안녕하세요. 대학 진학을 앞둔 3학년입니다. 마지막 동아리 실험 보고서를 작성 기획중입니다 . 현재 곰팡이와 미생물을 한천 배지에 배양하고 그 위에 항생제 디스크를 올려서 4종의 항생제 중 어느 것이 효과적인지 지름의 길이를 통해 구하는 실험과 항생제 감수성 디스크에 포비든 요오드 용액과 소독용 알콜, 과산화수소수를 농도에 따라 다르게 3종으로 나눠서 소독제의 원리에ㅡ대해서 배운 내용을 적용하여 용액의 농도에 따른 효과를 비교해보는 추가적인 실험을 하려고 합니다. 이때 이러한 디스크들을 얼마나 올려놓아야할까요? 시간 제약이 있는 지라 지속적인 관찰이 불가능하여서 이렇게 질문 드립니다. 관련된 내용을 아셔서 답변해주시면 감사하겠습니다.

안녕하세요. 발효 커피에서 카페인을 추출하는 실험하고 있는 고등학생입니다. 생두를 발효한 후 DCM을 이용해서 카페인을 추출했는데요, 발효한 생두와 발효하지 않은 생두를 비교했을 때 발효한 생두의 카페인 함량이 낮게 나오는 것이 이론적으로도 맞고 실험도 잘 진행이 되었는데 왜 발효를 하면 커피의 카페인 함량이 줄어드는지 모르겠습니다. 왜 발효 커피에서 카페인 함량이 낮게 나오는 것인가요?? 친절한 답변 부탁드립니다ㅜㅜ

시중에서 구입한 유산균 분말의 효능을 알아보고자 디스크 확산법에 활용하기 위해 배양액으로 만들려 합니다.   실험이 먼저 유산균 분말을 생리식염수에 희석하고 mrs 고체 배지에 도말해서 배양시킨 후, 다시 균을 따서 액체 배지에 배양시키고 원심분리 후 상등액만 사용하려는데 방법이 옳은가요? (원심분리는 불필요한가요..?)   고등학생으로서 조사하면서 배우고 있어 꼭 도움 부탁드립니다.틀린 부분이 있으면 집어주시면 감사하겠습니다ㅠㅠ

안녕하세요, 고등학교에서 미생물의 DNA를 추출하는 실험을 진행하고자 해서 관련 자료들을 찾아보았는데, 실험에 쓰이는 Washing buffer 1, 2에 대한 정보를 찾을 수가 없어서 이를 알고 싶어 질문드립니다.

안녕하세요 실험을 준비하고 있는 학생입니다. 아는것이 많이 없어 최대한 조사하면서 공부하고 있는데 많이 막막해서 의견을 여쭤봅니다.. 저희가 시중에 판매하고 있는 유산균(분말, 캡슐 형태)을 활용해서 실제 썩힌 음식에서 채취한 식중독균을 억제할 수 있는지를 실험하고 싶습니다. 원래는 김치와 같은 식품을 쓰려 했는데 그 속에 유산균 말고도 다른 세균이나 등등이 영향을 줄 수 있다고 해서 시중의 최대한 순수한 유산균 가루를 쓰려고 합니다. (음식으로 해도 가능할까요?)   1. mrs 배지에 판매하고 있는 유산균 가루를 멸균수에 희석해서 도말해서 배양 2. 실제로 썩힌 음식을 멸균수에 넣어서 상등액을 일반 배지에 도말해서 배양 그리고 나서 디스크 확산법을 활용해 배양시킨 유산균이 일반 배지의 균을 억제하는지 확인을 하고 싶은데요...방법을 아무리 찾아봐도 정확히 모르겠습니다 ㅠㅠ Q. 1)여기저기 찾아보니까 mrs 배지에 유산균을 배양시키고 원심분리기 를 이용해서 상등액만 사용해라..는 말이 나오는데 액체 mrs 배지를 사용하는건가요..?? 배양액이 액체 상태의 mrs 배지인가요..? 2)배양시킨 유산균을 어떻게 액상으로 해서 식중독균에 실험하는지 잘 모르겠습니다. 3) 무균 상태 대신 알코올 램프로 대신해도 가능한가요? 4) 원심분리기가 없으면 가만히 오랜 시간동안 두고 상등액만 쓰는 건.. 너무 비과학적인 거겠죠?ㅠㅠ 5) 디스크 확산법에서 한 배지에 여러 유산균을 한 번에 여러 디스크로 테스트해도 되나요? 성장 억제 지대가 서로 막 겹치고 그렇진 않죠..?  너무나 기본적인 내용이라 죄송합니다...! 

안녕하세요. 학부연구생입니다. 오늘 클로닝을 하려고 LB배지를 만든 후에 엠피실린을 넣는 과정에서 100ug/ml 넣어야하는데 실수로 200ug/ml을 넣었습니다. 이 배지를 사용해도 괜찮을까요?  LB배지의 총 볼륨은 500ml이었습니다. 엠피실린 stock 농도는 100mg/ml이었습니다.  

아래에 제시된 reference에 따라, Sudan black B를 이용한 PHA생산 균주 스크리닝을 진행했습니다. 첨부한 사진의 결과가 positive인지 몰라서 질문드립니다.  이 결과 positive라고 볼수있을까요? Narayanan, M., Kandasamy, S., Kumarasamy, S., Gnanavel, K., Ranganathan, M., & Kandasamy, G. (2020). Screening of polyhydroxybutyrate producing indigenous bacteria from polluted lake soil. Heliyon, 6(10), e05381.Narayanan, M., Kandasamy, S., Kumarasamy, S., Gnanavel, K., Ranganathan, M., & Kandasamy, G. (2020). Screening of polyhydroxybutyrate producing indigenous bacteria from polluted lake soil. Heliyon, 6(10), e05381.

안녕하세요~ Insoluble beta glucan(from yeast)을 녹여 용액으로 만들어야 하는데, 녹일 수 있는 용매가 있을까요? sigma에서 구매한 beta glucan인데 시약병이나 홈페이지에 녹일 수 있는 용매가 나오지 않아 검색해보아도 확인할 방법이 없었습니다.. Acetonitrile을 사용해서 24시간까지도 교반시켜봤는데, 가루가 녹지 않아서 질문 드리게 되었습니다. HPLC로 beta glucan 찍으실 때 어떻게 준비하시는지 여쭤보고 싶습니다 ㅠㅠ 물어볼 사람이 주변에 없어서 이렇게 질문 남깁니다.. 실험 고수님들 도움 부탁드립니다 !!

안녕하세요 아직 초짜 학부생입니다 50ng/ul 농도의 DNA 1ul를 transformation 시켰는데 항생제가 들어있는 plate에 분주하여 spreading 할때 보통 얼마로 분주하면 될까요…? 저는 10ul를 분주했는데 너무 적게 했다라고 말씀만 해주시고 얼마를 넣어야되는지 알려주시지를 않으셔서요 또한 integration된 primer, copy수가 많은 primer 들이 효율이 좋기때문에 양을 더 적게 분주하는걸로 알고있는데 맞을까요? 공식이라던지 짐작할수 있는 방법이 있으면 알려주실수 있을까요?

특정 유전자를 deletion시킨 e.coli를 comcell로 만들어서 prl27을 transformation시켜서 spreading 하고 있습니다 control에 50람다씩 spreading하면 콜로니가 20-30개 밖에 나오지 않습니다 어쩔때는 한두개밖에 나오지 않아서 효율이 너무 안좋은것같습니다 ㅜㅜ 어떤부분을 바꾸어 봐야 할까요?

안녕하세요 박테리아 상등액을 회수하여  thiocillin물질을 분석하려 고하는데 아래의 solvent에 녹이면 층이 두개로 나뉘더라구요.. 이거 층을 합칠 수 있는 방법이 없을까요? solvent A: 0.1% TFA in water solvent B: 0.1% TFA in acetonitrile

학교 화장실에서 얻은 곰팡이를 LB배지에 접종하며 순수 분리 했고,  이 곰팡이를 LB에서 NaCl, Tryptone, Yeast extract의 양을 다르게한 배지에 배양하면서 비교하고 있습니다.   1. 우선 사진 1,2를 보시고 대강 곰팡이의 종류를 파악하실 수 있다면 알려주시면 감사하겠습니다.(찾기 어렵더라구요../위에는 까만색 포자? 같은 것이 있고 바닥면은 무늬가 있습니다.-곰팡이 배양시 저런 줄무늬?가 흔히 보이던데 저것을 부르는 명칭이 따로 있나요?) 2. 다들 3번째 사진 처럼 자라는데 유독 두 실험군(tryptone 2배, NaCl 2배)에서만 까만색 포자(?)가 생성되지 않고 저렇게 뿌옇게만 자라더라구요. (사진 4 참고해주세요) 학교 선생님께 여쭤보니 곰팡이가 자렇게 자라는 경우도 있다고 하셨는데 같은 곰팡이를 접종했는데 배지 환경에 의해서 저렇게 배양된다고 해석해도 될까요? +다른 실험군도 까만색 포자(맞나요?)아래 뿌옇게 자라나긴 하더군요

전분글리콜산나트륨(sodium starch glycolate) 이라는 원료 미생물시험을 하려는데   KP, USP 에는 일반적으로 10배 희석한다고 되어있어서 10배 희석을 하면, gel 형태가 되어서 계대배양이 어렵더라구요   추가희석과 계면활성제를 추가해야 도말해서 시험결과를 확인이 가능한 정도가 되는데요..   원료에 대한 희석액의 규정? 은 약전중 어느걸 참고해야 하나요   약전에는 제제(Product) 에 대한 검액조제만 나와있고 원료에 대한 규정은 없는거 같아서용 ㅜ    

안녕하세요 석사 1학기 학생입니다 유산균을 이용해서 세포에서 면역관련 실험을 진행하고 있습니다 동물실험까지는 하지 못하고 in vitro 실험까지 마치는 것을 목표로 하고 있는데요 실험실 선배들 보면 FSB, JMB 와 같은 저널에 논문을 내는 걸로 알고 있었는데 그래도 처음 써보는 논문이라 욕심을 조금 내보고 싶어서요 혹시 제가 실험하고 있는 분야에서 낼 수 있는 저널이나, 괜찮은 저널 있으면 알려주실수 있을까요...어떻게 분야를 설정해야할지 감도 잘안오고 IF를 검색해보고 싶은데 기본 정보가 많이 없고 어떤 논문이 괜찮은 건지 잘 모르겠어요... 부탁드립니다!!

균주의 chromosome을 CRISPR-Cas9으로 point mutation 시키려고 합니다. 이전에 유전자 하나를 knockout 시킬 때에는 mutation 후 colony PCR로 1차 스크리닝 후 sequencing을 하여 확인을 하였는데  point mutation의 경우 DNA 크기 차이가 나지 않아, 균주 하나하나를 다 sequencing을 보내야 할 것 같습니다. 이 방법은 너무 비효율적인 것 같아 다른 방법이 있는지 질문드립니다.   이전에 유전자 상에 있는 nucleotide 하나를 mutation 시킬 때에는 유전자 전체를 knockout 시키고, point mutation 시킨 유전자를 다시 knockin 하여 진행하였는데, 이번의 경우는 유전자 상이 아니라 promoter 쪽 부위여서 막 건드릴 수가 없을 것 같습니다 ㅠㅠ

방선균 사진입니다. 어떤종류의 방선균인지 알고 싶습니다.

방균 배양 사진입니다. 어떤종에 방선균인지 알고 싶습니다.  

제가 이번에 차의 발효정도에 따른 Streptococcus mutans 균에 대한 항균효과를 보는 실험을 해보려고 합니다. 아직 이쪽에 지식이 없기에 질문드립니다. 이 때 항균효과를 보는 방법으로 디스크 확산법을 사용하려고 하는데 이 방법이 항균효과를 보기에 적당한지 궁금하고 또 다른 더 쉽게 할 수 있는 방법이 있는지 궁금합니다. 또 디스크 확산법을 할 때 페이퍼 디스크를 꼭 사용해야하는지요. 여과지를 사용했을 때 결과에 큰 영향을 미치는지가 궁금합니다. 요약 1. 천연물의 항균효과를 볼 때 가장 쉽고 확실한 실험법은? 2. 디스크 확산법에서 페이퍼 디스크 대신 여과지를 사용해도 되는지?

디스크 확산법 실행한 사진 입니다. 사진에서 사용한 베지는 LB agar, 대장균용 멸균 배지를 사용했고, 사용한 균주는 E.coli no.2441(대장균의 표준 균주 중 한 종류)를 사용했습니다. 도말법은 스프레딩 도말법을 사용했습니다. 사진은 배양기에 넣고 섭씨 36도로 맞춘후 18시간 경과 후의 모습입니다. 사진을 보면 베지는 울퉁불퉁해지고 군집 형성 또한 이뤄지지 않은 듯 해요. 문제점이 무엇일까요?

안녕하세요 실험 중 이해되지 않는 결과가 있어서 질문드려요...  고수님들의 견해 부탁드립니다ㅠㅠ      실험 과정은 deletion 하고자 하는 gene 앞뒤로 700~800bp 정도를 pcr하여(각각 HR1,2라 명명) plasmid의 cat gene (chloramphenicol 저항 유전자) 앞뒤로 넣어주었습니다. 이후 완성된 plasmid를 electrotransformation 이용해 bacteria에 넣어주었고, chloramphenicol agar에서 selection 하였습니다. 이후 selection 된 colony에서 cat gene이 나오는 것들을 골라서 HR1 부터 HR2까지 PCR하여 band 사이즈를 비교하였습니다. WT에서는 2940 bp가 나타나야하고, mutnat가 되었다면 2091 bp가 나타나야 합니다. 그런데 실험결과 상에서 two band가 뜨는 것이 확인되었고, 이 부분이 이해가지 않아 질문드립니다ㅠㅠ bacteria가 mutant 되지 않고 plasmid를 그냥 가지고 있는 것 일까요? 그렇다면 왜 2,5,6번 모두에서 cat gene은 확인되지만 5,6번 에서만 작은 사이즈의  band가 나오는 것 일까요..? 한 colony에서 mutant와 WT이 섞여 자라고 있는 것 일까요? 결과해설, 실험과정상 문제점에 대해 견해주시면 감사할 것 같습니다ㅠㅠ   + real time PCR로 target gene을 확인해본 결과 deletion 되지 않았음을 확인하였습니다.