안녕하세요 박사과정 준비중인 대학원생입니다. 이번에 Saccharomyces cerevisiae 균주를 활용하여 재조합 단백질 플랫폼 구축을 하고 있습니다. 논문을 찾아보면 대부분 strain이 Y2805를 사용하더라구여..  근데 아무리 찾아도 Y2805를 분양할 곳을 못찾고있는데  혹시 분양 가능한곳 아시는 분들 있을까요?  꼭 Y2805아니더라도 Yeast 발현시스템 고수님들 많은 조언 부탁드립니다... 감사합니다.

우선 간단한 질문을 해서 죄송합니다 ㅜㅜ   정확히 말하면 stock이 아닌 MRS broth 에 자라있는 배양액이 있습니다 이것이 glycerol stock인줄 착각하고 대략 5~6번 정도 녹였다가 다시 얼리며 사용하였는데 아님을 알게되고 얼른 glycerol stock을 만들고자 MRS plate에 subculture를 하려고 합니다 그렇게 colony가 뜨면 다시 broth에 접종하여 stock을 만드려고 합니다! 그런데 도말봉을 사용해서 subculture를 해야하는지 loop를 사용해서 해야하는지 잘 모르겠어서 질문을 올립니다 ㅜㅜ 어떤 방법으로 하든 colony만 얻을 수 있다면 상관 없는 걸까요..? 기초적인 질문이라 죄송합니다 strain은  Lactobacillus plantarum/sakei Leuconostoc mesenteroides/citreum Weissella cibaria Pediococcus pentosaceus 입니다

자연에서 추출한 균주를 동정까지 끝내고 이름은 아는데, 이 효모의 정보(특성)를 찾는게 쉽지않네요. 18가지 효모 이름만 알고 어떤친구들인지 몰라 특성을 찾고 공부하고 싶습니다.(Tremella yokohamensis, Phaeoacremonium scolyti, Kwoniella shandongensis 등을 동정했습니다.) 서적을 찾아보면 효모 종에 대한 설명보다 효모를 이용한 실험법 내용이 대부분이고, 논문도 효모를 이용한 연구내용이 있고 효모에대한 설명은 잘 없는 것 같아 제 서칭실력이 부족한 탓인지 잘 모르겠습니다. 특정 효모 종 정보를 검색하는 방법이 따로 있을까요?

Glucose, Fructose, Sucrose를 이용한 Yeast 알코올 발효 실험을 하였는데, 풍선을 사용해서 발효면적을 측정했거든요. 실험 결과 발효 가스 (풍선) 면적이 Sucrose > Fructose > Glucose 순으로 나타났어요. Sucrose가 가장 발효가스가 많은 이유과 Glucose의 발효가스가 가장 적은 이유는 무엇인지 알 수 있을까요? + 결과가 틀렸다면 무엇이 틀렸는지 자세히 알려주시면 감사하겠습니다 :)

안녕하세요! 배양실험 진행중인 학부생입니다. 다름이 아니라 S.cerevisiae 균주보관 조건에 대해 여쭙고자 합니다! 현재 cfu용 균주를 2일간 일정 시간마다 총 10개정도 sampling해야되는 상황이고,  cfu시에는 10^5, 10^6배 희석해 사용하고 있으며, sampling 후 도말까지 2일정도 걸립니다. 1. 지금은 sampling시에 원액을 냉장보관하고 평판도말 시 serial dilution해 사용하고 있는데, 혹시 sampling할 때 바로 serial dilution해 10^5, 10^6희석 sample을 냉장고에 보관했다가 cfu할 때 꺼내서 사용해도 균체수에 문제가 없을까요? 2. 만약 가능하다면, 지금 보관시에 YMB를 그대로 사용하고 있는데   > YMB를 그대로 / 멸균생리식염수 9 : YMB 1(균주) / 증류수 9 : YMB 1(균주)  = 어떤 조건이 가장 좋을까요? 아니면 다른 최적조건이 있을까요?   바쁘신 와중에 시간 내주셔서 감사합니다! 선배님들의 고견 부탁드립니다 ㅠㅠ

안녕하세요 저는 공부하는 학부생입니다 광학현미경으로 효모를 관찰하는데 표면에 적혈구처럼 움푹파인 형태로 보이던데 혹시 이게 뭔지 아시는 분 있으실까요? bud scar인줄 알았는데 이건 광학현미경으로는 보이지 않는 거라더군요.. 효모에 대해 처음 공부하는 거라 너무 기초적인 질문한 점 양해 부탁드립니다! 아시는 분은 답변해주시면 감사하겠습니다:)

항암제 중 미세소관 저해제(vinblastine)의 기전에 따라 빈블라스틴이 진핵생물과 원핵생물 중 진핵생물에만 효과를 낸다는 가설을 세웠습니다. 원핵생물(황색포도상구균), 진핵생물(효모)에 디스크 확산법을 통해 빈블라스틴을 분주하려 하는데 6mm 디스크 하나당 항암제 농도와 용량을 얼마로 해야할까요? 빈블라스틴의 체표면적당 용량 같은 것들은 찾아보면 나오는데 이런 자료를 환산하여 효모에 투여할 때의 적정 용량과 농도를 구할 수 있나요?   참고로 이 논문을 레퍼런스 했습니다. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC87509/

안녕하세요. 예전에 했던 실험 중에 glucose를 농도별로 했을 때 농도가 올라갈수록 흡광도가 커지다가 일정 농도 이상으로 커졌을 때는 오히려 흡광도가 감소했던 것을 본 적이 있는데 1. glucose의 농도가 커질수록 흡광도가 커지다가 일정 농도에서는 감소되는 이유가 궁금합니다! 2. 이것을 확인하는 실험이 어떤 실험인지 아시나요?

안녕하세요 fungi 중 균사가없는 yeast 종류를 기르고있습니다. Agar plate에 깔아봐도 한 종류의 콜로니들 밖에 없고 암피실린 배지에 넣어서 뿌옇게 자라도 잘 자라는데 16s밴드가 자꾸 뜹니다. Contamination 된것같은데 도대체 왜 이럴까요ㅠㅜpcr할 때 쓰는 물도 확인해봣는데 아닌거같고 .. agar plate에서 single colony를 따서 pcr해도 16s band 와 its band가 둘다 뜹니다....

yeast에 관해 처음 실험하게 되면서 모르는게 투성이라 질문드립니다. SD media에는 auxotrophic marker가 들어가는걸로 알고있습니다. SD에서 크는건 YPD에서는 무조건 colony가 뜬다 라고 선배가 말씀해주는데 무슨 원리로 그런건지 모르겠어서 말씀드립니다. 또한 auxotrophic marker 와 URA blaster 에 관해서도 간략하게 알수있을까요?

안녕하세요~ Insoluble beta glucan(from yeast)을 녹여 용액으로 만들어야 하는데, 녹일 수 있는 용매가 있을까요? sigma에서 구매한 beta glucan인데 시약병이나 홈페이지에 녹일 수 있는 용매가 나오지 않아 검색해보아도 확인할 방법이 없었습니다.. Acetonitrile을 사용해서 24시간까지도 교반시켜봤는데, 가루가 녹지 않아서 질문 드리게 되었습니다. HPLC로 beta glucan 찍으실 때 어떻게 준비하시는지 여쭤보고 싶습니다 ㅠㅠ 물어볼 사람이 주변에 없어서 이렇게 질문 남깁니다.. 실험 고수님들 도움 부탁드립니다 !!

미생분해성 실험용으로 미생물을 하루에 한번씩 배지공급을 하며 키우고있는 미생물의 생균수 확인하려고 샘플을 채취하려하는데 도말할 샘플을 채취할때 배지공급 하기 전에 샘플을 채취하나요? 아님 배지 공급 후 샘플을 채취하나요? 배지 공급 전후 로 콜로니 갯수의 차이가 쫌 나서  어떤 방법이 맞는지 모르겠네요

여러 효모의 비성장속도를 구하기 위해 흡광도를 한시간 마다 측정하여 log값을 취해 그래프를 만들어보았는데요. 기울기 구간을 정하여 추세선으로 비성장속도를 구할 때 효모들 간에 시간 구간이 같아야 하나요? 예를 들어 효모1은 1-3h, 효모 2는 2-4h 처럼 시간 구간이 2시간으로 같아야 하는건가요? 아니면 시간 구간이 다르더라도 Exponential Phase 일 때의 구간으로 기울기를 구하면 되는건가요?

4.5kb band pcr을 진행중인데 band가 전혀 뜨지 않습니다. pcr 조건은 pre-denaturation 95도 2분 denaturation 95도 30초 annealing 은 primer tm 보다 10도정도 낮게 30초  retention time 5분 총 30cycle진행했습니다. pcr을 총 8번 정도 진행하면서, annealing tm, taq pol, dNTP, buffer도 바꿔가면서 진행했고, genomic DNA도 새로 뽑아서 진행해봤습니다. 어디서 가장 큰 문제가 있었을까요? 그리고 추가적으로 primer 농도가 높게 들어가면 결과가 잘 안나올 수 있나요? 

yeast를 제빵에 적용 시 에탄올 생산성은 높을수록 좋은건가요?

안녕하세요   저는 S. cerevisiae에 Cas9을 이용하여 유전자를 재조합하는 연구를 하고 있는 석사과정 학생입니다.   몇달째 이 실험을 계속 하고 있는데 너무 결과가 안나와서 이렇게 질문을 드리게 되었습니다ㅠㅠ   현재 cas9과 gRNA를 plasmid로 TF하고 있고 donor는 fragment로 PCR하여 넣어주고 있는데요, TF는 잘 되고 있는 것 같은데 계속 Wild type만 뜹니다...   선별배지가 잘못된 것 같지는 않은게 control로 Wild type 균주를 배지에 바르면 colony가 뜨지 않더라구요,,,   혹시 저와 같은 경험을 하신 분이 있으실까요??   제발 도와주세요ㅠㅠ