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Q. |
순도가 낮은 RNA의 Clean up 방법 |
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안녕하세요
qPCR을 할려고
조직에서 RNA를 prep 하고 cDNA를 합성하는 과정에서
RNA prep 할 때, pellet이 안보이는 문제점이 있었으며,
농도 측정시 순도가 너무 낮게 나왔습니다.
그래서 순도를 높히고자 Clean up 을 할려하는데,
어떤 방법이 있을 까요.
EtOH를 이용한 precipitaion이 있다고는 들었는데 정확한 protocol을 모르겠군요ㅠ
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이겨또 | 2021.12.13 |
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Q. |
LAMP pcr probe |
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LAMP PCR을 준비하는 학생입니다.
LAMP primer는 디자인 해서 oligo주문 까지 마친 상태인데
probe방식으로 실험을 진행해야 하는데 probe를 디자인 하는 법을 잘 모르겠습니다.
LAMP probe는 어떻게 디자인을 해야 하나요?
도와주세요
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초코맛꿀 | 2021.12.07 |
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Q. |
White solid soluble in DMF? |
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안녕하세요.
현재 Nascent RNA labeling을 위해 4SU와 MTSEA biotin-XX를 사용하고있습니다.
MTSEA biotin-XX의 경우 white solid soluble in DMF 라고 표기되어있고, 실제로 DMF에 녹였을때 완전히 녹지 않는듯하고 하얀 고체시료가 DMF내에 떠다는니듯합니다. 이것이 정상인 것일까요? 아니면 제가 제대로 녹이지 못한것일까요?
혹시 MTSEA biotin-XX를 사용해보신분이나 이부분에대해 알고계신분이 있으시다면 귀중한 코멘트 부탁드립니다!!
감사합니다.
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silent cod.. | 2021.12.07 |
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Q. |
RT -pcr  |
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RNa 농도값이 870ng/ul가 나왔는데 사진 프로토콜 방식으로 빈칸 값을 구하고 싶은데 어떻게 구하나요
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개똥벌레 | 2021.12.05 |
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Q. |
fungi identification 맡길 수 있는 회사 문의드립니다 |
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안녕하세요, 한 영재고등학교에 재학중인 학생입니다. 제가 연구 프로젝트 하나를 진행하게 되었는데, glutamate/succinate/glutamic acid에 자란 fungi를 동정해야 합니다. PCR product와 primer를 마크로젠 등에 보내 시퀀싱 및 동정을 의뢰하는 것이 일반적이지만, 시간상의 이유로 PCR product가 아닌 medium에 담긴 fungi 등을 보내서도 동정이 가능한 방법을 찾고 있습니다. 혹시 관련 기업을 아시는 분께서는 기업과 주문 방법을 설명해 주신다면 큰 도움 될 것 같습니다. 감사합니다.
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신재헌 | 2021.11.29 |
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Q. |
RNA |
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수업 들으면서 RNA isolation 한건데 결과가 안좋습니다.. ㅜㅜ
질문 드리고 싶은것은 왜 18s rrna 위치가 오른쪽에 잘 나온 모범 사례의 위치와 다를까요?
왼쪽 젤은 래더가 전체적으로 밀린 느낌이 드는데 아가로스 젤에서 래더만 밀릴수있나요? 있다면 왜 그런건가요?
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Edenite | 2021.11.27 |
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Q. |
DEPC에 녹인 RNA 상온 방치 |
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cDNA 만드려고 RT-PCR을 돌리기 위해 mastermix에 RNA와 DEPC를 섞은 채로 PCR 기계에 넣었습니다.
근데 다른 실험을 하고 나서 보니 기계에 오류가 나서 안 돌아갔었더라고요...
사실상 상온에 2시간 정도 방치된 상황인데 이거 그대로 써도 될지 모르겠네요...
고수님들 답변 주시면 감사하겠습니다.
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아구몬 | 2021.11.24 |
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Q. |
liposome 질문있습니다ㅜ |
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교수님이 알아보라고 하셨는데 아무리 찾아봐도 해당하는 사례를 찾을 수 없어서요,,
저희는 생물학 관련 방인데요, 전달효율 때문에 liposome을 들여올 계획입니다. 그래서 아는게 많이 없어요ㅜ
질문은,
shRNA vector 혹은 shRNA particle 여러개를 하나의 liposome으로 다시 싸는것이 가능할까요?
보통 하나의 vector혹은 particle을 하나의 liposome으로 싸는데 이번에는 2~3개 이렇게 여러개를 싸는게 가능한지 물으십니다.. |
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jjnli | 2021.11.21 |
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Q. |
Trizol로 RNA 추출시 isopropanol |
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Trizol로 RNA 추출시 isopropanol 100% 사용하나요?
70% 100% 각각해봤는데 100% 넣었을때는 넣자마자 뿌옇게 변하던데
70%는 아무런 변화 없었어요 아직 ethanol 처리중이라 나노드랍은 못했어요ㅠ
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우닝 | 2021.11.18 |
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Q. |
RNA 추출 시 chloroform을 두 번 넣으면? |
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학교에서 RNA 추출 실험을 했는데 실수로 chloroform을 넣고 원심 분리 한 뒤에 상층액을 꺼낸 후 Isoprophanol을 넣어야 하는데 chloroform을 이전에 넣었던 양 만큼 다시 넣었는데...물론 실험을 고대로 망했구요..
그런데 chloroform 다시 넣으면 RNA 추출이 힘든지 그 이유를 잘 모르겠어요..ㅠㅠ
왜그런지 알려주세요
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hogangster | 2021.11.11 |
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Q. |
RT-PCR 전기영동 |
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안녕하세요 전기영동 초보입니다 ㅠㅠ
1번 6번 레인이 DNA ladder를 건 레인인데요 어떻게하면 ladder 폭을 더 늘릴수있나요? 처음에 gel을 1.5% 했다가 좁아서 1%로 낮췄는데도 좁네요 ㅠㅠ
더 낮춰도 되는건가요? 아니면 gel 프로의 문제가 아닌 다른 문제인가요..ㅠㅠ
그리고 혹시 5번 10번 레인에 끌림현상을 없앨 수 있는 방법도 있을까요?
답변 부탁드립니다 ㅠ_ㅠ
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시넌 | 2021.11.05 |
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Q. |
RNA extraction과 RNA 농도 |
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안녕하세요 질문이 있어 글을 씁니다.
우선 저는 cell에서 RNA 추출하는 실험을 했습니다.
현미경 관찰시에 cell 수가 많았음에도 불구하고 chloroform을 넣고 centrifuge를 한 뒤에 pellet이 보이지 않았지만, 추출 후 nanodrop으로 농도를 측정했을때 260/280, 260/230 값도 나오고(purity는 안좋게 나왔긴 합니다) 농도도 측정이 됐습니다.
그런데 real time pcr시에 증폭이 안돼서 agarose gel에 RNA를 내려봤더니 아무 밴드도 뜨지 않았습니다.
그래서 질문은 pellet이 없었던게 RNA가 추출이 안됐던거라면, RNA가 없어도 260/280, 260/230, 농도 값이 나올 수가 있나요? 제가 chloroform을 넣고 voltexing하지 않고 pipetting만 해줬는데 그래서 추출이 잘 안됐을 수도 있는건가요?
답변 달아주시면 정말 감사하겠습니다.
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미묘 | 2021.11.02 |
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Q. |
rt pcr 결과요..!  |
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혹시 knock-out을 시키고 rt pcr을 돌렸을 때 결과가 2번째, 3번째로 나온거면 저 band가 knock out이 되어서 흐리게 보이는 건가요..? 아님 다른 문제가 있는 건가요
죄송합니다 학부생 1학년이라서.,., 해석이 잘 안되네요ㅠㅜ |
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Dobby17 | 2021.10.30 |
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