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BioLab 최정욱 교수
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 카테고리: 전체 > Microbiology > Fungi
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질문/투표/프로토콜 등록
Q. log/CFU/cm2 단위에 대한 질문입니다.
논문을 읽던 중 단위에 대해서 궁금한게 생겨서 질문합니다!! log/CFU/cm2 단위에 대한 질문입니다.   논문 내용을 간략히 정리해보자면 A. ochraceus를 저감화 시키기 위한 물리적 제어기술인 열수 침지, UV-C, LED를 단일 처리하는 내용입니다.   균액을 제조하여 스테인리스 칩 표면에 균을 접종시키고 이후 단일처리를 통해 얼마나 감소하였는지 알아보는 논문인데,, 이때 스테인리스 칩은 가로 세로 10cm이며  균액은 25도에서 배양된 단일 콜로니를 채취하여 0.03% tween 80 용액에 현탁합니다. 이때 균액의 초기 농도는 10^(6~8) CFU/mL이다. 이 균액을 1ml 따서 아까의 스테인리스 칩에 접종을 하고 각각의 단일처리를 진행합니다. 이후 스테인레스 칩에 1ml PBS를 분주하고 spl로 긁어낸 후 여기서 1ml를 따서 10배씩 희석한후 PDA 배지에 배양합니다 이때 생기는 콜로니를 계수하여 1cm2당 CFU로 나타낸다고 합니다. 근데 가로 세로 10cm인 스테일리스 칩에서 나온 균액을 배양하여 나온 CFU 값은데 왜 1cm2 당 CFU로 나타내나요?? 100cm2로 해야하는 것 아닌가요.. ㅜ 아니면 저렇게 설정한 이유가 콜로니를  계수하고 그 면적에서 1/10을 한 것인가요??  
회원작성글 명숙김  |  05.19
Q. 고압멸균기 문제,,
배지를 만들기 위해 고압멸균기를 121도 15분으로 설정하고 돌리는데, 특정온도에서 더이상 온도가 올라가지 않는데,,, 이건 무슨 문제인가요,,,? 그리고 offset 온도? 이건 몇도로 맞춰나야하나요??
회원작성글 라라요  |  05.18
Q. rpb2, tef 서열 NCBI 넘버 등록 방법
제목과 동일하게, RPB2서열과 TEF서열을 NCBI에 등록하여 accession number를 받고싶습니다.  rpb2의 경우 다른 서열정보를 보니 cds정보도 함께 등록되어있던데 전체 서열을 그냥 등록해서 rpb2 cds라 등록하면되는건가요,,? 전체를 등록한 사람도 있고 분석을 해서 등록한 사람도 있더라구요....   ITS경우는 GENEBANK에서 등록했는데 두 서열은 GENEBANK인지 BANKIT에 등록해야하는지부터 헷갈립니다... 그리고 submission type에서 어던걸 선택해야하는지 모르겠습니다 잘 아시는분이 계시다면 등록과정에서 세부적인 선택사항까지 알려주시면 정말 감사하겠습니다... 
회원작성글 수수한수달  |  05.17
Q. 3차원 그래프 해석해주세요 ㅠㅠ 첨부파일
학부연구생입니다,, 국문 논문을 읽고 있는데 제가 이해를 잘 못하는건지 그냥 바보인건지,, 도움이 필요합니다 1. 이 그래프를 해석할 수 있나요?? (((UV : 9, 18, 54, 90, 180, and 360 kJ/m^2 선량 (30 초,1, 3, 5, 10, 20 분) 참고로 저 그래프는 열수처리 후 UV 처리를 진행하여 (복합처리) 미생물의 저감화를 확인할 수 있는 그래프입니다.))) 논문을 읽던 중 " 처리의 상승 효과는 60도에서 3분 침지 후 UV를 5분간 조사하였을 때, 검출한계 이 하 에서 균이 검출 되지 않았다(검출한계 10 CFU 이하). 이 조건에서 초기 접종균이 모두 사멸하여 최종적으로 5.76 log 감소하였다." 라고 나와있는데,,, 이 그래프를 통해서 알 수 있는 것인지 궁금합니다,,, ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ
회원작성글 명숙김  |  05.14
Q. 곰팡이 발효기(bioreactor) 배양 중 항생제 처리
안녕하세요 흔한 대학원생입니다.. 제가 fungi배양 실험 중인데 pre-culture에서 batch-cluture로 넘어가는 중에 자꾸 오염이 됩니다.. 현미경으로 확인 해보니 간균형태의 운동성을 보이고 배양액을 LB agar plate에 streaking 한 후 살펴보니 미색을 띠는게 bacillus속의 균인 것으로 추정됩니다. 그래서 batch scale에서 배지에 항생제를 처리하여 배양해보려합니다. 주로 cell-culture에서 항생제를 사용하는 것으로 알고있는데 fungi에도 적용가능한지, 타겟물질이나 생육에 문제가 되는 부분이 있을지 질문드립니다..ㅠㅠ 항생제는 gentamicin sulfate가 bacillus 속에 효과가 좋다는 논문을 확인하여 구매 후 사용 예정입니다. 
회원작성글 DACPI  |  05.11
Q. YEME agar에서 발견된 곰팡이들입니다. 이 균주에 대해 아시는 분 있으실까요?
    3가지 균주입니다. 배지에 우연찮게 발견되었는데 rare한 morphology를 가지고 있어 30도 incubator에 재미삼아 키워봤네요!   처음에는 푸른 색이었는데 나중에는 배지 전체를 검게 만든 후 화산 모양을 한 균주, 검은 분화구 느낌의 한 균주, 하나는 흰색 곰팡이같아요!   어떤 균주인지 아시는 분 있으신가요?
회원작성글 제약생명공학과  |  04.10
Q. Aspergillus oryzae의 spore 관련 문의
Aspergillus oryzae를 PDA에 배양 중인데 동일 spore를 도말해도 어떤 플레이트에는 spore가 생기고 어떤 플레이트는 Spore가 생기지 않네요.   이유를 아시는 분 계실까요?
회원작성글 kasaha  |  02.23
Q. 느타리 버섯의 종균을 배양하고자 합니다
PDA 배지를 사용하려 하는데 일반 PDA 배지가 아닌 주석산으로 pH3.5 처리를 한 PDA 배지를 사용해도 될까요?
회원작성글 이준호1  |  02.10
Q. 푸른곰팡이 배양 및 streaking 질문입니다
제가 푸른곰팡이를 배양하려 하는데 귤껍질이나 상한 음식에서 푸른곰팡이가 자라나면 포자를 루프로 때어내서 바로 배지에다가 접종시기면 될까요..?
회원작성글 란울  |  02.03
Q. TLC 질문 드립니다.
TLC관련 질문 드립니다. 왼쪽은 쿠마린 이라는 스탠다드 물질의 농도를 잡기 위해 실험한것으로 0.2,0.02,0.002g/ml입니다. 오른쪽은 양쪽이 스탠다드이고 중간에 세개의 spot은 곰팡이의 배양액입니다. 배양액이다 보니 탄소원이 들어있어서 파란색으로 나온것인지 아니면 아예 다른물질들이 들어있어서 파란색으로 나온것인지는 잘 모르겠으나 실험 결과 상 쿠마린 스탠다드와 동일한 위치에 밴드가 없는 것으로 보아 이 배양 액에 쿠마린이 없는 것으로 판단해야 될지 모르겠습니다. 추가적으로 배양액 sample들이 전개 되지 않은것이 이동상이 잘못되어서 인지 아니면 sample에서 많은 물질들이 추출되어서 인지 잘 모르겠습니다.
회원작성글 김소현이다  |  02.01
Q. TLC관련 문의!! 부탁드려요
두 곰팡이를 co-culture 한 배양액중에 tannic acid가 생성되었는지 확인하기 위한 목적으로 TLC실험을 진행하였습니다. 우선 tannic acid의 분자량은 1,701.19g/mol입니다. 아세톤으로 추출을 진행하였으며 농축한뒤 첫번째 이동상(CH3 Cl: ethyl acetate: formic acid=5:4:1)으로 tlc를 내려보았더니 거의 전개가 되지 않은것을 볼수있었다.그래서 이동상을 바꾸어 보았다.                             두번째 이동상은 에틸 아세테이트: 포름산: 아세톤: DW= 100: 11: 11: 27를 이용하였으며 그 결과 이전보다는 전개가 되었지만 실리카겔의 위쪽까지 전개되지는 않았다. 맨 왼쪽은 dw에 희석한 standard tannic acid이고 맨 오른쪽은 acetone에 희석한 tannic acid 이다. 질문사항은 1. 두개의 standard 중 어떤 용매에 희석한 standard가 더 적합한지?  2.sample이 전개되지 않은 이유가 이동상이 적합하지 않아서 인지, 분자량이 커서 인지 아니면 제가 따로 정제 과정을 거치지 않았기 때문인지 궁금합니다. 3.스탠다드와 샘플이 다른 속도로 전개된 이유에 대해서도 궁금합니다 4. 스탠다드의 농도 설정을 어떻게 해야될지  궁금합니다.
회원작성글 김소현이다  |  01.30
Q. 버섯 액체배양
안녕하세요   포자현탁이 안되는 느타리 버섯을 plate 배양해서 이번에 liquid 로 넘어가려고 하는데 잘 자라지가 않아서 말씀드립니다 ㅠㅠ 제가 액체배양으로 접종을 plate에서 일정 직경으로 잘라 flask에 접종을 하는데 혹시 접종 방법이 잘 못 된 것일까요 ?  
회원작성글 으리으링  |  01.10
Q. 항진균 시험 관련 질문
안녕하세요 연구소에서 근무중인 신입입니다. 항진균 시험 관련해서 프로토콜을 만들고 있는데 참고한 프로토콜이 균이나 물질량을 너무 많이 필요로 하다고 판단되서 전체적인 양을 줄이려고 합니다. 희석 중화법 시험이구요 간섭물질 1ml + 균주 1ml + 멸균수 8ml -> 균주반응액 1ml +시험물질 9ml -> 반응액 1ml +중화제 8ml +멸균수 1ml -> 중화반응액 1ml 배지도말 위의 과정을  간섭물질 0.1ml + 균주 0.1ml + 멸균수 0.8ml -> 균주반응액 0.1ml +시험물질 0.9ml -> 반응액 0.1ml +중화제 0.8ml +멸균수 0.1ml -> 중화반응액 0.1ml 배지도말 로 변경하고자 하는데 위와 같은 방법이 시험 결과에 영향을 줄 수 있을까요? 균주에 따라 제 피펫팅에 따라 결과가 달라질 순 있겠지만 균주 반응액 부터는 3반복으로 진행할 예정이고 배양도 추가 3반복을 할 예정입니다. 
회원작성글 다테  |  01.04
Q. 진균 계수를 현미경 없이 할 수 있는 방법이 있나요?
제목 그대로입니다. 원래 미생물 배양을 하던 곳이 아니라 현미경이나 hamocytomater 등 장비가 없이 균수를 계수해야 합니다. (spectrophotometer만 보유) 진탕배양기도 없어서 고체배지로만 배양이 가능할 것 같구요. 사용 균주가 Aspergillus 쪽이라 배양을 하는 것은 상관이 없는데 원하는 데이터는 log로 감소 수치를 내야 하는데 정확한 계수 없이 배양이 완료된 고체배지의 곰팡이를 무슨 수로 계수하라는 건지는 모르겠고 저의 한없이 짧은 지식으로는 불가능 한것 같은데 방법이 있을까요? 추가로 곰팡이를 colny couting으로 계수하는 것이 과연 정확하다고 할 수 있나요?
회원작성글 다테  |  2022.12.21
Q. 음료수 미생물 증식 실험 질문
개봉한지 며칠된 음료수에서 자란 미생물을 확인하고 싶은데, 배지에 그냥 음료수를 도말하여 배양하면될까요??
회원작성글 라라요  |  2022.11.28
Q. 발효식품에 존재하는 미생물 동정
발효식품에 Rhizopus, Aspergillus, bacillus균을 실제로 존재하는지 확인해야 합니다. 제품1. 바실러스+리조퍼스+대두 제품2. 리조퍼스+대두 제품3. 아스퍼길러스+대두 해당균을 배양해서 미생물동정은 의뢰할생각입지. 플레이트에 배양된 상태로 의뢰하라고 하는데.. 어떻게 전처리를 해야될지 잘 모르겠습니다. 단순히 백금이로 식품표면을 긁어서 pda배지에 도말해서 배양하면 되는지요? 아니면 멸균수에 희석해서 도말을 해야되는지..배양기의 온도도 궁금합니다. 혹시 곰팡이는 현미경이나 집락의 형태만으로 동정을 하기도 하나요? 고수님들 답변 부탁드리겠습니다 .감사합니다.
회원작성글 솔리드  |  2022.11.22
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