미세조류는 지구 산소 생산량의 약 50%를 담당하는 핵심 생물군으로, 자연환경에서 이들의 주변에는 고유한 세균 군집이 형성된다. 이러한 공생 세균은 숙주의 성장과 생리에 중요한 영향을 미치는 것으로 알려져 있다. 그러나 유독 저서 와편모조류에서 특정 세균이 숙주 증식에 실제로 기여하는지에 대한 실험적 근거는 여전히 부족하다. 본 연구는 유해 와편모조류 Prorocentrum lima를 모델로, 여러 균주에 걸쳐 안정적으로 유지되는 핵심 마이크로바이옴을 규명하고, 이들이 숙주 성장에 미치는 기능적 역할을 실험적으로 검증하였다. 마이크로바이옴 이식 및 공배양 실험을 통해 핵심 세균이 숙주 성장을 유의미하게 촉진하며, 이 효과가 숙주 특이적임을 확인하였다. 특히 미량금속 제한 환경에서만 성장 촉진이 관찰되었고, 유전체 및 기능적 검증을 통해 해당 세균이 비정형 철 획득 전략을 보유함을 밝혔다. 본 연구는 독소 생산 와편모조류와 공생 세균 간의 생태학적 상호작용에 대한 새로운 실험적 증거를 제공하며, 마이크로바이옴 기반의 유해조류 모니터링 및 관리 전략 수립에 기여할 수 있음을 시사한다.