이충원(서울대학교) | 공간 후성전사체 분석을 통한 삼중음성유방암 미세환경상의 암 줄기세포 연구 [Nat. Commun. ] | 웨비나

학술웨비나 개최완료

공간 후성전사체 분석을 통한 삼중음성유방암 미세환경상의 암 줄기세포 연구 [Nat. Commun. ]

조회1251

2022년 08월 02일 (화) 오전 10시
이충원(서울대학교)
Spatial epitranscriptomics reveals A-to-I editome specific to cancer stem cell microniches

Nat. Commun., 2022 May 9;13(1):2540 | https://doi.org/10.1038/s41467-022-30299-3

개요

							단일 염기 RNA 편집과 같은 Epitranscriptomic (후성전사체) 기능은 암의 전사 다양성의 원천이지만 종양 미세 환경에서의 공간적 맥락 측면에서 거의 이해되지 않습니다. 여기에서 우리는 면역형광 염색 조직에서 관심 영역을 분리하고 transcriptomics 및 epitranscriptomics 데이터를 얻는 시퀀싱(Select-seq)으로 transcriptomics에 수렴된 공간 정보가 연결된 epitranscriptomics를 소개합니다. Select-seq를 사용하여 삼중 음성 유방암 환자의 종양 미세 환경과 관련하여 암 줄기 세포 유사 미세환경을 분석합니다. 우리는 alternative splicing 변이체를 식별하고, 침윤 T 세포 및 B 세포의 수용체 서열 분석을 수행하고, 종양 조직 섹션에서 아데노신-이노신 염기 편집을 분석하였습니다. 특히, 삼중음성 유방암 미세환경에서 상이한 암 줄기세포 그룹에 특이적인 아데노신-이노신 에디톰을 소개합니다.