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BioLab 장재봉 교수
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 카테고리: 전체 > Molecular Biology-DNA > etc.
Mol. Biol.-DNA Mol. Biol.-RNA Mol. Biol.-Protein Immunology
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Q. 전기영동 후 사용한 버퍼 폐기법
기초적인건데 배우거나 물어볼 선배들이 없어서 여기에 질문 남깁니다.   전기영동에 사용한 tae 버퍼는 어떻게 폐기해야 할까요? 저희 랩실에서는 etbr을 사용하고 있어서 버퍼에 etbr이 들어있습니다. 유기물 폐기통에 버려야 할까요?    그리고 etbr에 오염되지 않은 tae 버퍼는 어떻게 폐기하는게 좋을까요? tae버퍼 구성물질이 탄소를 가지고 있으니 유기물로 버리는게 좋을까요? 아니면 하수구에 버려도 괜찮을까요?
회원작성글 오르골  |  2022.11.01
Q. Knockout을 했는데 어떻게 gene이 나오나요?
논문에서 결과가 하나 나오는데  예를 들어서 transcription factor인 A에 대한 기능을 알아보기 위해서 A fl/fl mice와 CreERT2 mice를 cross 하고 TMX를 처리해서 A의 gene을 deletion 시켜줬는데 그러면 이후에 staining을 이용해서 정말로 줄어들었나 확인을 했는데 control에 비해서 줄어들긴 했습니다. 근데 제가 헷갈리는거는 gene을 deletion 시켰는데 어떻게 그 mice에서 다시 A가 나오는거죠...? 결과로는 아예 안나오는게 아니라 60%정도 줄었다고 나오는데 이게 deletion을 시킨다고 다 사라지는게 아닌가요??? mice를 가지고 실험을 안해봐서 이게 어떻게 되는건지 이해가 잘안되네요 deletion을 시켜도 어느정도 몸에 이미 translation된 A들이 잡힌건가요
회원작성글 브르르르릭  |  2022.10.31
Q. 프레파라트 표본샘플에서 DNA 추출이 가능한가요?
프레파라트 표본샘플에서 DNA 추출이 가능한가요?   마운팅용액으로 만든 프레파라트인데 무슨용액 같은 걸로 녹여서 DNA 추출이 가능하다는 논문을 본 것 같은데 기억이 안나서 적어봅니다.
회원작성글 이야천재네  |  2022.10.31
Q. DNA 산화스트레스 반응에 대해 궁금한 것이 있어요
dna 손상이 되면서 dna가 분해되나요? 그럼 dna 덩어리에 과산화수소를 반응시키면 덩어리가 풀리게 되나요? 과산화수소랑 dna가 반응하면 부산물로 기체가 발생하나요??
회원작성글 Wkdnduk  |  2022.10.16
Q. gene background 조사 하는 법
안녕하세요.. 이제 막 한달이 넘은 초보 석사입니다....   교수님께서 gene list를 주시고 background를 조사해서 발표하라고 하셨는데, 어떤 것들을 조사해야 하는지 잘 모르겠습니다.   일단은 gene name, function, expression, pathway를 정리했는데, 어떤 것들을 더 조사해서 정리하면 좋을까요??   도움주시면 감사하겠습니다
회원작성글 jamjam_ll  |  2022.10.08
Q. cell lysate에서 DNA만 깨는 방법
cancer cell lysate vaccine 연구를 하는 중인데 동물 실험의 결과가 잘 나와서  임상연구를 진행하고자 합니다. 그런데 저희 방법 상  저희의 cell lysate 안에는 DNA가 포함이 되어 있어서 다른 단백질들에는 영향을 주지 않고 DNA만 깨는 방법을 고민중에 있습니다. 현재는 sonicator or DNAse 등을 고려중인데 sonicator는 저희가 원하는 condition을잡아야한다는 난제가 있고 DNAse 처리는 DNA 처리 후에 DNAse를 inactivation 시키는 과정에서 다른 단백질들도 영향을 받을 것이 염려되고 있습니다. 저희의목적에 맞는 좋은 방법 있으면 공유 부탁드립니다.   감사합니다.  
회원작성글 새슬  |  2022.10.04
Q. 0.5M EDTA 10µL 제조법
시약 제조법에 대해 공부를 하고 있는데, 0.5M EDTA 10µL의 제조법이 궁금합니다.
회원작성글 JHS3219  |  2022.09.16
Q. 1M Tris-HCl(pH8.5-8.8) 180µL 제조 방법
1M Tris-HCl(pH8.5-8.8) 180µL에서 pH가 8.5-8.8인데 여기서 HCI을 몇 mL를 넣어줘야 하는지 궁금합니다.ㅠㅡㅠ 
회원작성글 JHS3219  |  2022.09.15
Q. 10% SDS 20µL 시약 제조법을 모르겠어요
이번에 실험을 하게 되어서 10% SDS 20µL의 시약 제조법을 알아야 하는데 관련 내용을 찾기가 힘들어서 이 제조법에 대해 아시는 분들 답변 부탁드립니다. ㅠㅡㅠ 
회원작성글 JHS3219  |  2022.09.15
Q. 1M Tris-HCl 제조 방법
제가 시약 제조법에 대해 배우고 있는 중인데 1M Tris-HCl(pH8.5-8.8) 180µL의 제조법에 대한 정보를 알고 싶습니다.
회원작성글 JHS3219  |  2022.09.14
Q. DNA복제를 추적할 때 BrdUTP 대신 BrdU를 쓰는 이유가 무엇인가요?
BrdU는 nucleoside인데 왜 nucleotide형태인 BrdUTP형태로 안쓰고 BrdU를 넣어줘서 세포내에서 BrdUTP가 되게해서 쓰는건가요?  도파민이 BBB를 통과하지 못해 L-도파를 넣어주는 경우와 같은 이유에서인가요? 아니면 tri phosphate이 붙으면서 negative charge에 의한 membrane 투과성 문제일까요..? 너무 궁금합니다 
회원작성글 포차코  |  2022.09.13
Q. 유전 형질 비율 관련 질문
안녕하세요. 생명 관련 자율동아리 하고 있는 중3인데요. 제가 이번에 친구들이랑 비멘델 유전 가지고 파이썬으로 시뮬레이션을 만들어서 복대립 유전이나 중간유전 같은 것들을 구현했는데, 시뮬레이션의 결과가 어느 정도 정확한지 알고 싶어서요. 예를 들어서 완두콩의 유전형질 비율은 멘델이 실험을 했었어서 1:2:1인 게 널리 알려져 있잖아요. 근데 초파리 눈 색이라던지, 나팔꽃의 엽형과 같은 형질은 인터넷에서 제 수준으로는 형질 간의 비율이 대략 어떠한지에 대한 연구결과를 찾기가 어려워서요. 어떻게 찾을 수 있을까요?
회원작성글 e3s  |  2022.09.07
Q. 항암제 동물실험 시 동물 종류에 따라 결과가 달라질까요
항암제 동물실험 시 사람과 99% 유전자가 비슷한 쥐를 사용한다고 알고 있습니다. 종양억제유전자 발현을 막는 물질의 억제물질을 이용해 개발된 항암제는 종양억제유전자의 서열이 다른 종으로 실험할 경우 결과가 달라질까요?? CDH1 종양억제유전자요! 여러 종에 존재하는데 서열이 다르니까 결과가 달라질까요ㅠㅠ
회원작성글 <(^오^)>??  |  2022.09.05
Q. UCSC genome browser에서 promoter 열람시 궁금한 점이 있습니다.
안녕하세요. 매번 질문만 드리게 되는군요 ㅠㅠ 항상 큰 도움 주시는 많은 선배님들께 감사드립니다. 저의 연구의 일환으로 UCSC genome browser를 통해 mouse IRF8 gene의 promoter sequence를 열람하고 있습니다. 질문은 다음과 같습니다. 아래 그림에서 "Promoters from EPDnew mouse version 001"라고 적힌 부분 밑에 두꺼운 파란색 선으로 promoter에 해당하는 region이 표시되어 있는데요, 조금 더 두껍고, >>>>> 무늬가 표시된 부분이 존재합니다. 혹시 저 부분이 실제로 transcription이 시작되는 지점이고, 그 부분의 시작점이 TSS (Transcription Start Site)인지 궁금합니다.     제가 요즘 긴 슬럼프를 통과하고 있어서 사소한 것 하나도 자신감이 없고 불안하고 그렇습니다.. 참 간단한 내용이고 분자생물학 교과서를 보면 제 생각이 맞는 것 같긴 한데 선배님들께 한 번 더 확실하게 확인을 받고 싶은 마음입니다.   답변 주시면 정말 큰 용기가 될 것 같습니다. 감사합니다!!
회원작성글 크리스12  |  2022.09.02
Q. plant DNA 추출 후 장기 보관 방법
안녕하세요 Plant DNA를 추출하여 약 2주 정도 되었는데요. 당분간 사용하지 않을 것 같아서 보관을 하고자 하는데 다들 어떻게 보관하는지 궁금하여 이렇게 글 남깁니다.  현재 DNA의 경우 KIT에 있는 elution buffer에 녹아 있는 상태이며, 냉장(2-4℃) 보관 중 입니다.  따로 추가적인 buffer 없이 바로 냉동으로 보관해두 괜찮을까요?  대략 한 달간 사용을 안할 것 같습니다.    
회원작성글 해조칼슘풍덩  |  2022.09.01
Q. size가 큰 플라스미드 전기영동 방법
안녕하세요, 실험을 배워나가고 있는 학부생입니다. cloning과 관련해서 이곳에 몇 번 질문을 남긴 적이 있었는데, 마침내 cloning이 최종적으로 성공한 것 같습니다. 그런데, insert1은 sequencing을 통해 삽입하였지만 insert2는 확인하지 못해 확인 과정이 필요합니다. 이를 위해서 원래는 colony PCR이나 제한효소 처리를 통해 insert가 분리되는지 관찰하고 있습니다. 그런데 이번에는 처음 vector에도 같은 항생제 저항 유전자가 들어있고, 또 무엇보다 형질전환 colony가 너무 많이 떠 제가 찾는 플라스미드를 찾는데 시간이 많이 소요될 듯 합니다. 그래서 size로 1차적으로 거르기 위해 전기영동을 하려 하였는데, 실험실에 계시는 분이 알려주시기로 저희 실험실 전기영동 기계는 5000bp이상의 플라스미드는 잘 분리가 되지 않는다고 합니다. 전기영동의 원리를 생각해보면 agarose gel의 농도를 높이면 괜찮을 것 같은데, 제 생각이 맞을까요? 아니면 혹시 제가 선택할 수 있는 다른 방법이 있을까요?
회원작성글 qkqh1  |  2022.08.24
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