표적 단백질 분해(Targeted Protein Degradation, TPD)는 질병 관련 단백질의 활성을 억제하는 기존 저해제 전략을 넘어, 세포 내 유비퀴틴-프로테아좀 시스템을 이용해 표적 단백질 자체를 제거하는 차세대 신약개발 기술입니다. 그러나 현재까지 대부분의 PROTAC은 CRBN, VHL 등 전신적으로 넓게 발현되는 E3 ligase에 의존하고 있어 조직 선택성 확보에 한계가 있었습니다. 본 세미나에서는 근육 세포에서 특이적으로 높게 발현되는 E3 ligase인 KLHL41에 결합하는 신규 리간드를 발굴하고, 이를 활용하여 근육 선택적 단백질 분해 가능성을 제시한 연구를 소개하고자 합니다. 또한 조직 특이적 E3 ligase 발굴과 이를 기반으로 한 차세대 PROTAC 플랫폼의 가능성, 그리고 향후 근육 질환 치료 전략으로의 확장 방향에 대해 논의하겠습니다.