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[우당탕탕 석사 적응기] 석사 1학기 - 새로운 환경, 그리고 후회
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 카테고리: 전체 > Microbiology > Yeast
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Q. glucose 농도별 미생물 성장률
안녕하세요. 예전에 했던 실험 중에 glucose를 농도별로 했을 때 농도가 올라갈수록 흡광도가 커지다가 일정 농도 이상으로 커졌을 때는 오히려 흡광도가 감소했던 것을 본 적이 있는데 1. glucose의 농도가 커질수록 흡광도가 커지다가 일정 농도에서는 감소되는 이유가 궁금합니다! 2. 이것을 확인하는 실험이 어떤 실험인지 아시나요?
회원작성글 꿈꿈2  |  09.24
Q. Bacterial contamination에 관해.. 미생물 고수분들 도와주세요ㅜㅜ
안녕하세요 fungi 중 균사가없는 yeast 종류를 기르고있습니다. Agar plate에 깔아봐도 한 종류의 콜로니들 밖에 없고 암피실린 배지에 넣어서 뿌옇게 자라도 잘 자라는데 16s밴드가 자꾸 뜹니다. Contamination 된것같은데 도대체 왜 이럴까요ㅠㅜpcr할 때 쓰는 물도 확인해봣는데 아닌거같고 .. agar plate에서 single colony를 따서 pcr해도 16s band 와 its band가 둘다 뜹니다....
회원작성글 소몽소몽  |  09.08
Q. SD , YPD media 질문드립니다
yeast에 관해 처음 실험하게 되면서 모르는게 투성이라 질문드립니다. SD media에는 auxotrophic marker가 들어가는걸로 알고있습니다. SD에서 크는건 YPD에서는 무조건 colony가 뜬다 라고 선배가 말씀해주는데 무슨 원리로 그런건지 모르겠어서 말씀드립니다. 또한 auxotrophic marker 와 URA blaster 에 관해서도 간략하게 알수있을까요?
회원작성글 오도도도돕  |  08.30
Q. Insoluble beta glucan 녹이는 방법 여쭤봅니당
안녕하세요~ Insoluble beta glucan(from yeast)을 녹여 용액으로 만들어야 하는데, 녹일 수 있는 용매가 있을까요? sigma에서 구매한 beta glucan인데 시약병이나 홈페이지에 녹일 수 있는 용매가 나오지 않아 검색해보아도 확인할 방법이 없었습니다.. Acetonitrile을 사용해서 24시간까지도 교반시켜봤는데, 가루가 녹지 않아서 질문 드리게 되었습니다. HPLC로 beta glucan 찍으실 때 어떻게 준비하시는지 여쭤보고 싶습니다 ㅠㅠ 물어볼 사람이 주변에 없어서 이렇게 질문 남깁니다.. 실험 고수님들 도움 부탁드립니다 !!
회원작성글 Aesop0224  |  07.29
Q. 평판배양법 생균수측정 샘플채취 질문입니다.
미생분해성 실험용으로 미생물을 하루에 한번씩 배지공급을 하며 키우고있는 미생물의 생균수 확인하려고 샘플을 채취하려하는데 도말할 샘플을 채취할때 배지공급 하기 전에 샘플을 채취하나요? 아님 배지 공급 후 샘플을 채취하나요? 배지 공급 전후 로 콜로니 갯수의 차이가 쫌 나서  어떤 방법이 맞는지 모르겠네요
회원작성글 mham  |  07.20
Q. 비성장속도
여러 효모의 비성장속도를 구하기 위해 흡광도를 한시간 마다 측정하여 log값을 취해 그래프를 만들어보았는데요. 기울기 구간을 정하여 추세선으로 비성장속도를 구할 때 효모들 간에 시간 구간이 같아야 하나요? 예를 들어 효모1은 1-3h, 효모 2는 2-4h 처럼 시간 구간이 2시간으로 같아야 하는건가요? 아니면 시간 구간이 다르더라도 Exponential Phase 일 때의 구간으로 기울기를 구하면 되는건가요?
회원작성글 너랑나랑  |  07.19
Q. pcr 관련 질문드립니다
4.5kb band pcr을 진행중인데 band가 전혀 뜨지 않습니다. pcr 조건은 pre-denaturation 95도 2분 denaturation 95도 30초 annealing 은 primer tm 보다 10도정도 낮게 30초  retention time 5분 총 30cycle진행했습니다. pcr을 총 8번 정도 진행하면서, annealing tm, taq pol, dNTP, buffer도 바꿔가면서 진행했고, genomic DNA도 새로 뽑아서 진행해봤습니다. 어디서 가장 큰 문제가 있었을까요? 그리고 추가적으로 primer 농도가 높게 들어가면 결과가 잘 안나올 수 있나요? 
회원작성글 ssonsson  |  06.24
Q. 에탄올 생산성
yeast를 제빵에 적용 시 에탄올 생산성은 높을수록 좋은건가요?
회원작성글 너랑나랑  |  06.21
Q. yeast cas9
안녕하세요   저는 S. cerevisiae에 Cas9을 이용하여 유전자를 재조합하는 연구를 하고 있는 석사과정 학생입니다.   몇달째 이 실험을 계속 하고 있는데 너무 결과가 안나와서 이렇게 질문을 드리게 되었습니다ㅠㅠ   현재 cas9과 gRNA를 plasmid로 TF하고 있고 donor는 fragment로 PCR하여 넣어주고 있는데요, TF는 잘 되고 있는 것 같은데 계속 Wild type만 뜹니다...   선별배지가 잘못된 것 같지는 않은게 control로 Wild type 균주를 배지에 바르면 colony가 뜨지 않더라구요,,,   혹시 저와 같은 경험을 하신 분이 있으실까요??   제발 도와주세요ㅠㅠ
회원작성글 yeasthm  |  06.09
Q. 알코올 발효 실험 - 포도당
생효모와 끓인 효모을 이용하여 포도당의 알코올 발효 실험을 진행하였습니다. 풍선과 파라필름으로 입구를 밀봉하였고,  페놀프탈레인 용액과 수산화칼륨 용액을 사용하여 색 변화를 관찰하였습니다. 그런데 두 과정 모두 색이 무색으로 변화하였습니다.. 끓인 효모에서도 변화가 일어날 수 있는건가요..? 아님 실험과정에서 오염이 있었던 건가요.. (실온에서 하루 정도 두고 변화를 관찰했습니다)
회원작성글 기초생명정보  |  05.06
Q. yeast가 자라지 않습니다.
안녕하세요? Yeast two hybrid 실험을 위해 Yeast를 배양하고자 합니다. 계속 사용해왔던 AH109 Yeast strain glycerol stock으로 YPD media와 plate에 각각 모두 키워보았지만 자라지 않아서 질문드립니다. 1. BD biosciences Cat# 630410로 만든 YPD agar plate에 (70 g/1 L (Autoclave 121'C 15 min)) AH109 strain glycerol stock을 백금이로 YPD agar plate에 streaking 한 후 30'C incubator에서 incubation 하였습니다 (2~3일).   2. BD biosciences Cat# 630409로 만든 YPD media에 (50 g/1 L (Autoclave 121'C 15 min)) AH109 strain glycerol stock을 3 ml YPD media에 넣은 후 30'C shaker에서 incubation 하였습니다. (2~3일)   무엇이 문제일까요..ㅠ 문제점이 있다면 답변해주시면 감사하겠습니다..  
회원작성글 hb17  |  04.27
Q. candida etchellsii 최적 배양조건
안녕하세요. 제가 지금 candida etchellsii 균을 배양하고 있습니다. PDB에서 약 5일 정도 배양 후 PDA에 streaking하여 3~7일 배양을 하는데, 예상보가 낮은 log 수를 보여서 최적의 배양 조건을 찾고자 합니다. PDB에 nacl을 첨가하여 25도에서 배양을 하려고 하는데, 최적의 배양조건을 알고 계신다면 도움주시면 감사하겠습니다.
회원작성글 내꺼야곰팡이  |  04.26
Q. LB 배지가 갈변이 됩니다.
바실러스 항균성 실험을 하는데 왼쪽 사진처럼 배지가 갈변이 됩니다. 이유를 알 수 있을까요? 갈변이 된 부분은 항균성이 나타나지 않았다고 봐야 하나요? 그리고 오른쪽 사진처럼 뿌옇게 될 때도 있는데 이것 또한 항균성이 나타났다고 해도 되는지 궁금합니다. 그리고 왜 뿌옇게 됐는지도 궁금합니다! 감사합니다
회원작성글 산자  |  04.11
Q. 효모 배양 후 왜 48시간 후 관찰하나요?
미생물의 배지 접종과 관련해서 실험하던 중, 궁금한 점이 생겨 질문드립니다. BCP 배지에서의 유산균의 배양 실험에서, 유산균을 배지에 접종한 후 하루 후 관찰 한 것과 달리,  YM 배지에서의 효모 배양 실험에서, 효모를 배지에 접종 한 후 이틀 후 관찰 하였습니다.  왜 효모는 유산균 배양과 달리 하루 더 배양기간을 갖는지 알 수 있을까요?  구글에 많이 찾아 보았지만, 영어에 서툴러서인지 관련 내용을 찾기 힘들더라고요... 관련 내용이 담긴 링크만이라도 알려주셔도 감사하겠습니다. 
회원작성글 alfo4745  |  04.04
Q. 농도 비율
40%로 만든 용액이 150ml 사용되었을 때 농도 비율을 60%로 바꾸면 몇 ml 사용되나요?
회원작성글 너랑나랑  |  03.27
Q. 논문관련 유기산 첨부파일
팽이버섯의Listeria monocytogenes의 온도별 생존과 유기산에 의한 저감화효과를 알아보는 논문인데요... 사용균주에 대한 설명입니다..  여기서 말하는 rifampicin 이 항생제를 말하는게 맞을까요? 균주를 5개를 사용하였다고했는데.. 균주를 Tryptic Soy Agar 배지와 tryptic soy broth 배지에 접종한 이유가 뭘까요?  TSB-YER배지인거 같은데 이건 다른 배지인가요? 그리고 마지막에 PBS라는 생리심염수에 재현탁한 이유는 뭘까요..   미생물관련 논문을 많이 접해보지못해서 재료랑 방법이 너무 어렵습니다.. 전체적인 논문 해석이 너무 여려운 대학원생입니다... 한번만 도와주세요 ㅠ0ㅠ     L. monocytogenes 사용균주 팽이버섯에서 L. monotytogenes의 생존을 조사하기 위하 여 팽이버섯에서 분리된 L. monocytogenes 5균주를 사용 하였다. 시료 중 존재하는 background microflora의 생육 을 억제하고 팽이버섯에 존재하는 미생물과 구분하기 위 하여 본 연구에 사용할 L. monotytogenes에 rifampicin 저 항성을 유도하였다. Rifampicin 저항성 유도는 0.6% yeast extract가 함유된 tryptic soy agar (TSA-YE; Oxoid, Basingstoke, Hampshire, England)상에서 배양한 각 균주를 1 loop 취하여 50 µL/mL의 rifampicin (R; Biosesang, Sungnam, Korea)과 0.6% yeast extract가 함유된 tryptic soy broth (TSB-YER, Oxoid, England)에 접종하고 37o C에 서 24시간 진탕 배양하였다. 이후 50 µL/mL의 rifampicin 과 0.6% yeast extract가 함유된 tryptic soy agar (TSAYER; Oxoid, England)에 접종하고 37o C에서 24시간 배양 하여 rifampicin 저항성 균주를 얻었다. Rifampicin 저항성 균주는 20% glycerol을 함유하는 TSB-YER를 사용하여 - 70o C에서 보관하였다. 사용 시에는 상온에서 해동한 후 각 각 10 µL를 취하여 7 mL의 TSB-YER에 접종 후 30o C에 서 18시간 동안 배양하였다. 배양된 균은 각각 4,500 rpm 에서 15분간 원심분리 한 후 상등액을 제거하고 phosphate buffered saline (PBS; Difco Laboratories, Detroit, MI, USA)에 현탁하였다. 이후 4,500 rpm에서 15분간 원심분 리 한 후 시험균을 PBS에 재 현탁하였다. 이후 5균주를 동량 혼합하고 생균수가 6 log CFU/mL가 되도록 희석하 여 본 연구에 사용하였다.    
회원작성글 희건루  |  03.23
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