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BioLab 장재봉 교수
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 카테고리: 전체 > Molecular Biology-Protein > etc.
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Q. 플라스미드 dna에도 히스톤 단백질이 결합하나요?
안녕하세요? 플라스미드 dna에도 히스톤 단백질이 결합하는지에 대해서  https://www.ibric.org/myboard/read.php?Board=exp_qna&id=253751&ksr=1&FindText=%ED%94%8C%EB%9D%BC%EC%8A%A4%EB%AF%B8%EB%93%9C%20%ED%9E%88%EC%8A%A4%ED%86%A4 에서 논문을 찾아 주신 것 같은데 (http://www.nature.com/gt/journal/vaop/ncurrent/full/gt2011127a.html)  이 링크가 깨졌습니다. 플라스미드 dna에도 히스톤 단백질이 결합하는지에 대해서 논문을 알 수 있을지요? 감사합니다.
회원작성글 땡땡이  |  2022.11.23
Q. ITC 측정 가능 여부
폴리머와 계면활성제간의 binding 양론을 보고자 ITC 측정을 하고 싶은데, 주로 생물쪽 연구에서 많이 쓰이는 기기다 보니 이런 용도로 쓰면 컨탬이나 고장 우려때문에 조금 꺼려하시는 분이 많으신 것 같습니다 ㅠㅜㅜ 혹시 이런쪽으로 ITC 기기 측정할 수 있는 곳 추천해주실수있으실까요ㅜㅜ 또, hexadecane 용매를 쓰는데 ITC 기기 측정에 큰 문제없을까요 답변해주시면 정말 감사하겠습니다!.
회원작성글 BRRIICCC  |  2022.11.21
Q. 단백질 정량분석 실험 결과 질문드립니다.
y = 0.0408x + 0.0127입니다.  sample 값은 0.3688, 0.3954 입니다. 1. sample 농도 값 구하는 방법 2. 50 ug 일 때 필요한 ul은 얼마인지? 자세한 과정과 함께 알려주시면 감사하겠습니다!
회원작성글 펭귄뒤적  |  2022.11.21
Q. PI3Ka와 PIK3CA는 서로 다른가요?
브릭에 글을 처음 써봅니다.... 기초적인 질문일 수도 있지만.... PI3Ka (Phosphatidylinositol 3-kinase alpha)와 PIK3CA (Phosphatidylinositol-4,5-Bisphosphate 3-Kinase Catalytic Subunit Alpha)는 다른 것인가요?    논문마다 다르게 사용하고 위키피디아 페이지도 따로 있던데 (https://en.wikipedia.org/wiki/Phosphoinositide_3-kinase , https://en.wikipedia.org/wiki/P110%CE%B1) 제가 혹시라도 다른 물질인데 같다고 착각하고 있을까봐 질문을 드립니다. kinase kinase kinase를 3K로 줄여도 되고 K3로 줄여도 되는 것이지요? 여쭤볼 곳이 없어서 여기에 여쭙게 되었네요 ㅠ 간단한 질문 죄송합니다, 감사합니다.   (두 위키 페이지를 자세히 읽어보니 PIK3CA는 유전자 이름이고 PI3Ka(또는 p110-α)는 단백질 이름이라고 이해하면 될까요?)
회원작성글 무민2  |  2022.11.20
Q. 단백질 인산화 분석 업체 (LC-MS) 추천해 주세요
안녕하세요. 마우스 뇌 조직에 특정 단백질의 인산화를 분석하려 하는데, 시판되는 해당 단백질의 인산화 항체가 없어, LC-MS를 통해 인산화 분석하려 합니다. 이러한 실험을 대행해주는 실험실이나 업체를 알려주시면 감사하겠습니다.
회원작성글 bluehawk  |  2022.11.18
Q. BAY 11-7082 action mechanism on NF-kappa B
안녕하십니까 아무리 구글링 해서 뒤져봐도 모르겠어서 질문 올립니다. ㅜㅜ BAY 11-7082라는 compound가 NF-kappaB를 inhibition하는 것은 알고 있는데 NF-kappaB를 구체적으로 어떻게 inhibition 하는지 모르겠습니다. 그니까 NF-kappa B의 구조에 어떻게 어디에 BAY가 들러붙어서 억제하는지 모르겠습니다. 
회원작성글 남홀  |  2022.11.15
Q. 클로로필 필터지 무게
 안녕하세요. 질문이 있어서 글을 남깁니다.   다름이 아니라 식물플랑크톤의 거대분자조성 실험 중 일부 샘플의 필터지를 half로 잘라 무게를 측정하여 둘로 나누게 되었습니다. 그런데 이런 경우 필터지의 무게가 정확히 반이 아닌 0.004-0.01 정도의 오차가 발생할 수 있나요? 전체 필터지의 무게보다 반으로 나눈 필터지의 두 무게를 더한 값이 더 가볍게 측정되었습니다.   혹시 샘플을 재냉동후 해동하여 시간의 차이를 두고 무게를 측정했을 경우 값의 오차가 생길 수도 있는것인가요?
회원작성글 말랑복숭아  |  2022.11.14
Q. SDS-PAGE에서 size marker의 밴드 수가 설명서보다 많이 떴습니다...어떻게 해석해야 하나요?
간단하게 SDS-PAGE 실험을 했는데요...size marker의 band를 봤는데 설명서에 있는 정보와 band 수가 다르게 나왔습니다... 설명서대로라면 12개 band가 나와야 하는데 실제로는 더 많이 나왔습니다. 그러면 각 band에 대한 분자량을 알 수 없는건가요...? 혹시 band가 번졌다거나 size marker가 아닌 다른 단백질이 band로 나타난건 아닐까요...? band가 많이 나온 이유와 해석 방법을 알고 싶습니다ㅜㅜ 실험은 185V 35분간 전기영동, 약 70분간의 염색과 2시간의 탈색을 진행했습니다. 1번 레인이 AccuLadder™ 3-color Prestained Protein size marker (Broad) (bioneer.co.kr) 이 링크의 size marker를 썼구요. 2번부터는 침과 우유, BSA 등등을 넣었습니다.    
회원작성글 rnjstjddnj..  |  2022.11.13
Q. transcription factor에 대한 IF assay
안녕하세요 transcription factor에 대한 IF 수행중입니다. target protein은 NFATc2(NFAT1)이구요 inactivation 상태에서 cytosol에 존재하고 activation 되면 핵으로 이동하는데 이것을 관찰하고자 IF를 수행 했습니다. 그런데 이상하게 모든 세포에서 핵이 진하게 염색이 되는 문제가 있어서 어떻게 troubleshooting을 해야할 지 몰라 질문 남깁니다. fixing은 4% paraformaldehide로 10min 하고, PBS wash 후에 0.2% triton X-100 5min간 수행합니다. 그래서 cytosol에만 존재하는 protein으로 동일하게 실험 해봤더니 마찬가지로 모든 세포 핵에서 검출되네요.... 답변부탁드립니다ㅜㅜ
회원작성글 mol min  |  2022.11.10
Q. 효소 특성(pH 안정성) 결과에 대해 질문드립니다. 첨부파일
효소 특성 실험을 진행하던 중, pH 안정성 결과가 이상하다고 생각되어 여러번 다시 해보았지만 같은 결과가 나와서 질문드립니다. pH 안정성(2.5-12)까지 0.5 단위로 버퍼를 만들어서 4도에서 24시간 보관 후 희석하여 활성을 측정하였습니다. (최적 pH는 결과가 정상적으로 나와 활성 측정방법이 틀린 것 같지는 않습니다.) 그런데 pH 3.5 부근에서 활성이 높아지는 현상이 계속 나타났습니다.  혹시 버퍼의 영향인가 싶어 다른 버퍼로도 확인해보았는데 비슷한 결과가 나타났습니다. 비슷한 결과가 있나 다른 논문들을 찾아보았지만 찾기 힘들어 고견 여쭙니다.. 실험이 잘못된 것이라면 알려주시면 감사하겠습니다.
회원작성글 기적  |  2022.11.07
Q. 혈액에서 적혈구를 간단하게 filtration 하는법이 있을까요?
크기배제 크로마토그래피 처럼 특정 fabric이나 membrane을 이용해 피를 흘려보냈을때/스며들게 했을때 적혈구를 최대한 필터링 하는게 가능할까요? 있다면 어떤 소재를 쓰나요? 시간은 수시간 걸려도 상관없습니다. 별도의 약물처리/ 전기등의 에너지원없이 하는 방법을 원합니다. 완벽히 거르지 못해도 좋아요  
회원작성글 wooooong  |  2022.11.06
Q. 고등학교 과학 탐구중 막히는 부분이 있습니다. (단백질 분해 실험)
안녕하세요 고등학교 1학년 재학중인 학생입니다. 학교에서 소논문을 쓰는게 과제인데 막히는 부분이 있어서 질문해요. 식품에 따른 단백질 분해 속도비교를 하려고 합니다. 닭, 돼지, 소고기로 실험하려고 해요. 펩신으로 단백질을 분해하려고 합니다. 그런데 펩신으로 분해된 단백질의 양을 확인할 수 있는 조작변인이 아무리 생각해도 떠오르지 않네요. 분해 후 질량을 측정하는 것도 고기가 물을 흡수할 수도 있어서 안될 것 같다고 선생님께서 다른 조작변인을 찾으라고 말씀하셨습니다. 그래서 단백질이 분해된 후 가수분해된 펩타이드의 양을 확인하거나 분해된 단백질의 양을 알 수 있는 방법이 있을까요?
회원작성글 핫초코티라미수  |  2022.11.03
Q. 2차항체 선정기준
standard curve를 제작하기 위해 indirect ELISA방식을 사용하려고 하는데요 항원을 구하였고 1차항체로 anti-rabbit인 항체를 구하였습니다. 2차항체를 선정할 떄 고려해야 하는 것은 anti-rabbit인 것만을 고려하면 되는 것일 까요? 1차항체와 2차항체 사이에 특이적인 결합들이 모두 다른 것들일까요? 학부생이고 실험을 처음해보는 것이라 잘 몰라서 질문 드립니다.
회원작성글 Kw8  |  2022.11.02
Q. thrombin cleavage site가 tpck treated trypsin으로도 잘리나요?
선배가 thrombin cleavage site도 tpck-treated trypsin으로 처리하면 다 잘린다고 해서 그렇게 실험해왔고, 그런 논문도 publish하였는데요.  근거를 못찾겠어서요..  맞는 설명인가요?
회원작성글 브뤽커  |  2022.11.02
Q. Amplify solution 대체품 정보 구합니다 ㅠㅠ
안녕하세요, 저희 연구실에서 Methyltransferase assay 나 Acetyltransferase assay 같은 enzyme assay를 많이 하는데요, 이때 사용하는 ³⁵S-, ¹⁴C- and ³H- labelled samples의 signal을 높여주기 위해서 Amplify sloution 을 사용해왔습니다.  그런데 기존에 사용하던 Cytiva의 amplify 가 대체품없이 단종이 되어버려서 대체품을 꼭 찾아야 하는데 정보가 없어서 혹시 비슷한 실험에 이런 amlify solution을 사용하고 계신 연구자분들이 있는지 정보를 얻고자 문의남깁니다 ㅠㅠ (기존에 사용하던 제품은 NAMP100 - Amplify Fluorographic Reagent 입니다.)   이 글 읽으신 모든분들의 실험이 순조롭게 잘 이루어지길 응원합니다~ 감사합니다.
회원작성글 jihyun_kim  |  2022.10.31
Q. TNBS assay를 할 때 HCL과 SDS가 1차 반응을 멈추는 원리가 뭔지 알 수 있을까요?
TNBS assay를 할 때 HCL과 SDS가 1차 반응을 멈추는 원리가 뭔가요?
회원작성글 대딩 강냉이  |  2022.10.29
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