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[우당탕탕 석사 적응기] 석사 1학기 - 새로운 환경, 그리고 후회
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 카테고리: 전체 > Molecular Biology-DNA > Southern Blot Analysis
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Q. southern blot 에서 crossliking
southern blot을 할때 membrane으로 전이된 DNA를 고정하기위에오븐에 굽거나 UV를 통하여 crossliking를 한다고 하는데요crossliking이 교차결합을 의미하는것이 맞나요 ??그렇다면 무엇과 무엇을 교차결합시키는것인가요 ??
학생입니다  |  2012.12.07
Q. (급)southern blot 대행 업체를 찾습니다.
저희가 논문이 급하게 나가야하는데, southern blot이 제대로 안나와서요.southern blot.를 해주는 회사를 찾습니다.검색해도 딱 이거다 싶게 나오는 회사가 없네요. ㅠㅠ
회원작성글 blue0817  |  2012.10.17
Q. 서던블롯 급 질문입니다.
서던블롯을 하고있는데 블락킹까지 했습니다.그런데 이제서야 프로브가 잘못 만들어진걸 알아서 좀전에 다시 프로브를 제작하고내일 다시 하기로했는데지금 블락킹까지된 나일론 멘브레인을 다시 사용할수있는 방법이 있을까요?DIG를 이용했습니다...ㅠㅠ
회원작성글 꾸꾸까까  |  2012.08.22
Q. Southern blotting- transfer 할 때 책 무게가 4kg 넘으면 transfer가 안 되나요?
Southern blotting을 글로 배우고 있는데요,transfer 할 때 위에서 눌러주는 책 무게가 4kg 넘으면 transfer가 안 되나요?protocol에는 주로 500g ~ 750g 으로 하라고 하던데 그렇게 해야만 하는 건지 궁금합니다.4 kg이 넘는 책으로 눌러놓고 10시간에서 16시간 했는데, 하고 나니 gel이 완전히 종잇장처럼 얇아져 있더라고요...그래서 그런지 도대체 왜 이런지 모르겠는데, positive control도, background도 아무것도 시그널이 안 나오고 필름이 깨끗합니다...도와주세요!
회원작성글 깨끗한필름  |  2012.08.08
Q. 서던 블랏 해주는 회사가 있을까요??
서던 블랏으로 확인해야될 시퀀스가 있는데요.이거 한번 하려고 실험 도구들을 준비하는게 빡실거 같아서요. 혹시비용을 지불하면 서던블랏을 해주는 회사가 있나요??아님 비용 저렴하게 실험을 준비할 수가 있을까요???
실험자  |  2012.07.10
Q. southern northern western blot에 대해서 자세히 알려주세요~
제가 지금 blotting 방법에 대해서 공부하고 있는데 southern northern western blot에서 쓰이는 probe들의 제조 방법에 대해서 알려주세요~~그리고 각 blotting 분석시 사용되는 물질에 대해서도 알려주세요
회원작성글 닉쿤짱  |  2012.06.18
Q. southern blot을 할때 사용하는 nylon mesh에 대해서 아시는 분 답변 부탁드립니다
southern을 할 일이 생겨서 준비중에 있습니다 그런데 제 실험에서 blot에 사용하게 될 nylon membrane의 크기가 hybridization bottle에 넣었을때membrane끼리 겹치는 부분이 생깁니다어떻게 위치를 조정해도 안되는 지라 찾아보니 nylon mesh라는 것을 깔아서 겹치는 것을 방지 해 준다고 하는데 현재 국내에서 사용을 잘 안하는 터라 구매가 쉽지 않더라구요다른 분들을 southern 또는 northern을 하실 때 위와 같은 문제가 생길 경우 어떻게 하는가요??nylon mesh 쓰시는 분들이 있다면 어디에서 사서 사용하시나요? 답변 달아주시면 정말 감사드립니다
회원작성글 써던준비생  |  2012.03.21
Q. 선충 genomic dna 추출 후 전기영동으로 확인 할 수 있을 까요??
선충으로 부터 genomic dna를 추출한 뒤 pcr로 증폭하고 확인 했더니 밴드가 나오지 않았습니다.genomic dna 추출 부터 잘 못 된건지 pcr에서 잘 못된 건지 확인해 보고 싶은데요.선충의 genomic dna size를 검색했더니 나오지가 않아서 어떤 마커를 써야하는 지 전기영동으로 확인 할 수 있는 size인지 모르겠습니다.전기영동으로 확인 할 수 있는 genomic dna의 크기제한이 있나요??어떤 생물에서든 추출한 genomic dna는 모두 전기영동으로 확인 가능 한가요??
회원작성글 nastareya  |  2012.02.22
Q. 안녕하세요 대학생인데요 ^^:
"southern blot으로 DNA의 copy수를 확인하는 방법 "   !! 이렇게 해서기말고사에 출제 한다고 하는데요 ㅠㅠㅠ 아무리 검색해도 구체적인 내용이라 그런지 나오지가 않아서요 ㅜㅜㅜ 조금만 알려주세요 ~ 아니면 관련자료가 있는 링크라도 ㅠㅠ -------------추가 수정: Q&A팁에보니까 이런류의 질문은 답변을 잘 안해주시는 거 같네요 ㅜㅜ 근데 정말로 아무리 찾아도 안나와서요 힌트라도 주시면 제가 찾겠습니다.!!
회원작성글 하이헬로  |  2011.12.04
Q. band intensity 측정이요~ (telomere length assay) 첨부파일
telomere length assay를 진행하고 있는데요southern blot을 통해 telomere band를 얻었는데 이를 정량하는 과정을 몰라서찾아보고 한참 고민하다가 질문을 올려봅니다연속적인 패턴의 밴드라서 image에 grid를 load해서 각 영역별 intensity를 측정해야 하는데요(첨부파일 참고)혹시 경험있으신 분, 조언 부탁드립니다
Anna  |  2011.11.22
Q. Southern blot detection 문제 첨부파일
Methyl-sensitive enzyme을 이용하여 southern blot을 하고 있습니다. DIG luminescent detection kit (Roche)을 사용하여 NBT/BCIP를 이용한 color developing을 하고 있는데, 첨부한 그림에서 처럼 오른쪽에 뭔가가 detection을 방해하고 있는데, 원인을 잘 모르겠습니다. 제품에 따른 프로토콜을 읽어봐도 특별히 문제점이 없어보이는데, 실험을 할 때마다 band 위로 뭔가가 떠 있는 것처럼 보여서 data로 사용하기가 힘듭니다. 고수님들의 조언 부탁드립니다.
Ju  |  2011.11.21
Q. s1 처리후 southern blotting
한달째. 서던만하고 있는 학생입니다....genomic DNA를 s1 nuclease 한 후, PFGE 한 결과 밴드가 선명하게 5-6개로 나왔습니다. 이 조건만 잡는데도 한달 걸렸지요..ㅠㅠ여기서부터 문제입니다!!이 PFGE 한 것을 southern 을 진행하였습니다.probe는 이 DNA가 가지고있는 gene(890bp) 사용하였구요 또한 이 gene 을 포함하고 있는 plasmid prep 해 놓은것이 있어서 control 로 함께 걸었습니다.결과는.. 밴드가 안나옵니다오직 control 만나옵니다. 아무리 exposure time 을 늘려도.. probe 농도를 늘려도..분명히 transfer 후에 DNA 가 membrane 으로 다 옮겨가 남지않은 것을 확인했는데도..안나옵니다.. 왜일까요.. 왜인지 아시는분들 있으세요? 혹시 저같은 경우 있으신지...ㅠㅠ그냥 이 균주들 plasmid prep 해서 그냥 전기영동 해서 southern 하면 너무나도 잘나옵니다.근데 왜 pfge 한 상태에서 souther 하면 안나오는걸까요..?ㅜㅜ
서던  |  2011.11.07
Q. Southern 실험시 marker size???????
안녕하세요Southern 실험시 결과 낼때 보통 marker size를 몇짜리 사용하시나요??한 10kb 정도 사용하시나요???알려주세요~~~
회원작성글 kkim ji  |  2011.10.18
Q. Southern 실험 buffer 제조시 궁금점이요~
안녕하세요Southern을 처음 시작하는 학생입니다. 1. Southern 할때 증류수는 2차를 사용하나요?2. Denaturation, Neutralize, SSC, SDS Southern에 사용되는 buffer들을 Autoclave 하나요??SDS 같은 경우는 녹일때 거품이 잘 생기던데 거품없어질때까지 놔둬야 하나요아니면 Autoclave 해줘야 하나요??알려주세요~~~
회원작성글 kkim ji  |  2011.10.14
Q. STR genotyping에 관하여 궁금한 것이 있습니다.
저는 STR genotyping을 통해 세포 두개의 유래가 다름을 증명하고자 합니다.세포의 STR을 어떻게 알 수 있는 건가요?  finger printing으로 범인을 잡아낼때도 범인의 sequence를 모르는 상황에서 둘을 비교함으로 알수있을 텐데;어렵네요;;; 내공을 갖추신 여러분들의 도움이 절실히 필요합니다. ㅠ.ㅠ전 whole DNA를 southern blot하려는 것이아니라; 특정부분만을(STR) PCR로 증폭하여 비교하고자 합니다.
재질문  |  2011.05.27
Q. southern blot 할때 사용하는 heat-sealable bag 구입처 아시는 분좀.. 알려주세요.
southern blot 할때 hybridization  에 사용하는...열을 가해서 붙이는 비닐봉투(?)가 연구실에 다 떨어져서 새로 구입하려고 하는데...워낙 오래전에 구입한데다가..생물학 관련된 회사도 아니고 국내제품도 아니라서...도무지 구입처를 찾지를 못하겠네요.지금 사용하는게 KAPAC 이라는 회사에서 나온 heat sealable pouches,인데...사이즈는 가로세로가 8인치, 9.5 인치이네요.굳이 이회사 제품이 아니라도 상관없으니.. 이런 제품 파는곳 아시는 분 좀 알려주세요.
LMJ  |  2011.03.18
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