유전자 발현과 DNA 복제·복구를 조절하는 단백질의 기능을 이해하려면, DNA에 결합하는지뿐 아니라 긴 DNA의 어느 위치에 결합하는지를 아는 것이 중요합니다. 결합 위치를 직접 관찰하면 분자마다 다른 단백질 분포와 DNA 구조를 함께 이해할 수 있지만, 기존 단일분자 이미징 기술은 넓은 관찰 범위와 높은 공간 해상도, 빠른 분석을 동시에 확보하기 어렵습니다. 본 연구에서는 주사전자현미경(scanning electron microscopy, SEM)을 이용해 길게 펼친 DNA와 그 위의 단백질 신호를 함께 관찰하고, DNA 윤곽을 따라 결합 위치를 정량적으로 읽어내는 단일분자 매핑 기술을 개발하였습니다. 이 기술은 다양한 DNA와 단백질 결합 형태에 적용되었으며, 형광현미경보다 높은 위치 판독 정확도를 보였습니다. 또한 넓은 영역에서 DNA 분자를 탐색하면서 개별 단백질 신호를 높은 공간 해상도로 관찰할 수 있었습니다. 이를 통해 SEM은 DNA의 형태를 보여주는 현미경을 넘어, 긴 DNA 위 단백질의 위치와 분자별 차이를 직접 읽는 분석 도구가 될 수 있음을 보여주었습니다.