target cell에 antisense oligonucleotides가 들어갔는지 confocal로 확인하는 실험을 하고있습니다 염색은 DAPI, Phalloidin(actin염색, alexa fluro 647)로하고 dapi, 647, fam 채널로 찍고있습니다 문제는 injection시행하지않은 control slide에서도 fam signal이 상당히 나와서 실험군의 signal이 신뢰할만한 것인지 의문이 듭니다 control slide의 형광이 보이지않을 정도의 confocal setting에서 실험군 촬영하는 것 외에 혹시 다른 방법이 있을지요? 아니면 FAM에대한 antibody를 써보신 분이 있으신지 궁금합니다. 감사합니다

시중에서 구입한 유산균 분말의 효능을 알아보고자 디스크 확산법에 활용하기 위해 배양액으로 만들려 합니다.   실험이 먼저 유산균 분말을 생리식염수에 희석하고 mrs 고체 배지에 도말해서 배양시킨 후, 다시 균을 따서 액체 배지에 배양시키고 원심분리 후 상등액만 사용하려는데 방법이 옳은가요? (원심분리는 불필요한가요..?)   고등학생으로서 조사하면서 배우고 있어 꼭 도움 부탁드립니다.틀린 부분이 있으면 집어주시면 감사하겠습니다ㅠㅠ

10% TCA 용액을 제조하는데 sonicator 처리해도 tca 가루가 잘 안녹아요 별도로 tca 가루 녹이는 방법이 따로 있나요?  증류수에 가루 넣어서 녹이는데 잘 안녹네요

안녕하세요, 고등학교에서 미생물의 DNA를 추출하는 실험을 진행하고자 해서 관련 자료들을 찾아보았는데, 실험에 쓰이는 Washing buffer 1, 2에 대한 정보를 찾을 수가 없어서 이를 알고 싶어 질문드립니다.

pET21b를 실험실에서 사용하고 있는데요  pET21b를 DH5a에 transformation해서 mini prep을 하면 yield가 높게 나오는데 scale을 키워서 culture한 뒤 midi prep을 하면 아이에 없다 시피 농도가 나옵니다.  다른 사람이 해도 그래서 전 연구자 실험 노트를 봐도 midi prep을 진행해본 사람이 없더라구요    답답해서 질문 남깁니다.  pET21b vector는 원래 이런건지 알고 싶습니다. 다른분도 이러신가해서요 ..ㅜㅜ 

qrt-pcr 할때 Plate를 8개의 튜브가 한줄로 연결되어있는 튜브를 사용하였었는데 실험실에 이제 튜브를 거의 다 써가고 예전 선배님들이 쓰시던 plate가 많이 남아있어서 사용하려고 하는데 의문이 있습니다. 96well pcr plate로 모두 분주후에 sealing film을 붙이는데요. 원래 사용하던 튜브로 할때는 rt-pcr 돌리기전에 centrifuge로 spin down을 시켜주는데 96well plate는 어떻게 spin down을 시켜줘야하나요? 도와주세요ㅜㅜ 

 comp cell은 DH5a를 사용중이고,  vector는 lentiV2를 이용중입니다 제가  primer 20bp크기를 insert하려는데 콜로니가 안떠서 고수님들께 자문구합니다.   DH5a는 RBC에서 구매해서 사용중이라 문제는 없는것같습니다. BsmB1으로 자르고 gel extraction 후 밴드 잘린거 확인했습니다.   comp cell 20ul에 plasmid 1.7ul넣고 transformation은 ice 20 min 42도에서 heat 45 sec ice 20 min 뒤에, S.O.C 50ul 넣고 37도  shake incubator에 1시간 배양 후  lb+amp plate에 모두 spread합니다   콜로니가 아예뜨지 않는데 어떤 단계를 확인하거나 바꿔야 할까요 vector도 바꿔보고 glass beads로  non-heat 으로도 해보고, ligation 단계에서 ATP도 넣어봤는데 콜로니가 안뜨네요ㅠㅠ  도움 부탁드립니다.ㅠ  

Western Bolt 실험 하는데 1차 항체랑 2차 항체 희석해야하는데, 1차 항체는 베타액틴으로 1:1000 2차 항체는 1:5000 으로 희석하라는데 몇으로 넣고 희석해야하는지 계산법 과 같이 알려주세용 ... 몇대 몇으로 희석하라는 방법만 봐도 머리가 너무 복잡해요  ㅠ ㅠ

근육이 피로해짐에 따라 근육세포의 재분극 과정이 지연돼서 휴지기가 길어진다는 정도로만 간단하게 알고 있었는데, 논문마다 sp가 증가한다는 것도 있고 변화가 없다고 하는 논문도 있길래 정확히 어떻게 되는지 궁금해서 질문 남깁니다.

한 논문에서 본 실험의 시약 조성비입니다   해당 논문에선 200nM Lba Cas12a, 1uM crRNA, NEBuffer 2.5 ul, 20U RRI, RPA product9(dsDNA) 2ul, 800 nM fluorophore quencher labeled ssDNA probe로 reaction volume은 25 ul 이라고 하였습니다.    실험 초보여서 이렇게 쓰여있어 어떻게 넣어야 할 지 의문입니다.   동일한 Lba Cas12a을 찾아보니 stock의 concentration이 1uM인데 그렇다면 Lba Cas12a를 5ul 넣어 200nM 을 넣으면 되는 것 인가요? total volume은 25 ul 이기에 1/5인 5ul를 넣어서요.    RRI의 양과 논문과 같은 Probe를 사용한다면 고정적인 수치일것이고  그렇다면 만약 다른 crRNA를 사용하고자 한다면 그 crRNA의 농도에 따라 reaction volume 도 달라지는 것 아닌가요?    사진은 논문 원문입니다.    감사합니다. 

염기서열을 아미노산 서열로 변환하는건 아는데 반대는 어떻게 해야하는지 몰라서요ㅜ 혹시 아는분들 답변 부탁드립니다!

안녕하세요! 현재 RT-PCR을 배우고 있는 학생입니다. 다름이 아니라 RNA를 추출하고, Nano drop을 찍으면 항상 Nucleic acid conc가 적게 나와서 고민입니다.. 평균적으로 50ng/ul이 나오는 것 같은데 혹시 이런 상황일 때 RNA 추출에서 주의해야할 점이 있을까요? 프로토콜 그대로 하고있다고 생각하는데 항상 이 값이 적게나와 다음 cDNA 합성 단계를 진행하지 못하고 있습니다 ㅜㅜ.. 마지막 단계에서 원심분리를 하면 펠렛이 Ep tube에 확실히 보이긴 하는데 나노드롭만 찍으면 값이 낮게 나오더라구요 Trizol에서 세포를 강하게 피펫팅 하는 과정에서 기포가 많이 생겨서 그런건지 아니면 Trizol에서 너무 오래 처리를 해서 그러는지 ㅜㅜ 혹시 조언좀 구할 수 있을까요? 

웨스턴할때 1차 안티를 저희 실험실은 4도에서 16시간을 인큐베이션합니다. 만약 20시간을 인큐베이션을 하게 되면 어떻게되나요? 결과에 많은 영향을 주게되나요? 

안녕하세요,   면역관련 테마로 실험을 하고 있는데, 가설을 세우기 위해서 TNF알파 저해제 약물들을 써봐야할 것 같은데 찾아보니까 해당 약물들이 전부 항체 혹은 바이오시밀러입니다.   뭐 일반적인 파우더나 타블렛에 쓰이는 약물들이야 시그마나 Cayman chemical 등에서 구매해봤는데 바이오시밀러같은건 한번도 주문해본 적이 없는데 보통 어떻게 다들 주문하시나요?   약에 대해 조금 더 찾아보니 전문의약품이라 쉽게 구할 수 있을 것 같진않은데..   필요한 서류등이 있나요?

안녕하세요 cell culture를 하는데 매번 cell이 한 쪽으로 쏠리는 경향이 자꾸 생기네요.. 이걸 differentiation 해도 되는건지 싶습니다. 한쪽은 60% 정도인데 한 쪽은 80~90% 정도 되어보이고.. 그냥 기다려야할지 고민이네요..

Protease라서 자기들끼리도 분해할 수도 있다고 해서 냉동보관해보려고 하는데 어떤 방법이 제일 좋을까요?? 지금은 4도씨 냉장고에 보관하고 있습니다. 

안녕하세요, real-time pcr을 배우고있는 석사학부생입니다. 이번에 conventional pcr과 real-time pcr의 차이를 찾아보고 있는 도중 real-time pcr 과정에서 Ct값을 확인해서 증폭값을 확인할 수 있는데, 내가 원하는 target template만 증폭됐는지 알기는 전기영동을 하지 않는이상 어렵지 않나요..? 그런데 다른 선배님들은 전기영동을 따로 하지 않으시더라구요.. 아직 배우고있는 과정이라 궁금한게 많습니다. 도움 부탁드립니다.

안녕하세요.  실험 중 궁금한 점이 있어 질문올립니다. viralRNA를 qPCR로 검출하는 실험 중 plateau의 RFU값이 낮게 나오는데, 원인을 모르겠습니다.   실험 과정은 1) 백신에서 추출한 viral RNA를 onestep qRT-PCR로 검출시 그래프가 잘 그려졌습니다. 2) 문제는, 실제 바이러스와 백신에서 각각 추출한 viral RNA를 twostep qRT-PCR로 검출 시 바이러스에서 추출한 cDNA의 최종 RFU값이 낮게 그려집니다. 백신에서 추출한 cDNA의 경우 최종 RFU값이 이전처럼 높게 나오구요. ct값은 오히려 바이러스에서 추출한 샘플이 높게 나옵니다. - 2번 실험에서 qPCR은 qiagen의 quantitect onestep mix에서 RT만 빼고 사용했습니다. 혹시 이게 문제가 될 수 있을까요? 의견 부탁드리겠습니다!

안녕하세요. PCR primer를 디자인할때 어떻게 고르면 잘 고를 수 있을지 질문하고 싶어서 글 남깁니다.   제가 primer-blast를 여러 조건을 넣고 돌렸는데, 사진처럼 여러 프라이머가 나옵니다.   원래 여러 프라이머가 나오는건 알지만 문제는 프라이머끼리 겹치는 부분 때문에 어떤 것을 선택하면 좋을지 잘 모르겠다는겁니다...   혹시 기준 같은 것이 있을까요? 알려주시면 감사하겠습니다ㅠㅠㅠ

안녕하세요! 농업을 전공하고 있는 3학년 학부생입니다. 현재 IRRI에서 인턴을 진행중에 있는데 QTL mapping을 이용한 연구를 보조하는 업무를 맡을 것같습니다. 그래서 QTL에 대해 기초부터 고급까지 자세히 알고 싶은데 아직 제대로 찾아보지는 않았지만 자료가 많이 없는 것같아서요.. 그래서 다들 QTL을 처음 공부할 때 어떤 경로를 통해 공부를 하셨나요..? 관련 서적이나 사이트, 유튜브 등등 어떤 것이든 추천해주면 감사할 것같습니다...!