화학농약이나 화학비료를 대체하기 위해 자연에 존재하는 유용 미생물이 일부 쓰이고 있지만, 대다수 미생물은 배양이 안 되고 있어 환경으로부터 유용 미생물 자원을 획득하는 것은 매우 어렵습니다. 이를 극복하기 위해, 본 연구에서는 식물 근권 토양 내 난배양성 수혜자(Beneficiary) 세균과 공생 상호작용하는 도우미(Helper) 세균의 공생 상호작용을 탐구하였습니다. 토마토 근권 토양에서 도우미 Pseudomonas putida H3가 생산하는 숙신산이 난배양성 수혜자 Niallia sp. RD1의 생장과 complex II 의존적 세포 호흡으로 에너지 생성을 보조하는 것을 확인하였습니다. 두 세균 간 공생 상호작용은 토마토 풋마름병 발병을 억제할 뿐 아니라 토마토 생육도 촉진하였습니다. 본 연구 결과는 식물 근권 미생물 군집에서 난배양성 수혜자와 도우미 미생물 사이의 에너지 요구성(Energy auxotrophy)이 중요하다는 것을 새롭게 밝혀냈습니다. 이는 다양한 자연 환경에서 미생물 상호의존 과정과 세균의 난배양성에 대한 새로운 통찰력을 제공할 것으로 사료됩니다.