노희진(Harvard University) | 이중가닥 DNA deaminase 를 활용한 표적 chromatin accessibility 분석과 CRISPR scanning과의 결합 [Nat. Methods] | 웨비나

학술웨비나 개최완료

이중가닥 DNA deaminase 를 활용한 표적 chromatin accessibility 분석과 CRISPR scanning과의 결합 [Nat. Methods]

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2025년 11월 03일 (월) 오전 11시
노희진(Harvard University)

개요

							유전체 편집은 cis-regulatory elements의 서열-기능 분석을 가능하게 하지만, 기존의 long-read sequencing 기반 방법으로는 단일 염색질 가닥에서 유전체 변형과 chromatin accessibility를 직접 연결하기 어려웠다. 이에 우리는 이중가닥 DNA cytidine deaminase를 활용해 표적화된 PCR과 long-read sequencing으로 특정 위치의 chromatin accessibility를 정밀하게 측정하는 TDAC-seq을 개발하였다. TDAC-seq은 CRISPR 편집과 결합하여 동일한 염색질 가닥에서 단일 염기 해상도로 유전적 변이와 chromatin accessibility 변화를 동시에 분석할 수 있다. 이를 통해 우리는 fetal hemoglobin 활성화 과정에서의 chromatin accessibility 변화를 규명했으며, 더 나아가 글로빈과 GFI1B enhancer에 대한 CRISPR mutational scanning과 TDAC-seq을 결합하여 다양한 유전적 변이가 chromatin accessibility에 미치는 영향을 체계적으로 분석하였다.